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Paper Pal：一個(gè)中英文論文及其代碼大數(shù)據(jù)搜索平臺(tái)

余萬(wàn),?付聿煒,?熊贇,?朱揚(yáng)勇

1 引言

在開(kāi)展科研工作的過(guò)程中，科研人員需要從大量實(shí)時(shí)更新的論文中持續(xù)地跟蹤學(xué)術(shù)界前沿的發(fā)展情況，學(xué)習(xí)最新研究成果。近年來(lái)，人工智能（artificial intelligence， AI）、數(shù)據(jù)挖掘等領(lǐng)域受到的關(guān)注度不斷增加，相關(guān)會(huì)議的論文數(shù)量呈爆發(fā)式增長(zhǎng)。圖1顯示了arXiv數(shù)據(jù)庫(kù)中2010—2019年AI領(lǐng)域的論文增長(zhǎng)情況。但是，巨大的論文數(shù)量導(dǎo)致科研人員搜索論文的過(guò)程中耗費(fèi)了大量的時(shí)間。

圖1???2010—2019年arXiv數(shù)據(jù)庫(kù)中AI領(lǐng)域的論文增長(zhǎng)情況

目前，已經(jīng)有很多論文搜索引擎，如Microsoft Academic、Arxiv Sanity Preserver、Papers With Code以及AMiner等。其中，Microsoft Academic根據(jù)研究領(lǐng)域?qū)φ撐倪M(jìn)行了分類(lèi)，并提供了論文的全文鏈接、所發(fā)表的會(huì)議或期刊、引用的參考文獻(xiàn)等；Arxiv Sanity Preserver提供了arXiv上論文的瀏覽、搜索和排序功能，并根據(jù)用戶(hù)收藏的論文，使用TF-IDF和支持向量機(jī)（support vector machine，SVM）實(shí)現(xiàn)論文推薦。對(duì)于計(jì)算機(jī)領(lǐng)域的科研人員，論文中提出的算法、模型的代碼是相當(dāng)重要的學(xué)習(xí)資源，能夠讓人更直觀、快速地理解和掌握一個(gè)新算法或新模型，但Microsoft Academic和Arxiv Sanity Preserver等未提供代碼信息。在眾多代碼平臺(tái)中， GitHub成為目前非常有代表性的代碼平臺(tái)。但是，在搜索論文和對(duì)應(yīng)的代碼時(shí)，科研人員需要在不同的搜索平臺(tái)上來(lái)回切換以獲取論文和代碼，這無(wú)疑增加了科研工作的時(shí)間。

為了解決論文和論文代碼在空間上的差異問(wèn)題，Atlas ML推出一個(gè)免費(fèi)、開(kāi)源的機(jī)器學(xué)習(xí)領(lǐng)域的論文和代碼分享平臺(tái)——Papers With Code，該平臺(tái)不提供計(jì)算機(jī)領(lǐng)域的中文論文。AMiner是目前功能較全的研究者、論文搜索平臺(tái)，其構(gòu)建的主要目標(biāo)是通過(guò)整合多源數(shù)據(jù)提供研究者搜索分析功能來(lái)構(gòu)建研究者網(wǎng)絡(luò)和學(xué)術(shù)論文網(wǎng)絡(luò)。該平臺(tái)也提供中英文論文的搜索功能，并包含部分可人工編輯的論文相應(yīng)的代碼鏈接。

不同于AMiner平臺(tái)的構(gòu)建目標(biāo)，本文聚焦中國(guó)計(jì)算機(jī)領(lǐng)域的科研人員在搜索論文中的實(shí)際需求，以“中國(guó)計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)（China Computer Federation，CCF）推薦分區(qū)論文+代碼+中文期刊+推薦”為定位，設(shè)計(jì)和實(shí)現(xiàn)了一個(gè)使用友好、免費(fèi)、開(kāi)源的計(jì)算機(jī)領(lǐng)域論文與代碼搜索系統(tǒng)——Paper Pal。

