日韩性视频-久久久蜜桃-www中文字幕-在线中文字幕av-亚洲欧美一区二区三区四区-撸久久-香蕉视频一区-久久无码精品丰满人妻-国产高潮av-激情福利社-日韩av网址大全-国产精品久久999-日本五十路在线-性欧美在线-久久99精品波多结衣一区-男女午夜免费视频-黑人极品ⅴideos精品欧美棵-人人妻人人澡人人爽精品欧美一区-日韩一区在线看-欧美a级在线免费观看

歡迎訪問(wèn) 生活随笔!

生活随笔

當(dāng)前位置: 首頁(yè) > 编程资源 > 编程问答 >内容正文

编程问答

bioperl 格式化genebank的输出

發(fā)布時(shí)間:2025/3/21 编程问答 21 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 bioperl 格式化genebank的输出 小編覺(jué)得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.

代碼如下:

use Bio::SeqIO; use Bio::DB::GenBank; use Bio::DB::Query::GenBank;
my $db_obj = Bio::DB::GenBank->new; my $seq_obj = $db_obj->get_Seq_by_acc('JN093905'); my $id = $seq_obj->display_id(); my $organ; foreach my $feat_object ($seq_obj->get_SeqFeatures) {if ($feat_object->primary_tag eq "source") {($organ) = $feat_object->get_tag_values('organism');}if ($feat_object->primary_tag eq "CDS") {my ($gene_name) = $feat_object->get_tag_values('gene');next if $gene_name ne 'nifH';my ($seq) = $feat_object->get_tag_values('translation');my ($pro) = $feat_object->get_tag_values('product');$seq = lc($seq);my $len = (length($seq) + 1) * 3;print qq{>$id coded_by=<1..>$len,organism=$organ,definition=$pro\n$seq\n};} }

運(yùn)行結(jié)果如下:

>JN093905 coded_by=<1..>330,organism=uncultured Trichodesmium sp.,definition=dinitrogenase reductase rlilnakaqttvlhvaaergavedveldevlkpgfggikcvesggpepgvgcagrgiitainfleeegaytdldfvsydvlgdvvcggfampirenkaqeiyivcsgem

?

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的bioperl 格式化genebank的输出的全部?jī)?nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

如果覺(jué)得生活随笔網(wǎng)站內(nèi)容還不錯(cuò),歡迎將生活随笔推薦給好友。

主站蜘蛛池模板: 一级h片| 性欢交69国产精品 | 新婚夫妇白天啪啪自拍 | 精品不卡一区二区三区 | 日韩一卡二卡在线 | 久久人人爽人人爽 | 亚洲欧美日韩一区二区三区在线观看 | 亚洲欧洲精品一区二区三区 | 亚洲欧美激情另类校园 | 国产呦小j女精品视频 | 999精品视频 | 午夜视频一区二区 | julia一区二区中文久久97 | 99久99| 婷婷色在线观看 | 亚洲视频天天射 | 好吊操这里有精品 | 日韩精品高清视频 | 国产一区二区三区观看 | 午夜67194| 日本美女毛片 | 亚洲中文字幕久久无码 | 在线观看超碰 | 林天顾悦瑶笔趣阁 | 成人免费看视频 | 一本到视频 | 国产色诱视频 | 网站国产 | 在线视频 一区二区 | av免费大片 | 亚洲综合色网 | 在线播放少妇奶水过盛 | 经典一区二区 | 久久综合色鬼 | 中文字幕+乱码+中文乱 | 66av欧美| 色哟哟一区二区 | 亚洲最大成人综合网 | 日韩av在线直播 | 精品国产99久久久久久 | www.夜色 | 131美女爱做视频 | 69中国xxxxxxxxx69 国产又爽又色 | 日本黄色网页 | 欧美一区二区在线免费观看 | 暧暧视频在线观看 | 成人免费毛片视频 | 久久98 | 有色影院 | 91亚洲免费 | 99久久久无码国产精品性黑人 | 天天操天天干天天插 | 国产第5页 | 91九色高潮| av女星全部名单 | 秋葵视频在线 | 成年人香蕉视频 | 国产男女猛烈无遮挡免费视频动漫 | 黄色性情网站 | 成年人av网站 | 西野翔之公侵犯中文字幕 | 国产码视频 | 久久神马| 最好看的2019年中文在线观看 | 欧美 唯美 清纯 偷拍 | 97人人爽人人爽人人爽人人爽 | 国产女人18毛片水真多1 | 久久久久成人精品无码中文字幕 | 亚洲成av人片在线观看 | 亚洲射情| 欧美另类在线播放 | 久久最新视频 | 国产网站免费观看 | 亚洲高清天堂 | 国产夫妻露脸 | 国产精品6 | 亚洲乱轮视频 | 成人黄网免费观看视频 | 美梦视频大全在线观看高清 | 日韩成人免费在线视频 | 亚洲视频在线观看视频 | 亚州| 91视频xxx| 成人靠逼视频 | 黑人与日本少妇高潮 | 国产在线不卡一区 | av手机免费在线观看 | 一级片www| 欧美黄色网 | 奇米影视一区二区 | 就要操就要日 | 性色av一区二区 | 人妖被c到高潮欧美gay | 日本网站免费观看 | 欧美国产在线视频 | 欧美成人精精品一区二区频 | 日本大尺度激情做爰hd | av黄色一级片 | 国产富婆一级全黄大片 |