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Python小白的数学建模课-15.图论的基本概念

發(fā)布時間:2025/3/15 python 29 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 Python小白的数学建模课-15.图论的基本概念 小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.

  • 圖論中所說的圖,不是圖形圖像或地圖,而是指由頂點和邊所構(gòu)成的圖形結(jié)構(gòu)。
  • 圖論不僅與拓?fù)鋵W(xué)、計算機數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和算法密切相關(guān),而且正在成為機器學(xué)習(xí)的關(guān)鍵技術(shù)。
  • 本系列結(jié)合數(shù)學(xué)建模的應(yīng)用需求,來介紹 NetworkX 圖論與復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)工具包的基本功能和典型算法。
  • 『Python小白的數(shù)學(xué)建模課 @ Youcans』帶你從數(shù)模小白成為國賽達(dá)人。


1. 圖論

1.1 圖論是什么

圖論〔Graph Theory〕以圖為研究對象,是離散數(shù)學(xué)的重要內(nèi)容。圖論不僅與拓?fù)鋵W(xué)、計算機數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和算法密切相關(guān),而且正在成為機器學(xué)習(xí)的關(guān)鍵技術(shù)。

圖論中所說的圖,不是指圖形圖像(image)或地圖(map),而是指由頂點(vertex)和連接頂點的邊(edge)所構(gòu)成的關(guān)系結(jié)構(gòu)。

圖提供了一種處理關(guān)系和交互等抽象概念的更好的方法,它還提供了直觀的視覺方式來思考這些概念。


1.2 NetworkX 工具包

NetworkX 是基于 Python 語言的圖論與復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)工具包,用于創(chuàng)建、操作和研究復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)、動力學(xué)和功能。

NetworkX 可以以標(biāo)準(zhǔn)和非標(biāo)準(zhǔn)的數(shù)據(jù)格式描述圖與網(wǎng)絡(luò),生成圖與網(wǎng)絡(luò),分析網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)模型,設(shè)計網(wǎng)絡(luò)算法,繪制網(wǎng)絡(luò)圖形。

NetworkX 提供了圖形的類、對象、圖形生成器、網(wǎng)絡(luò)生成器、繪圖工具,內(nèi)置了常用的圖論和網(wǎng)絡(luò)分析算法,可以進行圖和網(wǎng)絡(luò)的建模、分析和仿真。

NetworkX 的功能非常強大和龐雜,所涉及內(nèi)容遠(yuǎn)遠(yuǎn)、遠(yuǎn)遠(yuǎn)地超出了數(shù)學(xué)建模的范圍,甚至于很難進行系統(tǒng)的概括。本系列結(jié)合數(shù)學(xué)建模的應(yīng)用需求,來介紹 NetworkX 圖論與復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)工具包的基本功能和典型算法。

NetworkX 的官網(wǎng)和文檔

  • 官網(wǎng)地址:https://networkx.org/
  • 官方文檔:https://networkx.org/documentation/stable/
  • pdf 文檔:https://networkx.org/documentation/stable/_downloads/networkx_reference.pdf

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2、圖、頂點和邊的創(chuàng)建與基本操作

圖由頂點和連接頂點的邊構(gòu)成,但與頂點的位置、邊的曲直長短無關(guān)。

Networkx 支持創(chuàng)建簡單無向圖、有向圖和多重圖;內(nèi)置許多標(biāo)準(zhǔn)的圖論算法,節(jié)點可為任意數(shù)據(jù);支持任意的邊值維度,功能豐富,簡單易用。

2.1 圖的基本概念

  • 圖(Graph):圖是由若干頂點和連接頂點的邊所構(gòu)成關(guān)系結(jié)構(gòu)。
  • 頂點(Node):圖中的點稱為頂點,也稱節(jié)點。
  • 邊(Edge):頂點之間的連線,稱為邊。
  • 平行邊(Parallel edge):起點相同、終點也相同的兩條邊稱為平行邊。
  • 循環(huán)(Cycle):起點和終點重合的邊稱為循環(huán)。
  • 有向圖(Digraph):圖中的每條邊都帶有方向,稱為有向圖。
  • 無向圖(Undirected graph):圖中的每條邊都沒有方向,稱為無向圖。
  • 賦權(quán)圖(Weighted graph):圖中的每條邊都有一個或多個對應(yīng)的參數(shù),稱為賦權(quán)圖。該參數(shù)稱為這條邊的權(quán),權(quán)可以用來表示兩點間的距離、時間、費用。
  • 度(Degree):與頂點相連的邊的數(shù)量,稱為該頂點的度。

