公眾號(hào)：生物信息學(xué)習(xí)

ggplot2畫圖時(shí)出現(xiàn)重合的點(diǎn)以及標(biāo)簽如何處理?有現(xiàn)成的包ggrepel?mp.weixin.qq.com

在R中散點(diǎn)圖的時(shí)候會(huì)經(jīng)常出現(xiàn)，點(diǎn)重合，點(diǎn)的標(biāo)簽重合比較嚴(yán)重的現(xiàn)象，這對(duì)我們觀察數(shù)據(jù)有很大的干擾。

用ggrepel包可以很好的解決這個(gè)問題。

當(dāng)我們創(chuàng)建一個(gè)數(shù)據(jù)框

a<-data.frame(num=c(1,2,3,1,4),n=2,name=c("a","b","c","d","e"))

給出的結(jié)果如下：

num n name 1 1 2 a 2 2 2 b 3 3 2 c 4 1 2 d 5 4 2 elibrary(ggplot2) ggplot(a)+geom_point(aes(n,num),color="red")+geom_text(aes(n,num,label=name))

便簽展示如上圖所示，a和d重合，那如何把這兩個(gè)標(biāo)簽分開展示呢，ggrepel就派上用場了。

基本款：

library(ggrepel) ggplot(a)+geom_point(aes(n,num),color="red")+geom_text_repel(aes(n,num,label=name))

其中a和d分開展示。當(dāng)然圖形也有很多可以修改的地方：

ggplot(a)+geom_point(aes(n,num),color="red")+geom_label_repel(aes(n,num,label=name))

展示的圖形就如下所示：

如果還不喜歡，可以再根據(jù)自己的需求去改。

大部分geom_text()的參數(shù)都適用于geom_text_repel(),除了以下幾個(gè)：

• hjust
• vjust
• position
• check_overlap

ggrepel包為geom_text_repel()與geom_label_repel()提供了特有的參數(shù)設(shè)置：

• segment.color:連接點(diǎn)與標(biāo)簽的線段的顏色
• segment.size:線段的粗細(xì)
• segment.alpha:線段的透明度
• box.padding:文本框周邊填充
• point.padding:點(diǎn)周圍填充
• arrow:grid:arrow提供的箭頭
• force:強(qiáng)制性將重疊文本散開
• max.oter:最大迭代次數(shù)
• nudge_x/y:標(biāo)簽開始位置在坐標(biāo)軸的移動(dòng)距離
• direction:允許標(biāo)簽的方向，x、y or both

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總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的ggplot2设置坐标轴范围_ggplot2画图时出现重合的点以及标签如何处理?有现成的包ggrepel的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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