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编程问答

tcga数据下载_TCGA数据下载(mRNA)

發布時間:2025/3/15 编程问答 28 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 tcga数据下载_TCGA数据下载(mRNA) 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
  • 進入GDC網頁

    https://portal.gdc.cancer.gov/

  • 點擊Repository

  • 點擊Cases,選擇需要研究的腫瘤樣本。以結腸癌為例,主要參數:【Primary Site】:colon;?【Program】:TCGA;?【Program】:TCGA-COAD;?

  • 點擊Files,選擇文件類型。主要參數:【Dta Category】:
    transcriptome profiling; 【Experimental Strategy】:RNA-seq; 【Workflow Type】:HTseq-FPKM; 【Data Format】:txt。

  • 加入你的購物車。

  • 進入購物車,下載文件:Manifest、Cart(該文件較大,需要一點時間)、Metadata、Clinical.JSON。

  • 好了。

  • 總結

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