2.2 圖、頂點和邊的操作

Networkx很容易創(chuàng)建圖、向圖中添加頂點和邊、從圖中刪除頂點和邊,也可以查看、刪除頂點和邊的屬性。

2.2.1 圖的創(chuàng)建

Graph() 類、DiGraph() 類、MultiGraph() 類和 MultiDiGraph() 類分別用來創(chuàng)建:無向圖、有向圖、多圖和有向多圖。定義和例程如下:

class Graph(incoming_graph_data=None, **attr)

import networkx as nx # 導(dǎo)入 NetworkX 工具包# 創(chuàng)建 圖 G1 = nx.Graph() # 創(chuàng)建:空的 無向圖 G2 = nx.DiGraph() #創(chuàng)建:空的 有向圖 G3 = nx.MultiGraph() #創(chuàng)建:空的 多圖 G4 = nx.MultiDiGraph() #創(chuàng)建:空的 有向多圖

2.2.2 頂點的添加、刪除和查看

圖的每個頂點都有唯一的標(biāo)簽屬性(label),可以用整數(shù)或字符類型表示,頂點還可以自定義任意屬性。

頂點的常用操作:添加頂點,刪除頂點,定義頂點屬性,查看頂點和頂點屬性。定義和例程如下:

Graph.add_node(node_for_adding, **attr)
Graph.add_nodes_from(nodes_for_adding, **attr)
Graph.remove_node(n)
Graph.remove_nodes_from(nodes)

# 頂點(node)的操作 # 向圖中添加頂點 G1.add_node(1) # 向 G1 添加頂點 1 G1.add_node(1, name='n1', weight=1.0) # 添加頂點 1,定義 name, weight 屬性 G1.add_node(2, date='May-16') # 添加頂點 2,定義 time 屬性 G1.add_nodes_from([3, 0, 6], dist=1) # 添加多個頂點,并定義屬性 G1.add_nodes_from(range(10, 15)) # 向圖 G1 添加頂點 10~14# 查看頂點和頂點屬性 print(G1.nodes()) # 查看頂點列表 # [1, 2, 3, 0, 6, 10, 11, 12, 13, 14] print(G1._node) # 查看頂點屬性 # {1: {'name': 'n1', 'weight': 1.0}, 2: {'date': 'May-16'}, 3: {'dist': 1}, 0: {'dist': 1}, 6: {'dist': 1}, 10: {}, 11: {}, 12: {}, 13: {}, 14: {}}# 從圖中刪除頂點 G1.remove_node(1) # 刪除頂點 G1.remove_nodes_from([1, 11, 13, 14]) # 通過頂點標(biāo)簽的 list 刪除多個頂點 print(G1.nodes()) # 查看頂點 # [2, 3, 0, 6, 10, 12] # 頂點列表

2.2.3 邊的添加、刪除和查看

邊是兩個頂點之間的連接,在 NetworkX 中 邊是由對應(yīng)頂點的名字的元組組成 e=(node1,node2)。邊可以設(shè)置權(quán)重、關(guān)系等屬性。

邊的常用操作:添加邊,刪除邊,定義邊的屬性,查看邊和邊的屬性。向圖中添加邊時,如果邊的頂點是圖中不存在的,則自動向圖中添加該頂點。

Graph.add_edge(u_of_edge, v_of_edge, **attr)
Graph.add_edges_from(ebunch_to_add, **attr)
Graph.add_weighted_edges_from(ebunch_to_add, weight=‘weight’, **attr)

# 邊(edge)的操作 # 向圖中添加邊 G1.add_edge(1,5) # 向 G1 添加邊,并自動添加圖中沒有的頂點 G1.add_edge(0,10, weight=2.7) # 向 G1 添加邊,并設(shè)置邊的屬性 G1.add_edges_from([(1,2,{'weight':0}), (2,3,{'color':'blue'})]) # 向圖中添加邊,并設(shè)置屬性 G1.add_edges_from([(3,6),(1,2),(6,7),(5,10),(0,1)]) # 向圖中添加多條邊 G1.add_weighted_edges_from([(1,2,3.6),[6,12,0.5]]) # 向圖中添加多條賦權(quán)邊: (node1,node2,weight) print(G1.nodes()) # 查看頂點 # [2, 3, 0, 6, 10, 12, 1, 5, 7] # 自動添加了圖中沒有的頂點# 從圖中刪除邊 G1.remove_edge(0,1) # 從圖中刪除邊 0-1 G1.remove_edges_from([(2,3),(1,5),(6,7)]) # 從圖中刪除多條邊# 查看 邊和邊的屬性 print(G1.edges) # 查看所有的邊 [(2, 1), (3, 6), (0, 10), (6, 12), (10, 5)] print(G1.get_edge_data(1,2)) # 查看指定邊的屬性 # {'weight': 3.6} print(G1[1][2]) # 查看指定邊的屬性 # {'weight': 3.6} print(G1.edges(data=True)) # 查看所有邊的屬性 # [(2, 1, {'weight': 3.6}), (3, 6, {}), (0, 10, {'weight': 2.7}), (6, 12, {'weight': 0.5}), (10, 5, {})]

