gene structure

transcription

1.DNA上有轉錄啟動位點和終止位點，RNA聚合酶結合到上面，得到RNA（primary transcript）
2.RNA被切掉內含子，加上5帽子和3尾巴，得到成熟mRNA（RNA-seq研究對象）
3.mRNA到核外，翻譯成蛋白。

可變剪切

可變剪切又叫選擇性剪切（Alternative splicing, AS），生物的基因序列包含了外顯子（exon）和內含子（intron），兩者相互間隔。在mRNA前體的剪接過程中，參加剪接的外顯子可以不按其線性次序剪接，內含子也可以不被切除而保留，即一個外顯子或內含子是否出現在成熟mRNA中是可以選擇的，轉錄組復雜原因之一。

剪切分類：http://mp.weixin.qq.com/s/2EC2NRPNxj_ZeNWv7qCb_w

Transcript vs isoform vs transcript variant

transcript:?an expressed sequence

?

isoform：同一個基因的不同版本的蛋白，可由AS產生(one of splice variants)

transcript variant：同一個基因的不同mRNA transcript

?

轉載于:https://www.cnblogs.com/xiaoxiaoxiaoxue/p/9987302.html

總結

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