合子基因組激活（ZGA）是早期胚胎發育過程中最重要的生物學事件之一，轉錄因子在這一過程中具有重要的作用，繪制轉錄因子的全基因組結合位點圖譜對于揭示其調控ZGA的機制具有重要意義。目前用于檢測轉錄因子結合位點的技術主要依賴于高質量的特異性抗體，在已有的研究中僅有少數轉錄因子在ZGA時期的結合情況是已知的。

2022年2月，同濟大學生命科學與技術學院張勇教授課題組題在Genome Research期刊上發表了封面文章“Antibody-free profiling of transcription factor occupancy during early embryogenesis by FitCUT&RUN”。該工作首先通過引入轉錄因子-rFc的融合表達，建立了不依賴于特異性抗體的繪制轉錄因子結合位點圖譜的方法FitCUT&RUN。該工作在K562細胞中驗證了FitCUT&RUN的有效性和可靠性，且相較于CUT&RUN、FLAG-CUT&RUN、ChIP-seq具有更高的檢測靈敏度，適合于胚胎發育早期的研究。

Nanog參與調控斑馬魚ZGA過程中染色質開放區域的建立并影響部分基因的轉錄激活。該工作在斑馬魚ZGA過程中產生了時序性的Nanog FitCUT&RUN數據，并按照Nanog結合的時間將其結合位點分為pre-MBT時期出現、MBT時期新出現和post-MBT時期新出現三類。在pre-MBT時期出現的結合位點的靶基因傾向于在ZGA期間達到最高的轉錄水平，而MBT時期新出現或post-MBT時期新出現的結合位點的靶基因在ZGA之后的胚層分化過程中具有更高的轉錄水平。該工作的結果表明，在ZGA主要階段之前，Nanog在基因調控區域的結合與相當一部分早期轉錄基因的激活密切相關。

張勇教授和劉桂芬副研究員為這項研究的通訊作者，博士生王湘秀、王文為共同第一作者，博士生王益曼、碩士生陳佳參與了這項工作。封面由同濟大學生物信息學專業校友陳一情繪制。

原文鏈接：https://genome.cshlp.org/content/32/2/378

排版：BioArt

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的Genome Research封面文章｜张勇课题组开发方法绘制胚胎发育早期转录因子结合位点图谱...的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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