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编程问答

MPICH 完整配置存档

發(fā)布時間：2025/3/21 编程问答 27 豆豆

生活随笔收集整理的這篇文章主要介紹了 MPICH 完整配置存档小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.

MPICH? 完整配置存檔

提問：chkconfig time on

???? /etc/sysconfig/network-scripts

?????? netconfig -d eth0 --ip=192.168.1.33 --netmask=255.255.255.0 --gateway=192.168.1.253

???? 網(wǎng)關(guān)是DHCP代理服務(wù)器的IP

???? 網(wǎng)關(guān)設(shè)置為…….253? #關(guān)聯(lián)到 arp – a| awk

???? 不能與網(wǎng)段相同

后面可能要涉及 ,rlogin,telnet,rsh,time等服務(wù) ntsysv

自動配置腳本:

先配ssh,再nfs,再nis

/etc 包含大多數(shù)系統(tǒng)配置文件和初始化腳本

默認(rèn)mpich2安裝位置: /home/cluster/mpich2

參考:redhat enterprise linux 服務(wù)器配置與應(yīng)用實(shí)戰(zhàn)指南

北京:人民郵電出版社 :2007.10

環(huán)境：

注：心跳線，即為內(nèi)網(wǎng)

主機(jī)0：? 外部聯(lián)網(wǎng)：10.10.10.2,192.168.1.1（心跳線） node1-9

客戶端1：外部聯(lián)網(wǎng)：10.10.10.3,192.168.1.10（心跳線） node10

客戶端2：外部聯(lián)網(wǎng)：10.10.10.4,192.168.1.11（心跳線） node11

NFS:? 共享目錄 /home/cluster

NIS域名： cluster

無主機(jī)域名：

NIS安裝：默認(rèn)

NFS安裝:默認(rèn)

MPICH: /home/cluster/mpich2

log:make.log

運(yùn)行程序: /home/cluster/code

Vmware可選改變配置：

HKEY_LOCAL_MACHINE/SYSTEM/CurrentControlSet/Services/VMnetDHCP/Parameters/VirtualEthernetSegments/1

192.168.0.16

vmnetdhcp.conf??? 改網(wǎng)段與ip

宿主機(jī)服務(wù) vmware dhcp service 重啟

網(wǎng)卡也重啟

4,配置雙網(wǎng)卡：

主從服務(wù)器時的配置：

1，創(chuàng)建共享磁盤：

?? *一塊已有的系統(tǒng)盤；

?? 一塊仲裁盤：分兩個相同的分區(qū)，做成裸設(shè)備--存放群集信息；取名為： arbitrate.vmdk

?? 一塊數(shù)據(jù)盤：用于存放apache群集數(shù)據(jù)；取名為： share.vmdk

?? 添加新磁盤時，必須更改磁盤總線接口為SCSI2:0和SCSI2:1總線(可自定義），但必須與系統(tǒng)盤總線不在同一條線上；

?? 虛擬機(jī)配置文件的修改，禁用磁盤鎖定功能；
? ?在各個虛擬機(jī)配置文件名是：Red Hat Linux.vmx
? ?是一個configuration配置文件（看文件類型），用記事本打開在其中最后加入：
? ?disk.locking="false"

2,在主結(jié)點(diǎn)配置共享磁盤：

　1,Fdisk –l 查看

? 2, raw 設(shè)備

在兩臺服務(wù)器上分別編輯/etc/sysconfig/rawdevices文件，將分區(qū)綁定到裸設(shè)備。
#vi /etc/sysconfig/rawdevices
加入
/dev/raw/raw1 /dev/sdb1
/dev/raw/raw2 /dev/sdb2
重啟服務(wù)
#service rawdevices restart
啟動完成后執(zhí)行
＃raw –qa

3,<4.4>格式化數(shù)據(jù)分區(qū)：
? ?? ?#mkfs.ext3??/dev/sdc1

主結(jié)點(diǎn)配置：

一,準(zhǔn)備：

提示：　可以使用命令 ntsysv　一次設(shè)置好相應(yīng)項目的開機(jī)啟動,與chkconfig on? 原理相同

1,查看防火墻狀態(tài)：service iptables status

關(guān)閉防火墻： service iptables stop

設(shè)置開機(jī)不啟動防火墻: chkconfig iptables off

2,hostname node1

3,/etc/hosts文件：至少需要有個 NIS 服務(wù)器的 IP 與主機(jī)名對應(yīng)

