易生信九天的转录组分析培训班总结
易生信九天的轉(zhuǎn)錄組分析培訓(xùn)班第一期伴隨著5個小時的考試在緊張中結(jié)束了。說是培訓(xùn),倒不如研討更確切些。在一個個問題的交流中學(xué)會轉(zhuǎn)錄組分析,效果遠(yuǎn)大于一人講,自己練。
先分享兩張現(xiàn)場的照片
前兩天以集中講練為主,在講述了原理后,進(jìn)行上機(jī)操作。大部分學(xué)員有一定的Linux和R基礎(chǔ),上手還都是比較快的。但也有一些共性的問題,比如一些步驟原理的理解不到位、一些軟件的參數(shù)不太了解、對Linux路徑概念不太熟悉、想修改參數(shù)又不了解其含義、不熟悉如何查找?guī)椭取?/p>
課堂上,在助教的幫助下,都解決了這些問題。但依然還會有部分問題會在后面5天的實(shí)戰(zhàn)中被反復(fù)提及。因此在最后的串講中和最后錄制的視頻中對這些問題進(jìn)行了重點(diǎn)論述。
9天下來,總體感覺是大家都進(jìn)步很大,對轉(zhuǎn)錄組分析的原理有了更深的了解、能獨(dú)立完成流程操作,并拓展應(yīng)用到自己的數(shù)據(jù)分析。
這從提問的問題就可以清晰地看出,開始問題主要是課程提供的代碼運(yùn)行的問題,實(shí)戰(zhàn)5天后則更多地集中到應(yīng)用于自己的數(shù)據(jù)分析時遇到的問題。讓整個講解和答疑更有針對性,也能更實(shí)現(xiàn)學(xué)以致用,而不是只會處理培訓(xùn)數(shù)據(jù)。
9天的培訓(xùn)雖然還不能達(dá)到很熟練的地步,但總體上學(xué)會了轉(zhuǎn)錄組分析,和一定的解決問題的能力,也算是完成了培訓(xùn)研討的目的。
相信伴隨著我們提供的視頻課程和后期在配套論壇中的繼續(xù)答疑,大家很快都能獨(dú)擋一面,并能把分析拓展到轉(zhuǎn)錄組之外的其它高通量測序領(lǐng)域。
在培訓(xùn)過程中,發(fā)現(xiàn)打好基礎(chǔ)對后續(xù)分析的學(xué)習(xí)是必須的,也更有應(yīng)用普遍性,所以組織了生物信息作圖系列R、Cytoscape及圖形排版 和 應(yīng)用Python處理生物信息數(shù)據(jù)和作圖,希望更多朋友加入,一起學(xué)習(xí)。
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