原標題：GraphPad Prism繪制劑量反應(yīng)曲線

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上圖是Sci文獻中的dose–response curves (劑量反應(yīng)曲線)，橫坐標是藥物GS-Se-SG濃度的對數(shù)值，縱坐標是Rrelative cell viability(相對細胞活性,% of control)，從圖注中可以知道IC50為5.1 μM。那么什么是IC50呢？

IC50(half maximal inhibitory concentration)是指被測量的拮抗劑的半抑制濃度。它能指示某一藥物或者物質(zhì)(抑制劑)在抑制某些生物程序(或者是包含在此程序中的某些物質(zhì)，比如酶，細胞受體或是微生物)的半量。在凋亡方面，可以理解為一定濃度的某種藥物誘導(dǎo)腫瘤細胞凋亡50%，該濃度稱為50%抑制濃度，即凋亡細胞與全部細胞數(shù)之比等于50%時所對應(yīng)的濃度。

IC50值可以用來衡量藥物誘導(dǎo)凋亡的能力，即誘導(dǎo)能力越強，該數(shù)值越低，當然也可以反向說明某種細胞對藥物的耐受程度。接下來我將使用GraphPad Prism5.0(win7，64位系統(tǒng))繪制劑量反應(yīng)曲線并計算IC50。

數(shù)據(jù)格式

A列為拮抗劑的濃度，濃度由小至大(0.625——10 mM)，B-I (5個橫排)為該濃度所對應(yīng)的8個復(fù)孔的OD值除以對照組吸光度的平均值，然后轉(zhuǎn)化為百分比。

步驟

Step1

打開GraphPad Prism 5.0，XY,選擇Points only，Y輸入8(因為數(shù)據(jù)每個拮抗劑濃度有8個復(fù)孔)replicate values in side-by-side subcolumn，Create。

Step2

輸入數(shù)據(jù)；

在Graphs下可以看見此時數(shù)據(jù)Data1的圖形；

Analyze，Transform，ok。

Parameters:Transform，選擇Transform X values using X=Log(X)->ok。

Graphs下經(jīng)過轉(zhuǎn)換數(shù)據(jù)的圖形如下：

Step3

Analyze，XY analyzes，Nonliner regression (cure fit)，ok。

Dose-Response-Inhibition,選擇log(inhibitor) vs. Normalized response—Variable slope,ok。

此時Graphs下經(jīng)過計算得到的圖形如下：

進行美化后最終效果如下(注：繪圖時選擇的Mean and Erroe：SEM，數(shù)據(jù)比較集中所以看起來像沒有Error bar，修改為SD后可以看到Error bar，修改方法見GraphPad 繪制折線圖或視頻操作中)：

在Data with Results下可以看見……Nonlin fit of Transform of Data1的結(jié)果：

在Best-fit values下，在橫坐標Log(抑制劑濃度)在0.6041時細胞的活性剛好為50%，故該拮抗劑的半抑制濃度為IC50=4.019 mM

責任編輯：

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的graphpad 折线图横坐标比例_GraphPad Prism绘制剂量反应曲线的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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