朋友發(fā)來一個公司的分析報價單，讓我看看。這些分析雖不是太懂，不過也了解一些。人的CIRCOS是畫過的，我的小破服務(wù)器（32核，256G內(nèi)存）處理起來沒任何壓力。一個家族基因鑒定、進化分析據(jù)說一臺普通筆記本都可以做。重復(fù)序列多時分析是困難些，50T內(nèi)存，倒顯得我孤陋寡聞了。

之前總有學(xué)員問起宏基因組分析需要內(nèi)存多大，我說300G起（尤其是Kraken1時，沒這么多內(nèi)存，數(shù)據(jù)庫索引都建不起來；當然也取決于數(shù)據(jù)量，一臺幾十G內(nèi)存的電腦也可以完成宏基因組大部分分析）。學(xué)員去問了其它知名博主，得到的回答是“你聽錯了，說的應(yīng)該是300G硬盤”。那如果看到這個50T的內(nèi)存會怎么想呢？順手查了下，50T確實也不算高。比如天河2號共有1.4PB內(nèi)存。這樣看，倒是小巫見大巫了。

1000000 CPU*H應(yīng)該是100萬CPU時間；假如是并行1000核，算一下需要41天 (1000000 / 1000 / 24 = 41.67)，我懷疑我算錯了？

如果用天河2號就快了，312萬個計算核心，也就是20分鐘的時間。

當然天河2號還不是最快的，看看下面這個表

沙特也在前10，有錢真好！不過石油也確實是需要用到大型計算的地方。記得10多年前在中科院計算所上課時，高性能計算老師講過，（那時）國內(nèi)的超級計算機都在每天哭窮的中石油、中海油等手里。

看到大型機，想起來有次坐公交車遇到一位老先生，軍工做大型機的。聊起來，問我做什么的？我說做IT的（生物信息解釋起來有些麻煩）。老大爺說工資應(yīng)該不錯吧，有1萬多吧？?這就尷尬了，剛說了做IT的就被問到工資，不能給IT丟臉啊，打腫臉充胖子，沒有也不能承認啊，心虛的點個頭，說了句“差不多”。接著又被老大爺刺激了，“我們單位做IT的小伙比你多多了~~~”

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總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的50T内存？百万机时？头一次见这么耗费内存和机时的分析？的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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