Paper Pal針對(duì)中國(guó)計(jì)算機(jī)領(lǐng)域的科研人員需求，按照CCF推薦論文分區(qū)對(duì)平臺(tái)中的論文進(jìn)行分類(lèi)，提供方便的選項(xiàng)卡和搜索支持，平臺(tái)功能更加聚焦。目前， Paper Pal共收錄英文文獻(xiàn)29 507篇、中文文獻(xiàn)2 130篇以及代碼6 147份，覆蓋人工智能、數(shù)據(jù)挖掘領(lǐng)域的CCF分區(qū)的35個(gè)A類(lèi)和B類(lèi)會(huì)議以及四大計(jì)算機(jī)領(lǐng)域中文期刊（《計(jì)算機(jī)學(xué)報(bào)》《軟件學(xué)報(bào)》《計(jì)算機(jī)研究與發(fā)展》《大數(shù)據(jù)》）。同時(shí)，平臺(tái)具有可擴(kuò)展性，將持續(xù)收集整合新的會(huì)議和期刊的論文。

此外，用戶(hù)也可以采用關(guān)鍵詞、期刊名、會(huì)議名等方式進(jìn)行論文搜索。Paper Pal還提供論文收藏功能，以便用戶(hù)記錄、整理以及追溯，同時(shí)將用戶(hù)收藏的論文作為用戶(hù)的行為數(shù)據(jù)來(lái)源，利用系統(tǒng)內(nèi)置的論文推薦功能，推測(cè)用戶(hù)可能感興趣的論文，幫助用戶(hù)在更短的時(shí)間內(nèi)找到所需要的資料，進(jìn)一步提升用戶(hù)的使用體驗(yàn)。表1對(duì)Paper Pal和上述其他論文搜索平臺(tái)進(jìn)行了對(duì)比。

2 相關(guān)技術(shù)

Paper Pal平臺(tái)負(fù)責(zé)對(duì)論文及其代碼進(jìn)行收集、存儲(chǔ)并提供搜索和推送功能。這里需要解決幾個(gè)問(wèn)題：第一，數(shù)據(jù)是多來(lái)源的，如何合理地進(jìn)行數(shù)據(jù)整合，以提升平臺(tái)數(shù)據(jù)質(zhì)量是基礎(chǔ)；第二，論文數(shù)據(jù)是文本類(lèi)型，如何有效地進(jìn)行存儲(chǔ)和預(yù)處理是核心；第三，平臺(tái)中既有中文論文又有英文論文，如何提供精準(zhǔn)搜索是關(guān)鍵。針對(duì)上述問(wèn)題，本文采用了當(dāng)前大數(shù)據(jù)領(lǐng)域中主流的數(shù)據(jù)獲取、數(shù)據(jù)存儲(chǔ)和數(shù)據(jù)檢索技術(shù)，并根據(jù)本系統(tǒng)的特點(diǎn)進(jìn)行了改進(jìn)，包括在MongoDB與Elasticsearch之間進(jìn)行數(shù)據(jù)同步，從而實(shí)現(xiàn)在利用MongoDB數(shù)據(jù)存儲(chǔ)的優(yōu)勢(shì)和Elasticsearch強(qiáng)大的中文搜索能力的同時(shí)，保證搜索結(jié)果與數(shù)據(jù)存儲(chǔ)更新的同步。此外，采用面向異質(zhì)網(wǎng)絡(luò)的推薦模型對(duì)用戶(hù)的搜索行為進(jìn)行分析，以實(shí)現(xiàn)論文推送。

2.1 數(shù)據(jù)獲取與存儲(chǔ)

實(shí)現(xiàn)Paper Pal的第一步是收集論文及其相關(guān)數(shù)據(jù)，目前本系統(tǒng)收集了CCF推薦分區(qū)A類(lèi)、B類(lèi)會(huì)議近3年發(fā)表的人工智能、數(shù)據(jù)挖掘領(lǐng)域的論文。數(shù)據(jù)來(lái)自DBLP上論文所在的期刊、會(huì)議的詳細(xì)信息。同時(shí)，從Microsoft Academic上獲取了論文被引用的次數(shù)。綜合上述信息，系統(tǒng)提供的論文相關(guān)信息包括論文的標(biāo)題、作者、出版日期、論文PDF文檔鏈接和被引用的次數(shù)等。除英文論文外，Paper Pal還從計(jì)算機(jī)領(lǐng)域的中文期刊中獲取了中文論文數(shù)據(jù)。

