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用Python一次性把论文作图与数据处理全部搞定!

發(fā)布時(shí)間:2025/3/15 27 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 用Python一次性把论文作图与数据处理全部搞定! 小編覺(jué)得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.

一入科研深似海……

新年伊始,“防脫發(fā)用生姜還是黑芝麻?”,生信er們已經(jīng)開(kāi)始為自己所剩無(wú)幾的頭發(fā)發(fā)愁了。

文獻(xiàn)看到頭禿,前沿課題總無(wú)緣

置頂了一頁(yè)實(shí)驗(yàn)組微信群、QQ群,想追蹤前沿文獻(xiàn),了解跟自己課題組相關(guān)的科研潮流,拿到好的課題走上人生巔峰。

打開(kāi)手機(jī),刺眼的“99+”果斷讓人屏蔽群消息。

關(guān)注了幾十個(gè)相關(guān)學(xué)術(shù)話題,打開(kāi)知乎想搜搜大佬們的回答,卻刷了半個(gè)小時(shí)熱門(mén)推送——

才反應(yīng)過(guò)來(lái),“我剛剛要干嘛來(lái)著?”

好吧,那去知網(wǎng)和Web of Science一篇一篇看吧。

可是同一個(gè)文獻(xiàn)網(wǎng)站用的多了,往往會(huì)發(fā)現(xiàn)會(huì)有重復(fù)文獻(xiàn)出現(xiàn)。

文獻(xiàn)量龐大的話,還得手動(dòng)剔除已經(jīng)檢索過(guò)的文獻(xiàn),分辨哪些是后來(lái)更新的文獻(xiàn)。

每天除了吃飯睡覺(jué)做實(shí)驗(yàn)外,干的最多的活莫過(guò)于閱讀文獻(xiàn)了。

文章看得多了頭暈眼花,還影響做實(shí)驗(yàn)的時(shí)間,不知不覺(jué)就成了——

“月亮不睡我不睡,實(shí)驗(yàn)室禿頭小寶貝!”

這些時(shí)間如果能拿來(lái)休息,參加學(xué)術(shù)會(huì)議,和大牛們交流,學(xué)習(xí)新知識(shí)該多好~

“只有數(shù)據(jù)不分析怎么行”

猶記得我初入實(shí)驗(yàn)室,一拿到數(shù)據(jù)就想要跟師兄師姐邀功。

結(jié)果——

“學(xué)妹這樣不行的呀,共聚焦顯微鏡下拍攝的兩個(gè)探針的信號(hào),需要做共定位分析,去算一下共定位系數(shù)和 Pearson 相關(guān)系數(shù)吧。

數(shù)據(jù)圖除了做單因素方差分析還要重點(diǎn)看有沒(méi)有顯著性差異。”

以為拿到好數(shù)據(jù)就可以喘口氣,沒(méi)想到統(tǒng)計(jì)和作圖又開(kāi)始讓人頭禿。

作為一名科研人,不管愿意不愿意,總是讀文獻(xiàn)、做實(shí)驗(yàn)、寫(xiě)論文三點(diǎn)一線的。

于是就遇到一個(gè)難題,論文的數(shù)據(jù)都必須進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)處理。

90% 國(guó)際 SCI 臨床醫(yī)學(xué)雜志會(huì)對(duì)投稿文章進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)審稿,影響因子越高的期刊對(duì)統(tǒng)計(jì)學(xué)審稿要求也越嚴(yán)格。

看見(jiàn)師兄文章里明了高端的 PPI 圖、熱圖、富集圖、韋恩圖、和弦圖、火山圖和主成分分析圖,自己和他們的差距一目了然,發(fā)表SCI感覺(jué)遙不可期。

救救孩子的頭發(fā) T^T

不慌!

大數(shù)據(jù)時(shí)代,只要找準(zhǔn)科研方向,沒(méi)有什么是一波優(yōu)質(zhì)數(shù)據(jù)搞不定的?如果有,那就再配上信息挖掘和數(shù)據(jù)分析工具。

Python作為一款效率工具,在人工智能和數(shù)據(jù)分析等領(lǐng)域表現(xiàn)非常突出,像自動(dòng)抓取資料、分析數(shù)據(jù)、自動(dòng)下載,提取關(guān)鍵詞等這樣的功能都是分分鐘完成。

比如:我們需要大量的文獻(xiàn)做參考。

  • 以前需要打開(kāi)各類(lèi)學(xué)術(shù)網(wǎng)站,然后手動(dòng)一個(gè)一個(gè)下載需要的文獻(xiàn),然后再手動(dòng)進(jìn)行分類(lèi),得用上半天的時(shí)間才能夠解決這項(xiàng)重復(fù)的事情。

  • 而用Python,不僅能1 秒定位目標(biāo)文獻(xiàn),還能自動(dòng)對(duì)應(yīng)下載相關(guān)領(lǐng)域的關(guān)鍵文章、重要作者和科研熱點(diǎn),追溯文獻(xiàn)引證關(guān)系。

▲千條學(xué)術(shù)論文信息自動(dòng)抓取

這中間省下的時(shí)間,可以去學(xué)習(xí)(打球)、做實(shí)驗(yàn)(談戀愛(ài))......科研生活一下子就變得明亮了!

  • 在數(shù)據(jù)處理方面,我們可能要面對(duì)上萬(wàn)條序列的文件,由于文件過(guò)大,不要說(shuō)進(jìn)行處理了,連打開(kāi)文本都會(huì)直接卡死。

  • 而通過(guò)Python輸入原始數(shù)據(jù)后,不僅能自動(dòng)統(tǒng)計(jì)分析海量數(shù)據(jù),還能得到滿足論文發(fā)表的高質(zhì)量圖片。

▲自動(dòng)生成數(shù)據(jù)分析可視圖

這樣的效率和質(zhì)量,是不是又讓我們離發(fā)表SCI論文更近了一步?

這也是為什么,我這次想把扇貝的Python編程課推薦給大家的原因!一個(gè)讓我改變對(duì)編程固有認(rèn)知的地方,也希望這一次,能夠幫助到你。

很多人一提起Python,第一反應(yīng)就是,計(jì)算機(jī)?編程?太難了我學(xué)不會(huì)。

其實(shí)學(xué)Python,不用你英語(yǔ)數(shù)學(xué)有多好,不用你是理科生,你只需要:

認(rèn)識(shí)26個(gè)字母+記得一點(diǎn)初中的數(shù)學(xué)知識(shí)

課程好不好,學(xué)過(guò)就知道

左右滑動(dòng)查看更多

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的用Python一次性把论文作图与数据处理全部搞定!的全部?jī)?nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

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