　　　192.168.1.1? node1

192.168.1.10? node10

192.168.1.11? node11

#192.168.1.12? node12

127.0.0.1 ? localhost.localdomain localhost

4,network文件

修改主機(jī)名：
? ?#vi??/etc/sysconfig/network

? ?HOSTNAME=hostname

5,創(chuàng)建/etc/hosts.equiv

???? 以上這步放在配置mpich2處

node1? #給自己放權(quán)，這樣在只有一臺機(jī)器時也可以模擬并行計算環(huán)境

node10

node11

6,掛載文件系統(tǒng)

二，配置NFS

1,安裝nfs軟件包：

Nfs-utils?? 光盤2

Portmap? 光盤2

rpm –qa |grep nfs

rpa –qa |grep portmap

rpm? –ivh? nfs-utils

2, Showmount?? -e? 127.0.0.1? 查看當(dāng)前目錄下發(fā)布多少共享目錄
Showmount?? -e? 192.168.1.10? 查看當(dāng)前目錄下共享了服務(wù)的目錄

2.5 ?chmod 755 /home

???? chmod? 777 /home/cluster

說明：必須注意home/目錄的訪問權(quán)限，必須設(shè)置成777權(quán)限；父目錄/home權(quán)限無要求，普通的755即可；

3,? /etc/exports 文件

加入：　如：共享目錄 [客戶端1 參數(shù)] [客戶端2 參數(shù)]

例1: /home/cluster ?192.168.1.0/24(rw,sync)?? sync 表示同步? rwx

/temp? 192.168.1.0/24(ro)??? 允許這個網(wǎng)段，只讀

或如 :/temp?? *(ro)?? 192.168.1.78(rw)

例２：exportfs –a? 查看所有

4,啟動服務(wù)進(jìn)程

chkconfig nfs on
????? chkconfig portmap on
????? #chkconfig nfslock on
????? service portmap start
????? #service nfslock start? ?
????? service nfs start

三，配置NIS

0,主要流程:

(1)? 設(shè)置　nis 域名

(2)? ?主配置文件

(3)? 　創(chuàng)建nis 數(shù)據(jù)庫

(4)? ?建立信任群

(5)? ?更新加載配置文件或重新啟動nfs服務(wù)，使配置生效

1,安裝

ypserv? 光盤3
- ?? ypbind? 1
- ?? portmap 2
- ?? yp-tools? 1

Rpm –qa |grep yp? 查詢

Rpm? –ivh? ypserv 安裝

mount? /dev/cdrom/media/

cd /media/Server/

ls |grep ypserv

rpm –ivh ypserv-2.19-3.1386.rpm

2, nisdomainname “domain-name”? #即時生效

3,?? /etc/sysconfig/network?? 加入:

NISDOMAIN=”DOMAIN-NAME”???????? #等號兩邊不能有空格? 這里為cluster

HOSTNAME=” HOSTNAME”?????????????????????? node0 -9

4,?? Vi /etc/rc.d/rc.local?? #加入命令語句:

/bin/nisdomainname “域名“?? ?????????#cluster??????????????

5, vi /etc/ypserv.conf

dns:no, #使用DNS服務(wù)要相應(yīng)有設(shè)置 /etc/hosts文件，讓客戶端找nis服務(wù)器

files:30 #讀入cache的賬號數(shù), 預(yù)設(shè)會有30個數(shù)據(jù)庫被讀入, 如果集群規(guī)模比較大的話就必須設(shè)大一點(diǎn)了, 還有一臺機(jī)可能不止一個賬戶，而且通常都不止

slp:?? no? #使用 spf則yes ,SPF: Shortest Path First,最短路徑優(yōu)先還是

#Servie Port Function，業(yè)務(wù)端口功能。是接入網(wǎng)功能之一。

slp_timeout: 3600 #設(shè)置相關(guān)spf的

#xfr requests are only allowed from ports < 1024?

?xfr_check_port:yes?? #主nis與從nis服務(wù)同步時采用1024以下端口

#Host : Domain : Map : Security

Map:#可以查詢的數(shù)據(jù)庫名稱,*代表所有都可

#Security:?? none 任意，port >1024端口的都不行，deny完全拒絕

127.0.0.1/255.0.0.0：*：*：none?? 允許來自本機(jī)的????????????????