獲取到論文信息后，進(jìn)一步整合論文中介紹的模型和算法的相關(guān)代碼。系統(tǒng)將GitHub當(dāng)作Paper Pal的代碼數(shù)據(jù)來(lái)源，通過(guò)GitHub提供的API來(lái)獲取代碼數(shù)據(jù)。雖然有些論文沒(méi)有論文原作者公布的代碼，但是會(huì)有其他研究人員在GitHub上分享實(shí)現(xiàn)的代碼。

收集完論文數(shù)據(jù)和對(duì)應(yīng)的代碼之后，將其存儲(chǔ)到數(shù)據(jù)庫(kù)中。本系統(tǒng)使用MongoDB提供數(shù)據(jù)存儲(chǔ)和管理服務(wù)。每篇英文論文的記錄有11個(gè)屬性，分別為：論文的ID、標(biāo)題、摘要、作者、發(fā)布日期、代碼鏈接、PDF鏈接、關(guān)鍵詞、被引用次數(shù)、發(fā)表會(huì)議或期刊、發(fā)表年份。

2.2 中英文論文搜索方法

Paper Pal收集的論文包括中文論文和英文論文。為實(shí)現(xiàn)更高效、準(zhǔn)確、方便的中英文檢索功能，Paper Pal選取Elasticsearch作為搜索引擎。Elasticsearch是一個(gè)開(kāi)源的、基于Lucene的分布式數(shù)據(jù)搜索引擎，能夠提供快速的檢索功能，具有易擴(kuò)展、近實(shí)時(shí)的特點(diǎn)。Elasticsearch的倒排索引功能能夠有效地提高多條件查詢(xún)的檢索效率；Elasticsearch支持中文分詞插件IK Analyzer，能夠更好、更方便地滿(mǎn)足Paper Pal對(duì)中文文獻(xiàn)的檢索需求。除此之外，Elasticsearch還有與之配套的可視化工具Kibana和日志收集分析工具Logstash，能夠?yàn)镻aper Pal提供日志收集、文本檢索和數(shù)據(jù)可視化分析整套流程的服務(wù)。

但Elasticsearch容易因?yàn)檐浻布罎⒍斐蓴?shù)據(jù)丟失且無(wú)法恢復(fù)，因此Elasticsearch通常與關(guān)系型數(shù)據(jù)庫(kù)或非關(guān)系型數(shù)據(jù)庫(kù)配合使用，其中數(shù)據(jù)庫(kù)作為持久化存儲(chǔ)組件提供約束限制和系統(tǒng)魯棒性保證，而Elasticsearch基于數(shù)據(jù)內(nèi)容實(shí)現(xiàn)復(fù)雜的搜索查詢(xún)。Paper Pal的數(shù)據(jù)被存儲(chǔ)在MongoDB中，在本系統(tǒng)中，筆者把MongoDB的論文數(shù)據(jù)同步到Elasticsearch中，并實(shí)時(shí)監(jiān)聽(tīng)MongoDB中數(shù)據(jù)的更新情況。如圖2所示，Paper Pal使用Mongo-connector來(lái)跟蹤事先建立好的MongoDB Replica Set的oplog（operations log），利用Mongoconnector的文檔管理器Elastic2doc-manager將MongoDB的數(shù)據(jù)導(dǎo)入Elasticserach，并實(shí)時(shí)監(jiān)聽(tīng)oplog的變化，以保持Elasticsearch與MongoDB之間數(shù)據(jù)的同步。

