海哥，中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所，生物信息學(xué)博士。在生信寶典出品過多部“傻瓜式”教程。

生信寶典之傻瓜式 (一) 如何提取指定位置的基因組序列

生信寶典之傻瓜式 (二) 如何快速查找指定基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

生信寶典之傻瓜式 (三) 我的基因在哪里發(fā)光 - 如何查找基因在發(fā)表研究中的表達

生信寶典之傻瓜式 (四) 蛋白蛋白互作網(wǎng)絡(luò)在線搜索

生信寶典之傻瓜式 (五) 文獻挖掘查找指定基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

生信寶典之傻瓜式 (六) 查找轉(zhuǎn)錄因子的靶基因

這次海哥回北京，結(jié)合自己發(fā)表過的文章和其它經(jīng)典文章以及自己多年做研究的經(jīng)歷，從中心法則出發(fā)，為大家從不同層面介紹組學(xué)分析的手段，并解釋了不同方法都能解決什么具體的生物學(xué)問題。

本視頻內(nèi)容全面，簡單易懂，很適合想知道組學(xué)能做什么和生物數(shù)據(jù)分析沒有思路的朋友，能為你在學(xué)習(xí)、科研項目以及分析實戰(zhàn)的過程中提供很多的指導(dǎo)。

這次視頻最開始是在4天你也可以自己處理二代三代轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)最后一天的答疑課上給出的，很受好評，現(xiàn)分享與此。點擊閱讀原文即可限時免費觀看。

（海哥講述詼諧，這次錄制是其第二次講。有點遺憾的是，海哥自認(rèn)為沒有第一次講的好，如果有緣，希望能在易生信極高性價比暑期黑馬集訓(xùn) – 低至2500每人的暑期課上再講一次。）

下面是筆者自己觀看完視頻后的理解，蒼白的文字代表不了視頻，有狗尾續(xù)貂之嫌，還請見諒。

內(nèi)容概覽

形象地用盲人摸象闡述組學(xué)分析的優(yōu)勢

利用大數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)鳥和花的分布與云圖的關(guān)系，便于精準(zhǔn)救治。

大數(shù)據(jù)告訴你為什么科比是NBA最偉大的球員之一？如何防守庫里？

用傳統(tǒng)實驗得到的小數(shù)據(jù)去解釋生物學(xué)問題，就如同盲人摸象般，盡管可以比較精確地描述某一問題，但是由于找不到全局的聯(lián)系而無法全面地做出解釋。隨著新一代測序技術(shù)的發(fā)展，生物大數(shù)據(jù)分析越來越受到生物學(xué)家們的青睞，我們可以從各組學(xué)層面來了解某一生物樣本在某個狀態(tài)下的全貌。

1. DNA level

DNA level包括序列突變、插入、刪除、易位等，會影響到基因編碼、轉(zhuǎn)錄因子motif結(jié)合，并舉了“畫蛇也可添足”的例子闡述蛇中增強子區(qū)域序列突變影響到ETS1結(jié)合，進而足發(fā)育退化的故事。

之前的推文從Richard Young教授的系列研究看超級增強子發(fā)現(xiàn)背后的故事 (附超級增強子鑒定代碼)也介紹了一點增強子的知識和大牛的分析思路，可作為飯后閱讀小故事。

2. Transcriptional regulatory level

基因表達調(diào)控受轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合、組蛋白修飾、DNA甲基化等的影響，分析這些調(diào)控最常用的是ChIP-seq (詳細分析流程，調(diào)整下也可適用于ATAC-seq)，ATAC-seq和亞硫酸鹽測序等。這在之前的培訓(xùn)中也有部分提及，可在騰訊課堂看對應(yīng)視頻https://bioinfo.ke.qq.com。

第二張圖是常見的基因組瀏覽器的展示，可以查看某個區(qū)域多個維度的信息，具體使用見高通量數(shù)據(jù)分析必備|基因組瀏覽器使用介紹 - 3系列文章。

3. RNA level

RNA水平主要指RNA表達量變化、可變剪接形式變化、RNA修飾、編輯、非編碼RNA調(diào)控等，這些部分的實戰(zhàn)會在我們的易生信極高性價比暑期黑馬集訓(xùn)中講到。也可查看轉(zhuǎn)錄組分析的正確姿勢，轉(zhuǎn)錄組分析工具哪家強？和120分的轉(zhuǎn)錄組試題（第三份答案）等。

RNA m6A是研究的比較火的修飾，我們也在王秀杰研究組合作發(fā)現(xiàn)m6A修飾在小腦發(fā)育中的新功能 （附2018上半年m6A研究文章和點評）中做過一點總結(jié)。

4. Translational level

翻譯水平是從Ribosome結(jié)合的角度查看潛在的蛋白表達量。

5. Protein and metabolite level

蛋白質(zhì)組水平和代謝組水平，配合之前蛋白質(zhì)組學(xué)研究概述一起觀看。

感謝海哥的分享！在此將本視頻推薦給大家，點擊文末鏈接即可限時免費觀看。若您覺得不錯，請轉(zhuǎn)給更多需要的人。

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總結(jié)

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