生物信息的學習離不開Linux系統，不管自己寫命令處理數據，還是使用現有的工具。Linux對我們來講最重要的是它強大的命令行功能，可以快速、批量、靈活的處理數據的提取、統計和整理等耗時耗力的重復性工作。事實上在日常生信分析中，多數整理工作也都是用Linux命令的組合完成的，相比于寫完整的Python或Perl程序更簡便快捷；另外，生信分析用到的工具大都只在Linux下運行，而Linux發行版眾多，更新速度不一，軟件的安裝是一個令人頭大的事情。

另外對我們大部分朋友來說，接觸電腦一直都是圖形界面系統，通過單擊、雙擊打開文件、切換目錄、安裝運行軟件都已經運用的得心應手，對文件路徑的概念也不太關注。乍一接觸Linux，會對其組織邏輯不適應，生信寶典公眾號最開始推出Linux教程就是關于文件和目錄的描述，以及與Windows系統的對應，方便做一個快速切換。

文后列出的Linux教程是屬于比較精簡的生信工作者常用的命令和命令組合。與傳統的Linux書籍不同的地方有兩點，

摒棄大部分用不到的Linux命令，只保留生信常用的，學習起來更有的放矢。

增加生信實戰中Linux命令的組合，這是通用Linux教程中所沒有的。通用教程只會提供一塊塊磚，我們是提供組合好的模塊，直接可以應用，避免只見樹木不見森林。

教程有了，還需要一個練習的環境。如果不熟悉Linux時自己安裝是比較麻煩的，所以可以借助在線免費平臺進行練習。這又體現了我們的教程的又一好處，測試數據自帶于教程中，不依賴外部數據的導入，保證了自身的完整性。

推薦的免費平臺有2個：linuxzoo和codenvy。

linuxzoo

訪問網址：http://linuxzoo.net/，按下圖生信寶典錄制的動畫所示用郵箱注冊，注冊完之后理解可以使用。收到激活郵件點擊后，可永久使用。

注冊后，按圖示點擊選擇喜歡的操作系統，這里選的是默認的Centos，然后就可以connect。最簡單的打開方式是直接在瀏覽器打開使用, 點擊JScript Telnet即可跳轉登錄界面。如果用根用戶登錄，輸入用戶名root和密碼secure。其它用戶名和密碼都在首頁展示，自己查詢即可獲得。

linuxzoo優點是有根用戶權限，缺點是不能連接外網，但不影響我們大部分代碼的練習。

CODENVY

訪問網址：http://codenvy.io/，也需要先注冊，如果有Github和谷歌賬號的話，可以直接登錄。然后按圖示Create Workspace，任選一個STACK就可以，都是基于Ubuntu系統的，然后等待完成初始化，即可使用了。

優點是有根用戶權限，同時可以連接外網。

教程合集

后臺回復 “生信寶典福利第一波” 獲取完整版教程。

生信寶典-Linux教程.pdf

生信寶典Py3_course.pdf

生信寶典-R學習教程.pdf

系列教程

• 生物信息之程序學習
• 關于編程學習的一些思考
• 該如何自學入門生物信息學
• 如何優雅的提問
• 生信寶典視頻教程
• 生信的系列書籍

Linux

• Linux - 文件和目錄
• Linux - 文件操作
• Linux - 文件內容操作
• Linux - 環境變量和可執行屬性
• Linux - 管道、標準輸入輸出
• Linux - 命令運行監測和軟件安裝
• Linux - 常見錯誤和快捷操作
• Linux - 文件列太多，很難識別想要的信息在哪列；別焦急，看這里。
• Linux - 文件排序和FASTA文件操作
• Linux - 應用Docker安裝軟件
• Linux - Conda軟件安裝方法
• Linux - 服務器數據定期同步和備份方式
• Linux - VIM的強大文本處理方法
• Linux - 查看服務器配置信息
• Linux - SED操作，awk的姊妹篇
• Linux - 常用和不太常用的實用awk命令
• Linux - 那些查找命令
• Linux - 原來你是這樣的軟連接
• Bash概論 - Linux系列教程補充篇

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的免费Linux系统和生信宝典原创学习教程的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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