圖2???將MongoDB的數(shù)據(jù)同步到Elasticsearch中

2.3 論文推薦方法

考慮到目前收集的用戶(hù)數(shù)據(jù)有限，目前Paper Pal使用與Arxiv Sanity Preserver相似的基于內(nèi)容的推薦方法，即根據(jù)用戶(hù)收藏的論文的標(biāo)題與摘要，使用TF-IDF和SVM將論文的詞頻等作為特征來(lái)計(jì)算其他論文和用戶(hù)收藏的論文在詞的語(yǔ)義上的相似度。同時(shí)，Paper Pal系統(tǒng)內(nèi)置了筆者提出的基于異質(zhì)網(wǎng)絡(luò)表示學(xué)習(xí)的基于元路徑增強(qiáng)的圖注意力編碼（metapath enhanced graph attention encoder， MEGAE）模型，模型框架如圖3所示。該模型將論文、用戶(hù)看成一個(gè)異質(zhì)網(wǎng)絡(luò)，將用戶(hù)搜索以及收藏的論文作為用戶(hù)和論文之間的邊，當(dāng)用戶(hù)注冊(cè)并登錄Paper Pal后，Paper Pal會(huì)將用戶(hù)收藏和瀏覽的論文信息記入數(shù)據(jù)庫(kù)，這些數(shù)據(jù)將被用來(lái)更新網(wǎng)絡(luò)，為推薦功能積累數(shù)據(jù)來(lái)源。例如，當(dāng)用戶(hù)A看了論文B之后，Paper Pal會(huì)在異質(zhì)網(wǎng)絡(luò)中為用戶(hù)A和論文B添加一條連邊。Paper Pal使用MEGAE模型學(xué)習(xí)異質(zhì)網(wǎng)絡(luò)中每個(gè)不同節(jié)點(diǎn)的低維向量表示和異質(zhì)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)信息，捕捉用戶(hù)的興趣點(diǎn)，從而為用戶(hù)推薦論文。比起單純使用詞頻作為特征進(jìn)行推薦，MEGAE模型不僅能捕捉到異質(zhì)網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)信息，同時(shí)還能學(xué)習(xí)到異質(zhì)網(wǎng)絡(luò)中隱含的語(yǔ)義關(guān)系，實(shí)現(xiàn)更精準(zhǔn)的個(gè)性化推薦。根據(jù)本系統(tǒng)的特點(diǎn)，即論文具有CCF分區(qū)信息，發(fā)表論文的會(huì)議或期刊所屬的CCF分區(qū)和論文領(lǐng)域可以作為論文的標(biāo)簽加入論文節(jié)點(diǎn)的屬性中，即將MEGAE模型應(yīng)用到考慮節(jié)點(diǎn)屬性的屬性網(wǎng)絡(luò)圖中。

