m1<-seq(3)

rm(m1)

gc()

?

install.packages("biglm",dependencies=T)

?

?

linux下R可使用的最大內存是？

(9 篇回復)?(5 個人參與)

• 發(fā)表于 2 年 之前，作者：cyy024
• 來自 houliping 的最后回復
• (沒有相關主題)

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1樓

cyy024

新手上路
注冊于: 2008/01/08
發(fā)帖數(shù): 14

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服務器是16g的內存，
R的內存是不是也可以用到16g
要用什么函數(shù)增加內存嗎？memory.list在linux下不適用。

謝謝！2 年 前回復 #?回復

2樓

pengchy

常規(guī)會員
注冊于: 2007/01/02
發(fā)帖數(shù): 311

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你可以看看R-admin文檔的8 Choosing between 32- and 64-bit builds（第22頁）2 年 前回復 #?回復

3樓

pengchy

常規(guī)會員
注冊于: 2007/01/02
發(fā)帖數(shù): 311

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在linux下，可以通過下面這個方式來增加R使用的內存，如果不行就多試幾次，每次的結果可能會不一樣。
在shell下啟動R
R --max-vsize=3G2 年 前回復 #?回復

4樓

cyy024

新手上路
注冊于: 2008/01/08
發(fā)帖數(shù): 14

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謝謝大家的幫助。
我按照上面的幫助把內存調大了。嘗試讀入了一個6g的數(shù)據(jù)，但是，我想做回歸分析缺失敗了。
報錯原因是：Error: cannot allocate vector of size 2.8 Gb
是不是回歸分析只能支持2.8g的數(shù)據(jù)呢？2 年 前回復 #?回復

5樓

劉思喆

版主
注冊于: 2006/06/26
發(fā)帖數(shù): 1,387

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如果是 lm 的話，你可以試一試 biglm 包： bounded memory linear and generalized linear models2 年 前回復 #?回復

6樓

sociology

初級會員
注冊于: 2006/11/13
發(fā)帖數(shù): 195

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引用第3樓cyy024于2009-06-30 09:50發(fā)表的??:
謝謝大家的幫助。
我按照上面的幫助把內存調大了。嘗試讀入了一個6g的數(shù)據(jù)，但是，我想做回歸分析缺失敗了。
報錯原因是：Error: cannot allocate vector of size 2.8 Gb
是不是回歸分析只能支持2.8g的數(shù)據(jù)呢？ [url=http://cos.name/bbs/job.php?action=topost&tid=15635&pid=73614][/url]


你一個回歸模型中就需要所有6G的數(shù)據(jù)嗎？如果不是，那就只導入需要的數(shù)據(jù)。
如果還是不行，那就試一下biglm.2 年 前回復 #?回復

7樓

cyy024

新手上路
注冊于: 2008/01/08
發(fā)帖數(shù): 14

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繼續(xù)發(fā)問題：
biglm包怎么安裝？
參考了statistic with R上關于安裝package的說明如下：
R CMD INSTALL Rgraphviz 1.5.0.tar.gz
echo /usr/lib/graphviz/ >> /etc/ld.so.conf
ldconfig
ln -s /usr/lib/graphviz/*.so* /usr/local/lib/?

我做了如下程序：
(1)R CMD INSTALL biglm_0.7.gz
結果：
* Installing to library '/home/work/R-2.9.0/library'
* Installing *binary* package 'biglm' ...
* DONE (biglm)
(2)echo /home/work/R-2.9.0/library/biglm >>/etc/ld.so.conf
ldconfig
(3)ln -s /home/work/R-2.9.0/library/biglm /*.so*?? /usr/local/lib/
可是biglm目錄下沒有*.so*文件

以上步驟有哪里不對嗎？謝謝大家指導!2 年 前回復 #?回復

8樓

劉思喆

版主
注冊于: 2006/06/26
發(fā)帖數(shù): 1,387

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應該是 OS 上 R 的依賴庫沒有裝全，這個比較麻煩2 年 前回復 #?回復

9樓

houliping

初級會員
注冊于: 2006/11/26
發(fā)帖數(shù): 65

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引用第6樓cyy024于2009-07-01 10:55發(fā)表的??:
繼續(xù)發(fā)問題：
biglm包怎么安裝？
參考了statistic with R上關于安裝package的說明如下：
R CMD INSTALL Rgraphviz 1.5.0.tar.gz
echo /usr/lib/graphviz/ >> /etc/ld.so.conf
....... [url=http://cos.name/bbs/job.php?action=topost&tid=15635&pid=73691][/url]


沒必要這么復雜。你用的是linux的哪個發(fā)行版？建議直接在R里面運行install.packages("biglm",dependencies=T)命令安裝biglm擴展包。2 年 前回復 #?回復

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的R练习的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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