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2021年5月，205個R新包收錄于CRAN（2021年4月份收錄179個），累計收錄約19,088個R包！此次選摘了40個R包（10個類別），分布結構如下：

一. 計算方法

1.?madgrad: 實現隨機優化的自適應雙平均梯度法?MADGRAD.

2.?TriDimRegression: 提供使用Stan擬合2D和3D變換的函數，Stan返回擬合參數的后驗分布.

二. 數據

1.?AtmChile: 提供來自智利國家空氣質量系統 (S.I.N.C.A.) 的空氣質量和氣象信息.

2.?basemaps: 提供一個輕量級接口，用于從開放源（如OpenStreetMap、Mapbox等）訪問spatial basemaps.

3. causaldata: 提供用于運行在線因果推理教科書：The Effect and Causal Inference: What If 中的示例問題的數據集.

4.?exoplanets: 提供對 NASA外行星檔案的訪問.

5.?frenchdata: 提供對 Kenneth 的法國金融數據庫的訪問.

6.?tradepolicy: 提供對Yotov等人（2016）數據集的訪問，以及一本包含評論和代碼的在線書籍.

三.?基因組學

1.?artemis: 為環境DNA采集實驗的設計和分析提供了一個建模框架.

2.?MAGEE: 提供執行基于變體集的主效應測試、基因-環境相互作用測試和關聯聯合測試的功能，如 Wang 等人提出?(2020).

3.?MultIS: 實施生物信息學方法來檢測同一克隆內病毒載體的多重整合.

4.?TopDom: 提供從 Hi-C 序列數據中識別基因組拓撲結構域的功能，如 Shin 等人所述(2016).

四. 機器學習

1.?cjbart: 使用貝葉斯加性回歸樹 (BART) 實現分析聯合實驗的工具，這是一種由 Chipman & McCulloch (2010) 開發的機器學習方法.

2. fastText: 實現 Facebook 的 fastText 庫的接口，見 Bojanowski 等人?(2017) 對算法的描述.

五. 醫藥領域

1.?afdx: 提供在沒有黃金標準時，通過使用對數指數模型或潛在類別模型估計歸因分數來估計診斷測試的診斷性能（靈敏度、特異性、陽性預測值、陰性預測值）的功能.

2.?covidcast: 為Delphi 的 COVIDcast Epidata 提供接口，包括用于數據訪問、地圖和時間序列繪圖、基本信號處理的工具，以及與美國 COVID-19 大流行相關的眾多指標的集合.

3.?eventTrack: 在臨床試驗中實施用于事件預測的混合框架，如 Fang & Zheng (2011) 所述.

4.?goldilocks: 如 Broglio 等人所述?(2014)，使用分段指數模型和共軛 Gamma 先驗分布為事件結果的時間實現 Goldilocks 自適應試驗設計.

六. 科學

1.?CopernicusDEM: 使用AWS CLI命令行工具提供與歐洲航天局哥白尼DEM數字高程模型的接口，分辨率為90米和30米.

2.?nimbleCarbon: 在靈活的建模框架內，為放射性碳日期的貝葉斯分析提供函數和自定義概率分布，包括用于人口統計推斷的前后預測檢查的一套函數，如Crema&Shoda（2021）所述.

七. 統計領域

1. bayesmodels: 提供一個框架：將許多貝葉斯模型引入 tidymodels 生態系統.

2.?div: 提供幫助分析公司環境中團隊的功能，評估每個級別和工作的多樣性，搜索偏差，還提供模擬偏差影響的方法.

3.?HotellingEllipse: 提供計算Hotelling橢圓的半軸長度和坐標點的函數.

4.?makemyprior: 提供用于構造和可視化方差參數的聯合先驗的工具.

5.?Rage: 如Jones等人（2021）所述，提供使用矩陣人口模型（MPM）計算生命史指標的函數.

6.?unusualprofile: 提供函數來計算一組結果變量的每一行的馬氏距離.

八. 時間序列

1.?gsignal: 實現了Ovtave信號包，它提供了多種信號處理工具，如信號產生和測量、相關和卷積、濾波、濾波器設計、濾波器分析和轉換、功率譜分析、系統識別、抽取和采樣率變化等.

2.?legion:?提供用于實現多變量狀態空間模型（如向量指數平滑和向量誤差趨勢季節模型）的函數，用于時間序列分析和預測，如de Silva et al.（2010）所述.

九.?應用工具

1. parsermd: 使用 Boost Spirit X3 庫實現 R Markdown 文檔的正式語法和解析器。它還包括一組用于處理生成的抽象語法樹的高級函數.

2. riskmetric: 提供用于根據多個指標評估 R 包的工具，以幫助量化其穩健性.

3.?shinyvalidate: 通過在缺少所需輸入或輸入值無效時提供反饋，提供改善 Shiny 應用程序用戶體驗的功能.

4.?ttt: 提供工具來創建結構化、格式化的 HTML 表格.

十. 可視化

1.?fitbitViz: 實現與 Fitbit Web API 的連接，以提供 ggplot2、Leaflet 和 Rayshader 可視化.

2.?ggbreak: 提供用于為 ggplot2 設置軸中斷的比例函數.

3.?ggpp: 提供對ggplot2的擴展，以使用本機和npc數據坐標向繪圖添加插入.

4. ggseg: 實現一個ggplot geom，使用簡單的功能繪制大腦圖譜。包中最大的組件是兩個內置地圖集的數據.

5.?ichimoku: 實現Ichimoku Kinko-Hyo，也就是通常所說的云圖，包括靜態和交互式可視化，以及用于創建、回溯測試和開發定量Ichimoku策略的工具.

6.?liminal: 為高維數據探索性分析提供組合交互式可視化和創建鏈接交互式圖形的功能.

7.?mipplot: 提供通用功能，按照綜合評估建模聯盟（IAMC）提交格式生成面積圖、條形圖、方框圖和折線圖，以便可視化氣候遷移場景.

8.?qqboxplot: 將Q-Q箱線圖作為ggplot2的擴展實現.

說明：限于個人水平，錯誤之處難免，煩請批評指正，共同交流~

https://rviews.rstudio.com/2021/06/24/may-2021-top-40-new-cran-packages/

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的精选| 2021年5月R新包推荐(第54期）的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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