圖3???MEGAE模型框架

3 平臺(tái)效果

Paper Pal平臺(tái)為中國(guó)計(jì)算機(jī)領(lǐng)域的科研工作者提供了“分區(qū)搜索”功能，即直接進(jìn)入CCF推薦分區(qū)會(huì)議或中文期刊進(jìn)行搜索（如圖4所示）。用戶(hù)可以選擇瀏覽CCF推薦分區(qū)會(huì)議或中文期刊的論文，系統(tǒng)根據(jù)用戶(hù)的選擇顯示相應(yīng)的論文列表。論文列表包括論文的標(biāo)題、作者、發(fā)表日期、摘要、PDF文檔鏈接、代碼鏈接以及被引次數(shù)等信息。考慮到存在具體某一期刊/會(huì)議論文數(shù)量多并且用戶(hù)只想搜索該期刊/會(huì)議下的論文的情況，Paper Pal為用戶(hù)提供兩種搜索范圍，一種是在所有期刊/會(huì)議下進(jìn)行搜索，另一種是在某個(gè)特定的期刊/會(huì)議下進(jìn)行搜索。“分區(qū)搜索”是區(qū)分于其他平臺(tái)的重要功能。因?yàn)橛脩?hù)對(duì)高質(zhì)量論文的關(guān)注度通常更高，所以本功能通過(guò)給出中國(guó)計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)的高質(zhì)量會(huì)議推薦列表及其中的論文，為用戶(hù)提供直接的搜索服務(wù)。而在現(xiàn)有其他平臺(tái)上，用戶(hù)必須先去查閱哪些會(huì)議在中國(guó)計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)的推薦列表中，然后再到搜索平臺(tái)中用關(guān)鍵詞進(jìn)行檢索。因此，本平臺(tái)將大幅減少用戶(hù)在搜索高質(zhì)量論文（計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)推薦列表中的會(huì)議論文）時(shí)耗費(fèi)的時(shí)間。此外，用戶(hù)耗費(fèi)相當(dāng)時(shí)間查閱到所需的會(huì)議名之后，在現(xiàn)有其他平臺(tái)上將會(huì)議名作為關(guān)鍵詞進(jìn)行搜索時(shí)，搜索結(jié)果會(huì)出現(xiàn)偏差。例如international conference on machine learning（ICML）中有“machine learning”，若將“machine learning”作為關(guān)鍵詞進(jìn)行搜索，將會(huì)把該詞作為標(biāo)題或摘要等中的匹配詞返回，而不是搜索ICML。最后，如果在現(xiàn)有其他平臺(tái)上直接使用會(huì)議名的縮寫(xiě)來(lái)搜索會(huì)議，對(duì)搜索質(zhì)量將是更大的挑戰(zhàn)。因此，本平臺(tái)的搜索聚焦關(guān)鍵詞與論文主題等的匹配度，而不需要考慮以會(huì)議名為關(guān)鍵詞的匹配，所以，本平臺(tái)具有更高的精準(zhǔn)度。

圖4???Paper Pal的“分區(qū)搜索”頁(yè)面

當(dāng)用戶(hù)查閱到自己感興趣的論文時(shí)，可以進(jìn)入論文的詳情頁(yè)面，將論文添加到收藏夾中。Paper Pal根據(jù)論文的標(biāo)題和摘要使用TF-IDF和SVM生成該論文的相似論文目錄。用戶(hù)可在論文的詳情頁(yè)面（如圖5所示），進(jìn)一步查看與當(dāng)前論文相似的論文。Paper Pal基于MEGAE模型的論文推薦功能需用戶(hù)注冊(cè)、登錄，并且在平臺(tái)積累到一定數(shù)量的用戶(hù)收藏?cái)?shù)據(jù)后才能使用。MEGAE模型使用圖注意力編碼器來(lái)捕捉網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的信息，能夠增強(qiáng)模型的可解釋性，同時(shí)還能學(xué)習(xí)到由論文、作者、會(huì)議/期刊等構(gòu)成的異質(zhì)網(wǎng)絡(luò)中隱含的語(yǔ)義關(guān)系，實(shí)現(xiàn)更精準(zhǔn)的個(gè)性化推薦。例如，可以根據(jù)論文是否具有合作者或論文是否發(fā)表在不同會(huì)議上等不同的條件，實(shí)現(xiàn)不同語(yǔ)義路徑下的推薦。其生成的推薦目錄可在“為您推薦”版塊中查閱。

圖5???論文的詳情頁(yè)面

Paper Pal也將持續(xù)收集和更新一系列公開(kāi)的數(shù)據(jù)集，并根據(jù)不同的研究方向?qū)?shù)據(jù)集進(jìn)行劃分（如圖6所示）。

圖6???公開(kāi)數(shù)據(jù)集頁(yè)面

4 結(jié)束語(yǔ)

