生物醫(yī)學(xué)圖片處理——怎樣才算不當(dāng)操作?

在2021年撤稿觀察（Retraction Watch）數(shù)據(jù)庫(kù)中列出的近4000起撤稿事件中，超過(guò)四分之一涉及“ “concerns/issues about image（對(duì)圖片的關(guān)注/圖片問(wèn)題）” 或“duplication of image（圖片復(fù)制）”。同樣，最近的一項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)，PubPeer上的12萬(wàn)多條評(píng)論中，有三分之二都涉及對(duì)圖片的關(guān)注。不當(dāng)操作的范圍從無(wú)辜的錯(cuò)誤（innocent errors）到美化（beautification）到故意偽造（intentional falsification）。因此，現(xiàn)在許多期刊使用專門(mén)的圖片篩選器來(lái)尋找不當(dāng)操作也就不足為奇了。

在這篇博客中討論了當(dāng)前處理生物醫(yī)學(xué)圖片的指導(dǎo)方針，并提出了圖片處理程度的獨(dú)到見(jiàn)解。

數(shù)字圖片應(yīng)該進(jìn)行最小程度的處理

這條準(zhǔn)則是圖片處理的基石——圖像數(shù)據(jù)也是數(shù)據(jù)，應(yīng)該被當(dāng)作數(shù)據(jù)來(lái)對(duì)待。改變圖片數(shù)據(jù)被認(rèn)為是不可接受的，但許多人認(rèn)為清理圖像數(shù)據(jù)是可以的。一般來(lái)說(shuō)，“這樣做的目的不是為了欺騙”，而是為了簡(jiǎn)化數(shù)據(jù)，讓讀者更容易理解。

清理圖片數(shù)據(jù)的背景（Clean up background）

在這個(gè)例子中，Clancy博士使用圖片編輯軟件刪除了數(shù)據(jù)。雖然像這樣清理數(shù)據(jù)可能不會(huì)影響整體的解釋，但它被認(rèn)為是不好的做法。被刪除的數(shù)據(jù)可能與研究無(wú)關(guān)。然而，對(duì)一些讀者來(lái)說(shuō)，它可能是“真實(shí)的并在生物學(xué)上是意義重要的”，或者隨著時(shí)間的推移，隨著更多的信息變得可用，對(duì)圖片的解讀可能會(huì)改變。

裁剪（Cropping）

通常的做法是去除凝膠或Western blot中不相關(guān)的部分。然而，這是不可接受的裁剪圖片的方式，這會(huì)導(dǎo)致數(shù)據(jù)失真或刪除了必要的信息。

許多期刊鼓勵(lì)作者提交未經(jīng)處理的完整凝膠供同行評(píng)審，或者至少包括帶上和帶下的一定面積。“合理的指南是保留背景上下的5個(gè)帶寬。”讀者可能會(huì)懷疑這種剪裁，因?yàn)檫@表明作者可能試圖在附近隱藏另一個(gè)波段。將被比較的圖片應(yīng)該被裁剪到相同的大小。

拼接（Splicing）

在可能的情況下，應(yīng)該避免將圖片拼接在一起。如果不可能在單一凝膠上進(jìn)行實(shí)驗(yàn)，例如，如果你有許多樣品，可能需要將兩種不同凝膠的數(shù)據(jù)拼接在一起。拼接應(yīng)在圖片中明確表示(通常在剪接之間有空白或黑線)，并在圖片說(shuō)明中加以描述。帶子不應(yīng)該拼接在一起，看起來(lái)像是來(lái)自同一種凝膠。

在這個(gè)例子中，我們將來(lái)自不同凝膠的帶并列在一起，給人一種它們來(lái)自同一凝膠的印象。

文章剩余內(nèi)容<<<<<

科研星球

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的生物医学图片处理——怎样才算不当操作?的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

如果覺(jué)得生活随笔網(wǎng)站內(nèi)容還不錯(cuò)，歡迎將生活随笔推薦給好友。