SurvivalMeth數(shù)據(jù)。廣泛研究表明，DNA甲基化相關(guān)功能元件（DMFE），如CpG島相關(guān)元件（CIR）、轉(zhuǎn)錄相關(guān)元件（TR）、重復(fù)元件（RE）及細胞類型特異性CTCF結(jié)合區(qū)（CTCFBR）和超級增強子（SE）等，可作為腫瘤患者生存預(yù)后的潛在標志物。SurvivalMeth數(shù)據(jù)庫收集來自TCGA、CCLE和GEO等數(shù)據(jù)庫中36個腫瘤的13371個樣本中81個DNA甲基化圖譜數(shù)據(jù)，涵蓋19000個編碼基因、1689653個超級增強子、1304902個CTCFBR和77634個重復(fù)元件，總計超過480000個DNA甲基化位點信息，構(gòu)建比例風險回歸模型，提供感興趣基因及甲基化相關(guān)功能元件的預(yù)后分析功能，用戶可以進行自定基因或甲基化功能元件組合，借助SurvivalMeth數(shù)據(jù)庫完成預(yù)后相關(guān)DMFEs的全面分析，包括DMFE甲基化水平、相關(guān)分析、臨床分析、差異分析、DMFE注釋及生存分析與可視化等。

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總結(jié)

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