本文設(shè)計(jì)和實(shí)現(xiàn)了一個(gè)論文及其代碼大數(shù)據(jù)搜索系統(tǒng)——Paper Pal，旨在為中國(guó)計(jì)算機(jī)領(lǐng)域的科研人員提供一個(gè)功能更全面的中英文論文及其代碼大數(shù)據(jù)搜索工具。該平臺(tái)基于多源數(shù)據(jù)獲取、MongoDB數(shù)據(jù)庫(kù)存儲(chǔ)、非結(jié)構(gòu)化文本抽取轉(zhuǎn)換和Elasticsearch中文數(shù)據(jù)檢索等方法和技術(shù)，整合了CCF推薦分區(qū)會(huì)議和部分國(guó)內(nèi)計(jì)算機(jī)領(lǐng)域的中文期刊的論文及其已公開(kāi)在GitHub上的代碼，并提供論文及其代碼大數(shù)據(jù)搜索功能；還采用面向異質(zhì)網(wǎng)絡(luò)的推薦模型實(shí)現(xiàn)用戶(hù)搜索行為分析，為用戶(hù)推送感興趣的論文。Paper Pal平臺(tái)將大幅縮短科研人員查找文獻(xiàn)的時(shí)間，幫助科研人員在更短的時(shí)間內(nèi)更有效地獲取更多、更全面的資料，并且該平臺(tái)中積累的計(jì)算機(jī)領(lǐng)域高質(zhì)量中英文論文、代碼及其數(shù)據(jù)集形成了科研成果研究的大數(shù)據(jù)資源庫(kù)，為科研大數(shù)據(jù)研究提供了豐富的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)，也為科研趨勢(shì)分析研究提供了數(shù)據(jù)支持，對(duì)持續(xù)開(kāi)展科研領(lǐng)域的成果進(jìn)展研究具有重要意義。

作者簡(jiǎn)介

余萬(wàn)（1997-），男，復(fù)旦大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)技術(shù)學(xué)院、上海市數(shù)據(jù)科學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室碩士生，主要研究方向?yàn)閿?shù)據(jù)挖掘及其應(yīng)用 。

付聿煒（1994-），男，復(fù)旦大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)技術(shù)學(xué)院、上海市數(shù)據(jù)科學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室碩士生，主要研究方向?yàn)楫愘|(zhì)網(wǎng)絡(luò)、推薦系統(tǒng) 。

熊贇（1980-），女，復(fù)旦大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)技術(shù)學(xué)院教授、博士生導(dǎo)師，上海市數(shù)據(jù)科學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室副主任。從2004年起從事數(shù)據(jù)領(lǐng)域方面的研究工作，作為項(xiàng)目負(fù)責(zé)人，主持多項(xiàng)國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目、上海市科學(xué)技術(shù)委員會(huì)發(fā)展基金項(xiàng)目以及企業(yè)合作項(xiàng)目。在國(guó)際權(quán)威期刊和會(huì)議論文集上發(fā)表論文80余篇，出版著作3本。目前主要研究方向?yàn)閿?shù)據(jù)科學(xué)和大數(shù)據(jù) 。

朱揚(yáng)勇（1963-），男，復(fù)旦大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)技術(shù)學(xué)院教授、博士生導(dǎo)師，上海市數(shù)據(jù)科學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任。從1989年起從事數(shù)據(jù)領(lǐng)域的研究工作，1996年開(kāi)始從事數(shù)據(jù)挖掘研究工作，2004年開(kāi)始從事數(shù)據(jù)科學(xué)研究工作，是國(guó)內(nèi)最早一批從事數(shù)據(jù)挖掘研究工作的學(xué)者和國(guó)際數(shù)據(jù)科學(xué)研究工作的主要倡導(dǎo)者之一。2009年發(fā)表了數(shù)據(jù)科學(xué)論文“Dataexplosion,datanatureanddataology”，并出版第一本數(shù)據(jù)科學(xué)專(zhuān)著《數(shù)據(jù)學(xué)》。主持國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目、國(guó)家863計(jì)劃項(xiàng)目、上海市科學(xué)技術(shù)委員會(huì)重點(diǎn)項(xiàng)目等數(shù)十項(xiàng)研究課題，曾獲上海市科技進(jìn)步獎(jiǎng)一、二、三等獎(jiǎng)。在國(guó)內(nèi)外權(quán)威期刊或會(huì)議上發(fā)表論文150余篇，出版專(zhuān)著2本，教材3本。目前主要研究方向?yàn)閿?shù)據(jù)科學(xué)和大數(shù)據(jù) 。

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總結(jié)

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