国际上首次报道的非人灵长类胰岛衰老的单细胞转录组图谱
近30年來,隨著人口老齡化,我國(guó)糖尿病的發(fā)病率急劇攀升。目前,全國(guó)糖尿病患者總數(shù)已經(jīng)超過一個(gè)億,并且有近五億成年人處于糖尿病前期(糖耐量受損),這已對(duì)我國(guó)衰老相關(guān)慢性病的防治構(gòu)成嚴(yán)峻的挑戰(zhàn)。
伴隨增齡的胰島細(xì)胞功能退行會(huì)致使機(jī)體無法正常響應(yīng)血糖變化,從而對(duì)血糖的調(diào)節(jié)能力(即糖耐量)下降,引發(fā)糖代謝紊亂,最終發(fā)展為糖尿病,并伴隨血管、視網(wǎng)膜、腎臟、神經(jīng)系統(tǒng)等一系列組織器官的代謝異常。因此,鑒定胰島細(xì)胞中對(duì)衰老易感的細(xì)胞類型,揭示胰島衰老過程中細(xì)胞分子退行性變化規(guī)律,發(fā)掘干預(yù)糖耐量下降的關(guān)鍵靶標(biāo),對(duì)于延緩胰島衰老、精準(zhǔn)防治糖尿病至關(guān)重要。然而,胰島細(xì)胞的組成具有高度異質(zhì)性,包含多種分泌不同種類激素的細(xì)胞類型;此外,受限于倫理和樣本獲取的技術(shù)難度,年齡性別嚴(yán)格匹配的高質(zhì)量人類胰島樣本難以獲取,這些因素極大地制約著靈長(zhǎng)類胰島細(xì)胞衰老的機(jī)制探究。
2020年6月10日,中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所曲靜研究組、劉光慧研究組、北京大學(xué)湯富酬研究組與中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所張維綺研究組合作在《National Science Review》雜志在線發(fā)表題為“A single-cell transcriptomic atlas of primate pancreatic islet aging”的研究論文。該研究系統(tǒng)繪制了非人靈長(zhǎng)類胰島衰老高精度的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄圖譜,揭示了蛋白穩(wěn)態(tài)失衡是胰島β細(xì)胞衰老的關(guān)鍵特征和分子驅(qū)動(dòng)力。
研究人員采用高精度單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù),描繪了α細(xì)胞、β細(xì)胞、δ細(xì)胞和PP細(xì)胞等多種胰島細(xì)胞的基因表達(dá)特征,并鑒定出一系列新型分子標(biāo)志物。
通過衰老轉(zhuǎn)錄噪音分析、衰老標(biāo)志物分析以及與衰老/糖尿病等數(shù)據(jù)庫的聯(lián)合分析,發(fā)現(xiàn)相比于其它細(xì)胞類型,α細(xì)胞和β細(xì)胞在衰老過程中更容易發(fā)生異常變化。通過差異表達(dá)基因的功能富集、基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、細(xì)胞間相互作用等多角度分析,系統(tǒng)解析α細(xì)胞和β細(xì)胞的衰老相關(guān)分子譜變化。
值得關(guān)注的是,研究人員發(fā)現(xiàn)衰老導(dǎo)致β細(xì)胞中蛋白穩(wěn)態(tài)嚴(yán)重受損,其具體表現(xiàn)為年老個(gè)體β細(xì)胞中蛋白聚集體的異常積累,以及未折疊蛋白響應(yīng)通路(unfold protein response pathway,UPR)中ATF6和IRE1信號(hào)通路組分表達(dá)異常上調(diào),尤其是內(nèi)質(zhì)網(wǎng)分子伴侶蛋白HSP90B1在年老個(gè)體β細(xì)胞中表達(dá)上調(diào)。進(jìn)一步的研究表明,在β細(xì)胞中過表達(dá)HSP90B1,可以導(dǎo)致高濃度葡萄糖刺激下胰島素分泌減少,說明HSP90B1在β細(xì)胞中的增齡性表達(dá)上調(diào)可能是老年人糖耐量降低的驅(qū)動(dòng)力。
圖. 靈長(zhǎng)類胰島衰老的高分辨率單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組圖譜研究
該研究在國(guó)際上首次報(bào)道了非人靈長(zhǎng)類胰島衰老的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組圖譜,不僅系統(tǒng)解析了靈長(zhǎng)類胰島中多種細(xì)胞類型的衰老分子特征,而且揭示了蛋白穩(wěn)態(tài)失衡是胰島β細(xì)胞衰老的驅(qū)動(dòng)因素,為延緩胰島衰老、恢復(fù)老年個(gè)體的糖耐量提供潛在干預(yù)靶標(biāo),為有效預(yù)防和治療糖尿病提供全新思路。
該研究由中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所、北京大學(xué)、中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所、中國(guó)科學(xué)院生物物理研究所、首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院、美國(guó)索爾克研究所、北京醫(yī)院等機(jī)構(gòu)合作完成。中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所李靜宜副研究員、北京大學(xué)博士研究生鄭宇軒、中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所博士研究生顏鵬澤、宋默識(shí)研究員以及王思副研究員為并列第一作者。中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所曲靜研究員、北京大學(xué)湯富酬教授、中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所劉光慧研究員、中國(guó)科學(xué)院北京基因研究組所張維綺研究員為共同通訊作者。該研究受到中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所周琪院士、宣武醫(yī)院陳彪教授、北京醫(yī)院孫亮教授的指導(dǎo)與支持,獲國(guó)家科技部、國(guó)家自然科學(xué)基金委、中國(guó)科學(xué)院和北京市等項(xiàng)目資助。
文章鏈接:https://academic.oup.com/nsr/advance-article/doi/10.1093/nsr/nwaa127/5855510#
你可能還想看
如何火眼金睛鑒定那些單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組中的混雜因素
什么?你做的差異基因方法不合適?
單細(xì)胞分群后,怎么找到Marker基因定義每一類群?
哇!單細(xì)胞測(cè)序-配體受體互作分析原來可以這么簡(jiǎn)單又高大上!
往期精品(點(diǎn)擊圖片直達(dá)文字對(duì)應(yīng)教程)
后臺(tái)回復(fù)“生信寶典福利第一波”或點(diǎn)擊閱讀原文獲取教程合集
總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的国际上首次报道的非人灵长类胰岛衰老的单细胞转录组图谱的全部?jī)?nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
- 上一篇: 续昨天的文章,在火山图标记基因名字
- 下一篇: 图像处理包magick - R版的PS