高通量測序技術的發展使得數據的獲取越來越容易，數據也累計越來越多；

生物信息的發展為解析數據提出假說提供了很好的技術手段；

數據有了，分析結果有了，文章發表了，皆大歡喜。

然后呢？為我們出力的數據怎么處理？

鳥盡弓藏，兔死狗烹？

讓他們蜷縮在Excel里？ 讓他們沉睡在服務器上？

還是提供個在線平臺讓數據好好組織起來，更方便實驗室以后的查詢、分析和使用？

或者也可以成為自己研究的小領域的標準庫？

抑或是發表一篇10分的NAR文章？

下面就是2個很好的例子。

一個是中醫藥方劑的數據庫，收錄方劑、藥材、靶點、疾病、通路等信息，網站古色古香，設計精美，交互探索，網絡大氣，于2018年發表于NAR雜志。

表格展示太枯燥，關鍵信息交互式餅圖展示，查看，點擊篩選~~

現在數據庫升級第二版，更多功能，更多展示 （網絡圖比下面這個更漂亮，更有生物意義，更有交互性，只是暫時還不能釋放 o(╥﹏╥)o）。

另一個是Prophage hunter，在細菌基因組中尋找活性噬菌體。頁面極簡，定制基因組瀏覽器交互，于2019年發表于NAR雜志。

表格和基因組瀏覽器的雙向控制

做的更多的還是分子數據的展示，如轉錄組相關數據的展示。

首先展示下首頁，專業設計師私人定制，可以傳統，可以現代；可以功能為主，也可以輪播酷炫。

• 首頁搜索框全局搜索，類似谷歌，輸入基因名、通路名、功能關鍵詞皆可搜索。

• 小輪播展示網站可做的分析和結果展示，差異基因富集全套，還是交互式的。

• 四個餅圖聯動展示數據庫收錄的樣品和屬性信息，高端大氣顯地位。

那搜索一下，都展示哪些信息？基因，別名，公共數據庫鏈接，功能注釋，表達分布，PPI網絡，共表達網絡，想放啥放啥！

一個基因嫌少，來繪制一組基因的表達譜，修飾譜；同時展示甲基化修飾與基因表達的關系。

搜索太簡單了（其實功能很強大），可否更多條件搜索？

多組學如何展示？基因組瀏覽器可否嵌入？

基因組瀏覽器是多組學的展示利器，更多見：

• IGV基因組瀏覽器可視化高通量測序數據
• 高通量數據分析必備-基因組瀏覽器使用介紹 - 1
• 高通量數據分析必備-基因組瀏覽器使用介紹 - 2
• 高通量數據分析必備-基因組瀏覽器使用介紹 - 3

ChIP類數據同時展示IP, Input樣品豐度 （這個雙峰圖可拆可合）和peak信息，見下圖。

展示同源物種，也可以~

來點更多在線功能，樣品聚類、篩選、差異基因（樣品特異性基因）、功能富集

更多交互式圖，染色體圖譜、餅圖、箱線圖、交互式表

數據庫收錄樣本信息還有另外展示方式

這也是一個主頁風格，隨您定制。

更多地圖展示

時間軸變化來一個

訪問量統計頁來一個

以上列出一部分，更多數據庫還在建設中，發表后慢慢釋放，更多展示和需求也等您提出。

按捺不住了，來易漢博-生物信息數據庫和網站建設-專業團隊。

總結

以上是生活随笔為你收集整理的生物数据库建设，等你来~的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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