2.2.4 查看圖、頂點和邊的信息

# 查看圖、頂點和邊的信息 print(G1.nodes) # 返回所有的頂點 [node1,...] # [2, 3, 0, 6, 10, 12, 1, 5, 7] print(G1.edges) # 返回所有的邊 [(node1,node2),...] # [(2, 1), (3, 6), (0, 10), (6, 12), (10, 5)] print(G1.degree) # 返回各頂點的度 [(node1,degree1),...] # [(2, 1), (3, 1), (0, 1), (6, 2), (10, 2), (12, 1), (1, 1), (5, 1), (7, 0)] print(G1.number_of_nodes()) # 返回頂點的數(shù)量 # 9 print(G1.number_of_edges()) # 返回邊的數(shù)量 # 5 print(G1[10]) # 返回與指定頂點相鄰的所有頂點的屬性 # {0: {'weight': 2.7}, 5: {}} print(G1.adj[10]) # 返回與指定頂點相鄰的所有頂點的屬性 # {0: {'weight': 2.7}, 5: {}} print(G1[1][2]) # 返回指定邊的屬性 # {'weight': 3.6} print(G1.adj[1][2]) # 返回指定邊的屬性 # {'weight': 3.6} print(G1.degree(10)) # 返回指定頂點的度 # 2print('nx.info:',nx.info(G1)) # 返回圖的基本信息 print('nx.degree:',nx.degree(G1)) # 返回圖中各頂點的度 print('nx.density:',nx.degree_histogram(G1)) # 返回圖中度的分布 print('nx.pagerank:',nx.pagerank(G1)) # 返回圖中各頂點的頻率分布

2.3 圖的屬性和方法

圖的方法

方法說明
G.has_node(n)當(dāng)圖 G 中包括頂點 n 時返回 True
G.has_edge(u, v)當(dāng)圖 G 中包括邊 (u,v) 時返回 True
G.number_of_nodes()返回 圖 G 中的頂點的數(shù)量
G.number_of_edges()返回 圖 G 中的邊的數(shù)量
G.number_of_selfloops()返回 圖 G 中的自循環(huán)邊的數(shù)量
G.degree([nbunch, weight])返回 圖 G 中的全部頂點或指定頂點的度
G.selfloop_edges([data, default])返回 圖 G 中的全部的自循環(huán)邊
G.subgraph([nodes])從圖 G1中抽取頂點[nodes]及對應(yīng)邊構(gòu)成的子圖
union(G1,G2)合并圖 G1、G2
nx.info(G)返回圖的基本信息
nx.degree(G)返回圖中各頂點的度
nx.degree_histogram(G)返回圖中度的分布
nx.pagerank(G)返回圖中各頂點的頻率分布
nx.add_star(G,[nodes],**attr)向圖 G 添加星形網(wǎng)絡(luò)
nx.add_path(G,[nodes],**attr)向圖 G 添加一條路徑
nx.add_cycle(G,[nodes],**attr)向圖 G 添加閉合路徑

例程:

G1.clear() # 清空圖G1 nx.add_star(G1, [1, 2, 3, 4, 5], weight=1) # 添加星形網(wǎng)絡(luò):以第一個頂點為中心 # [(1, 2), (1, 3), (1, 4), (1, 5)] nx.add_path(G1, [5, 6, 8, 9, 10], weight=2) # 添加路徑:順序連接 n個節(jié)點的 n-1條邊 # [(5, 6), (6, 8), (8, 9), (9, 10)] nx.add_cycle(G1, [7, 8, 9, 10, 12], weight=3) # 添加閉合回路:循環(huán)連接 n個節(jié)點的 n 條邊 # [(7, 8), (7, 12), (8, 9), (9, 10), (10, 12)] print(G1.nodes) # 返回所有的頂點 [node1,...] nx.draw_networkx(G1) plt.show()G2 = G1.subgraph([1, 2, 3, 8, 9, 10]) G3 = G1.subgraph([4, 5, 6, 7]) G = nx.union(G2, G3) print(G.nodes) # 返回所有的頂點 [node1,...] # [1, 2, 3, 8, 9, 10, 4, 5, 6, 7]

