http://www.mdbbs.org/thread-8835-1-1.html

作業(yè)提交系統(tǒng)Torque個(gè)人安裝總結(jié)(PBS)

PBS是功能最為齊全，歷史最悠久，支持最廣泛的本地集群調(diào)度器之一。 PBS的目前包括openPBS，PBS Pro和Torque三個(gè)主要分支。 其中OpenPBS是最早的PBS系統(tǒng)，目前已經(jīng)沒(méi)有太多后續(xù)開(kāi)發(fā)，PBS pro是PBS的商業(yè)版本，功能最為豐富。Torque是Clustering公司接過(guò)了OpenPBS，并給與后續(xù)支持的一個(gè)開(kāi)源版本。
下面是本人安裝torque的過(guò)程。
一、Torque安裝
在master（管理結(jié)點(diǎn)上）
1、解壓安裝包
[root@master tmp]# tar zxvf torque-2.3.0.tar.gz

2、進(jìn)入到解壓后的文件夾
./configure --with-default-server=master
make
make install
3、
（1）[root@master torque-2.3.0]#./torque.setup <user>
<user>必須是個(gè)普通用戶(hù)

（2）[root@master torque-2.3.0]#make packages
把產(chǎn)生的 tpackages , torque-package-clients-linux-x86-64.sh,
torque-package-mom-linux-x86-64.sh 拷貝到所有節(jié)點(diǎn)。

（3）[root@master torque-2.3.0]# ./torque-package-clients-linux-x86_64.sh --install
[root@master torque-2.3.0]# ./torque-package-mom-linux-x86_64.sh --install

（4）編輯/var/spool/torque/server_priv/nodes （需要自己建立）
? ???加入如下內(nèi)容

master??np=4

node01 np=4

........

node09 np=4


（5）啟動(dòng)pbs_server,pbs_sched,pbs_mom,并把其寫(xiě)到/etc/rc.local里使其能開(kāi)機(jī)自啟動(dòng)。

（6）創(chuàng)建隊(duì)列
[root@master ~]# qmgr
create queue students
set queue students queue_type = Execution
set queue students Priority = 40
set queue students resources_max.cput = 96:00:00
set queue students resources_min.cput = 00:00:01
set queue students resources_default.cput = 96:00:00
set queue students enabled = True
set queue students started = True

4、在node0x （x=1-9,計(jì)算結(jié)點(diǎn)上）
[root@node0x torque-2.3.0]# ./torque-package-clients-linux-x86_64.sh --install
[root@node0x torque-2.3.0]# ./torque-package-mom-linux-x86_64.sh --install
然后啟動(dòng)pbs_mom ,把pbs_mom寫(xiě)入/etc/rc.local


二、Torque PBS使用
1、創(chuàng)建用戶(hù)
? ?在master的root下
? ?useradd test

passwd test
? ?輸入test密碼


到/var/yp下make一下
2、配置普通用戶(hù)的ssh
? ?su test

cd

ssh-keygen -t dsa

cd .ssh

cat id_pub.dsa >>authorized_keys

chmod 600 authorized_keys
3、編寫(xiě)作業(yè)腳本
[test1@master t]vi pbsjob
#!/bin/tcsh
#PBS -o /home/test1/pbstest/t/output 標(biāo)準(zhǔn)輸出文件
#PBS -e /home/test1/pbstest/t/error 錯(cuò)誤輸出文件
#PBS -l nodes=5:ppn=4 規(guī)定使用的節(jié)點(diǎn)數(shù)以及每個(gè)節(jié)點(diǎn)能跑多少核
#PBS –q students 把任務(wù)提交到students隊(duì)列中
cd $PBS_O_WORKDIR 到工作目錄下（此為PBS提供的環(huán)境變量）
mpirun –machine $PBS_NODEFILE -np 20 ./vasp

4、啟動(dòng)mpd
mpdboot -n 10 -f mfa

mfa內(nèi)容：
master:4
node01:4
….
node09:4

5、提交，查詢(xún)，刪除作業(yè)

提交作業(yè)：qsub pbsjob
作業(yè)提交后會(huì)有一個(gè)作業(yè)號(hào)
[test1@master pbstest]$ qsub pbsjob
48.master

查詢(xún)作業(yè)：qstat
[test1@master pbstest]$ qstat
Job id? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ? Name? ?? ?? ?? ?? ? User? ?? ?? ?? ?Time Use??S? ?? ???Queue
------------------------- ---------------- --------------- --------??- -------------------------------
48.master? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ? pbstest? ?? ?? ?? ?? ?test1? ?? ?? ?? ?00:00:00? ?R? ?? ???students

刪除作業(yè)：qdel 作業(yè)號(hào)
[test1@master pbstest]$ qdel 48

轉(zhuǎn)載于:https://www.cnblogs.com/cy163/archive/2009/03/10/1407410.html

創(chuàng)作挑戰(zhàn)賽新人創(chuàng)作獎(jiǎng)勵(lì)來(lái)咯，堅(jiān)持創(chuàng)作打卡瓜分現(xiàn)金大獎(jiǎng)

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的OpenPBS 脚本的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

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