192.168.1.0/255.255.255.0:*:*:none 來自內(nèi)網(wǎng)段的

# * : * : * :deny

6, vi /etc/passwd

#add:?? 密碼為空

7,vi /etc/yp.conf

add: domain “nis域名” server?? “master hostname”

???? ypserver “master hostname”

例:

???? domain cluster server node0

???? ypserver node0

8, touch /etc/netgroup　　　#組允許

空表示：信任所有客戶端

添加只信任的客戶端：

Host:user:zdomain

9，注:在服務(wù)器端，端口111需要打開. 可以在我們的知識庫中得到更到的信息關(guān)于NIS服務(wù)器的安全。

關(guān)閉防火墻或添加規(guī)則

iptables -A INPUT -p tcp --dport 111 -d xxx.xxx.xxx.xxx -j ACCEPT

iptables -A INPUT -p udp -m udp --dport 111 -j ACCEPT

iptables -A OUTPUT -p tcp -? m tcp --dport 111 -j ACCEPT

iptables -A OUTPUT -p udp -m udp --dport 111 -j ACCEPT

１0,vi /var/yp/Makefile?????????????? #主從同步

change: NOPUSH=true to? NOPUSH=false

１1,/usr/lib/yp/ypinit –m???? #建立數(shù)據(jù)庫

???? ctrl + d? y???????? ?

１2,啟動服務(wù)

?? ? service? portmap? restart

service? yppasswdd? restart

service? ypserv? restart

chkconfig portmap?? on

chkconfig yppasswdd? on

chkconfig ypserv? on

１3,　測試：

ypwhich

四，配置SSH

1, 安裝Openssh軟件包

Rpm? -qa? |grep? openssh

Rpm? -ivh? /media/cdrom./RedHat/RPMS/openssh-server-3.9.rpm

Rpm? -ivh? /media/cdrom./RedHat/RPMS/openssh……rpm

…..???? 共５個

2, /etc/ssh/ssh_config

設(shè)置ssh端口

Port 22

設(shè)置ssh協(xié)議順序

Protocol 2,1??? 表示先用ssh2協(xié)議

設(shè)置ssh綁定ip

ListenAddress 0.0.0.0. 默認(rèn)綁定所有

是否允許root用戶登錄

PermitRootLogin yes

是否允許空密碼用戶登錄

PermitEmptyPasswords? yes???????????? #涉及mpd.conf

是否使用公鑰認(rèn)證

PasswordAuthentication no?? yes表示不使用，而是用密碼驗證

3,　關(guān)閉防火墻或讓防火墻通過，添加規(guī)則：/etc/sysconfig/iptables

iptables ?-I ?INPUT? -p? tcp? --dport? 22? -j? ACCEPT

注：　netstat –apn 可查看端口號

4,ssh-keygen –t rsa

5,cp? ~/.ssh/id_rsa.pub?? ~/.ssh/authorized_keys2????????????? # ~表示home目錄

chmod ?go-rwx? ~/.ssh/authorized_keys2

7,ssh-agent? $SHELL

附注:

???? #ssh-agent 的輸出是一系列 bash 命令；如果這些命令被執(zhí)行，則將設(shè)置兩個環(huán)境變量：SSH_AUTH_SOCK 和 SSH_AGENT_PID。內(nèi)含的 export 命令使這些環(huán)境變量對之后運(yùn)行的任何附加命令都可用。

???? #啟動 ssh-agent 的最佳方式就是把上面這行添加到您的 ~/.bash_profile 中

#SSH_AUTH_SOCK 包含有 ssh 和 scp 可以用來同 ssh-agent 建立對話的 UNIX 域套接字的路徑。

8,ssh-add

9, 啟動ssh服務(wù)

?/etc/init.d/sshd start? 或用 service sshd start?? 或在“服務(wù)配置” 啟動ssh

自動啟動:? ntsysv?? chkconfig sshd on

從結(jié)點(diǎn)配置：node1

一，準(zhǔn)備

與主結(jié)點(diǎn)相同,hostname 不同而已

二，配置NFS

1,Showmount?? -e? 127.0.0.1? 查看當(dāng)前目錄下發(fā)布多少共享目錄
Showmount?? -e? 192.168.1.11? 查看當(dāng)前目錄下共享了服務(wù)的目錄

2, 創(chuàng)建目錄 mkdir ?-p? /home/cluster

3,mount ?-t? nfs? 192.168.1.1:/home/cluster? /home/cluster

4, df? -lh??? #查看掛載了沒有

5,要卸載可用　　umount /home

6,要永久生效：

在文件/etc/fstab 中加入下面一行:#這里/home 是共享目錄
<node0>:/home/cluster ?/home/cluster ?nfs ?defaults ?0 ?0

???? 7,重啟服務(wù):

?chkconfig nfs on
#chkconfig nfslock on
chkconfig portmap on
?service nfs restart
?service portmap ?restart
?#service nfslock ?restart

三，配置NIS

1,安裝：

?? ypbind

?? yp-tools

1,執(zhí)行命令：

authconfig

這個命令來指定NIS域和NIS服務(wù)器

或

?vi /etc/sysconfig/authconfig

change:

