常規轉錄組是我們最常接觸到的一種高通量測序數據類型，其實驗方法成熟，花費較低，是大部分CNS必備的技術，現在就如做個PCR一樣常見。而且分析思路簡潔清晰，是入門生信，學習生信分析思路和數據可視化的首選。

數據分析是相通的，通過一個簡單的課程理解其中的原理，就可以推而廣之，延伸到其它類型的數據分析，如擴增子、宏基因組、單細胞等。

高級轉錄組分析和R數據可視化在線下舉辦了11期，目前因疫情停掉了線下課程，全部轉為視頻課，并定期提供群內文字指導和群視頻指導。本課程系統講述基于和不基于比對的轉錄組分析流程，從原始數據到表達矩陣、差異基因（批次處理）、可變剪接、富集分析、加權共表達網絡、通路分析、可視化繪圖等一系列常見操作，理論和實踐兼備。

課程大綱

該課程整合了線下舉辦的11期內容，整個過程都比較成熟，可以在最短時間學習最多知識。后續也根據學員學習過程中提出的問題增錄新的視頻章節，繼續完善更新。點擊閱讀原文跳轉課程頁面。

往期評價

教程內容簡介如下：

轉錄組的應用、設計和案例分享

轉錄組學研究技術介紹

轉錄組學實驗設計和測序原則、注意事項

二代、三代測序過程和原理解析

轉錄組學文章案例分析

在線基因表達資源數據庫

轉錄組分析流程實戰

轉錄組分析流程評估

測序數據質量評估和清洗

不基于比對的差異基因分析

基于比對的差異基因分析

轉錄本組裝和選擇性剪接分析

目標基因GSEA/GO富集分析

轉錄組高級分析

WGCNA基因共表達分析

WGCNA基因、表型關聯分析

Cytoscape 共表達網絡繪制

轉錄組常見圖形在線繪制

KEGG/Reactome通路圖繪制，表達映射

基因互作的文獻挖掘和數據庫挖掘展示

常見圖表解讀和圖形編輯排版

在培訓上，結合發表高水平文章，進一步講解16種常用分析圖的原理和使用范圍，讓你不僅讀懂圖，更知道如何應用于自己的研究，并親自輕松完成繪圖。

針對大家使用R語言繪圖學習時間成本較高的問題，易生信團隊針對常用16種圖開發了免費繪圖網站，一鍵出圖，更可鼠標點選參數修改圖形的個性樣式。

成果發表是科研過程中不可缺的一部分，發表成果又少不了圖形展示。文章圖表排版是否整齊規范、協調一致、重點突出對一篇文章的發表也是有不少貢獻的。之前推出的文章發表圖的修改和排版講演了部分圖形編輯和排版操作，本次培訓也會實踐從原始圖形、到細節修飾再到排版發表的整個過程和注意事項。基因組瀏覽器用于多組學數據的可視化和關聯分析，本地有IGV，在線有UCSC genome Browser和Epigenomebrowser，各有特色。

生信基礎知識

Linux/Windows下Rstudio和Linux命令的使用

Linux/Windows下轉錄組分析流程的搭建

生物學家必要掌握的Shell和R語言基礎知識。

(如果基礎薄弱，報名付款成功后，可免費領取基礎程序課，做好準備工作,?讓程序成為我們的得力工具而不是學習新知識的絆腳石。)

定制內容

如果您看到文章中有哪些圖或分析工作需要重現，也請提出，一起講述。

如果您有其它關注的問題，也請報名時提出，把這次課程變成您的定制講解。

120分的轉錄組試題（第一份答案）

120分的轉錄組試題（第二份答案）

120分的轉錄組試題（第三份答案）

易生信系列培訓課程，掃碼獲取免費資料

更多閱讀

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生信學習視頻?PPT?EXCEL?文章寫作?ggplot2

海哥組學?可視化套路?基因組瀏覽器

色彩搭配?圖形排版?互作網絡

自學生信?2019影響因子?GSEA?單細胞?

后臺回復“生信寶典福利第一波”獲取教程合集

總結

以上是生活随笔為你收集整理的高级转录组分析和R语言数据可视化课程全部转为视频课的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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