3、圖的繪制與分析

3.1 圖的繪制

可視化是圖論和網(wǎng)絡(luò)問題中很重要的內(nèi)容。NetworkX 在 Matplotlib、Graphviz 等圖形工具包的基礎(chǔ)上,提供了豐富的繪圖功能。

本系列擬對圖和網(wǎng)絡(luò)的可視化作一個專題,在此只簡單介紹基于 Matplotlib 的基本繪圖函數(shù)。基本繪圖函數(shù)使用字典提供的位置將節(jié)點放置在散點圖上,或者使用布局函數(shù)計算位置。

方法說明
draw(G[,pos,ax])基于 Matplotlib 繪制 圖 G
draw_networkx(G[, pos, arrows, with_labels])基于 Matplotlib 繪制 圖 G
draw_networkx_nodes(G, pos[, nodelist, . . . ])繪制圖 G 的頂點
draw_networkx_edges(G, pos[, edgelist, . . . ])繪制圖 G 的邊
draw_networkx_labels(G, pos[, labels, . . . ])繪制頂點的標(biāo)簽
draw_networkx_edge_labels(G, pos[, . . . ])繪制邊的標(biāo)簽

其中,nx.draw() 和 nx.draw_networkx() 是最基本的繪圖函數(shù),并可以通過自定義函數(shù)屬性或其它繪圖函數(shù)設(shè)置不同的繪圖要求。

draw(G, pos=None, ax=None, **kwds)

draw_networkx(G, pos=None, arrows=True, with_labels=True, **kwds)

常用的屬性定義如下:

  • ‘node_size’:指定節(jié)點的尺寸大小,默認(rèn)300
  • ‘node_color’:指定節(jié)點的顏色,默認(rèn)紅色
  • ‘node_shape’:節(jié)點的形狀,默認(rèn)圓形
  • '‘a(chǎn)lpha’:透明度,默認(rèn)1.0,不透明
  • ‘width’:邊的寬度,默認(rèn)1.0
  • ‘edge_color’:邊的顏色,默認(rèn)黑色
  • ‘style’:邊的樣式,可選 ‘solid’、‘dashed’、‘dotted’、‘dashdot’
  • ‘with_labels’:節(jié)點是否帶標(biāo)簽,默認(rèn)True
  • ‘font_size’:節(jié)點標(biāo)簽字體大小,默認(rèn)12
  • ‘font_color’:節(jié)點標(biāo)簽字體顏色,默認(rèn)黑色

3.2 圖的分析

NetwotkX 提供了圖論函數(shù)對圖的結(jié)構(gòu)進行分析:

子圖

  • 子圖是指頂點和邊都分別是圖 G 的頂點的子集和邊的子集的圖。
  • subgraph()方法,按頂點從圖 G 中抽出子圖。例程如前。

連通子圖

  • 如果圖 G 中的任意兩點間相互連通,則 G 是連通圖。
  • connected_components()方法,返回連通子圖的集合。
G = nx.path_graph(4) nx.add_path(G, [7, 8, 9]) # 連通子圖 listCC = [len(c) for c in sorted(nx.connected_components(G), key=len, reverse=True)] maxCC = max(nx.connected_components(G), key=len) print('Connected components:{}'.format(listCC)) # 所有連通子圖 # Connected components:[4, 3] print('Largest connected components:{}'.format(maxCC)) # 最大連通子圖 # Largest connected components:{0, 1, 2, 3}

強連通

  • 如果有向圖 G 中的任意兩點間相互連通,則稱 G 是強連通圖。
  • strongly_connected_components()方法,返回所有強連通子圖的列表。
# 強連通 G = nx.path_graph(4, create_using=nx.DiGraph()) nx.add_path(G, [3, 8, 1]) # 找出所有的強連通子圖 con = nx.strongly_connected_components(G) print(type(con),list(con)) # <class 'generator'> [{8, 1, 2, 3}, {0}]

弱連通

  • 如果一個有向圖 G 的基圖是連通圖,則有向圖 G 是弱連通圖。
  • weakly_connected_components()方法,返回所有弱連通子圖的列表。
# 弱連通 G = nx.path_graph(4, create_using=nx.DiGraph()) #默認(rèn)生成節(jié)點 0,1,2,3 和有向邊 0->1,1->2,2->3 nx.add_path(G, [7, 8, 3]) #生成有向邊:7->8->3 con = nx.weakly_connected_components(G) print(type(con),list(con)) # <class 'generator'> [{0, 1, 2, 3, 7, 8}]

【本節(jié)完】


版權(quán)聲明:

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總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的Python小白的数学建模课-15.图论的基本概念的全部內(nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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