USENIS=yes

USEMD5=yes

USESHADOW=yes

2, vi /etc/passwd

#add:?? 密碼為空

3,vi /etc/yp.conf

add: domain “nis域名” server?? “master hostname”

例:

???? domain cluster server node0

???? ypserver node0

4,vi /etc/nsswitch.conf

change:? passwd: files nis

shadow: files nis

group: files nis

hosts: files nis dns

# vi /etc/pam.d/system-auth ??change : password sufficient …… shadow 后加入　nis

# 上面這步等同于? vi /etc/sysconfig/authconfig 所以不用做

5,通過下面的命令啟動ypbind 和 ypxfrd

service <service- name> start

chkconfig ?<service- name> on

6 同時修改運(yùn)行級別

rpcinfo -p localhost? 查看

7,測試

? ?ypwhich

yptest? 2>&1 | tee file.log?? #結(jié)果到file文件里

四，配置SSH

3,ssh-keygen –t rsa

4,scp node1:~/.ssh/*?? ~/.ssh

5,ssh-agent $SHELL?????????????? 干嗎的?

6,ssh-add

7, service sshd restart

? chkconfig sshd on

五,MPICH2 安裝配置：只在主服務(wù)器上裝，從服務(wù)器不用 ,但要在客戶端設(shè)置

1, 解壓安裝文件到 /tmp下

２,configure the install distributes

? # cd /tmp/mpich2-1.0.6pl

#./configure? --prefix=/home/cluster/mpich2? 2>&1 | tee configure .log

3,make 2>&1 | tee make.log

4,test the program??? #可選

?cd? tmp/mpich2-1.0.6/examples

?make cpi

/tmp/mpich2-1.0.6/bin/mpirun –np 4 ./cpi

5,install

make install 2>&1 | tee makeinstall.log

將被裝到共享目錄下

10,vi ~/.bash_profile????????? 也可修改 /etc/bashrc? 它是 ~/.bash_profile的子程序

格式如下()：
　　 # 軟件名-版本號
　　 PATH=$PATH:路徑1:路徑2:...:路徑n
???? OTHERPATH=$OTHERPATH:……

add: ??? export PATH=$PATH:/home/cluster/mpich2/bin

export MANPATH=$MANPATH:/home/cluster/mpich2/man

???????? export MPI_USEP4SSPORT=yes

???????? export MPI_P4SSPORT=22

???????? export P4_RSHCOMMAND=ssh

執(zhí)行 source ~/.bash_profile

要對所有用戶有效則修改:/etc/profile

參見: http://lemeen.blog.163.com/blog/static/14262342006619325320/

7,CHECK THE PATHS

which mpd

which mpicc

which mpiexec

which mpirun

8, new mpd.conf????? #在SSH時改過? ?

#非root 用戶可以建在自己的主目錄下但要加 . 隱藏確保安全 ,即 ~/.mpd.conf

touch /etc/mpd.conf

vi /etc/mpd.conf

add:

MPD_USE_ROOT_MPD=yes

?MPD_SECRETWORD=123456

chmod 600 /etc/.mpd.conf

# MPD_USE_ROOT_MPD=yes

MPD_SECRET_WORD can be unique to each user, but doesn't have to be

MPD_USE_ROOT_MPD specifies that users will not start up their own mpd daemons, but will rely upon attaching to one already running under the root account

9 vi /etc/hosts.equiv

?add: node0

???????? node1

???? ??? node2

12,vi ~/.mpd.hosts

???????? add: node0

node1

?node2

13, test

?mpd &

mpdtrace

mpdallexit

mpd &

mpiexec –n 1 /bin/hostname

mpiexec –n 2? 某個程序

mpdboot –n 3? -f mpd.hosts

****客戶端和從服務(wù)器: ****

8, new .mpd.conf????? #在SSH處改過

touch /etc/.mpd.conf

vi /etc/.mpd.conf

add:? ??????? MPD_USE_ROOT_MPD=1

MPD_SELRETWORD=123456

chmod 600 /etc/.mpd.conf

9 vi /etc/hosts.equiv

#填node0是給自己放權(quán)，這樣在只有一臺機(jī)器時也可以模擬并行計算環(huán)境

?add:??? node0

???????? node1

???? ??? node2

10,vi ~/.bash_profile??????????????? #這步客戶端應(yīng)該不用吧

add: ??? export PATH=$PATH:/home/cluster/mpich2/bin:$PATH?? ?

???????? export MANPATH=$MANPATH:/home/cluster/mpich2/man:$MANPATH??????? ?