drttoolbox :?Matlab Toolbox for Dimensionality Reduction是Laurens van der Maaten數(shù)據(jù)降維的工具箱。

里面囊括了幾乎所有的數(shù)據(jù)降維算法：

?- Principal Component Analysis ('PCA')
?- Linear Discriminant Analysis ('LDA')
?- Independent Component Analysis ('ICA')
?- Multidimensional scaling ('MDS')
?- Isomap ('Isomap')
?- Landmark Isomap ('LandmarkIsomap')
?- Locally Linear Embedding ('LLE')
?- Locally Linear Coordination ('LLC')
?- Laplacian Eigenmaps ('Laplacian')
?- Hessian LLE ('HessianLLE')
?- Local Tangent Space Alignment ('LTSA')
?- Diffusion maps ('DiffusionMaps')
?- Kernel PCA ('KernelPCA')
?- Generalized Discriminant Analysis ('KernelLDA')
?- Stochastic Neighbor Embedding ('SNE')
?- Neighborhood Preserving Embedding ('NPE')
?- Linearity Preserving Projection ('LPP')
?- Stochastic Proximity Embedding ('SPE')
?- Linear Local Tangent Space Alignment ('LLTSA')
?- Simple PCA ('SPCA')
?- Conformal Eigenmaps ('CCA', implemented as an extension of LLE)
?- Maximum Variance Unfolding ('MVU', implemented as an extension of LLE)
?- Fast Maximum Variance Unfolding ('FastMVU')
?- Autoencoders using RBM pretraining ('AutoEncoder')
?- Autoencoders using evolutionary optimization ('AutoEncoderEA')

這里附上下載地址：http://download.csdn.net/detail/xiaowei_cqu/4258778

在此寫(xiě)下我在使用中遇到的一點(diǎn)點(diǎn)小問(wèn)題。

首先安裝工具箱，一般都把工具箱發(fā)到Matlab默認(rèn)放置工具箱的目錄?matlabroot\toolbox\下面，拷貝過(guò)去之后，記得修改matlabroot\toolbox\local 下的pathdef.m文件，要在里面添加上新的工具箱的路徑：

[plain]?view plaincopy

matlabroot,'\toolbox\drtoolbox;',?...??

matlabroot,'\toolbox\drtoolbox\techniques;',?...??

注意要把子文件夾techniques也添加進(jìn)入。

之后在Matlab工作環(huán)境中，只需要運(yùn)行compute_mapping命令即可使用工具箱中的函數(shù)，如：

[plain]?view plaincopy

mappedX?=?compute_mapping(X,?'PCA',?1);??

具體參加說(shuō)明文檔。

在使用‘Isomap’算法時(shí)，會(huì)遇到錯(cuò)誤如下： ?

Invalid MEX-file C:\Program Files\MATLAB\R2010b\toolbox\drtoolbox\techniques\dijkstra.dll 找不到指定模塊

發(fā)現(xiàn)相應(yīng)路徑中，dijkstra.dll的文件是在的，于是以為是環(huán)境變量或者Progam Files空格的問(wèn)題，嘗試修改均無(wú)效。

后來(lái)仔細(xì)閱讀了源文件的注釋才發(fā)現(xiàn)是編譯版本問(wèn)題。dijkstra函數(shù)是用C++實(shí)現(xiàn)的，需要用matlab的mex編譯器編譯成dll調(diào)用。雖然工具箱中已經(jīng)有相應(yīng)編譯的dijkstra.dll，但不同版本的Matlab調(diào)用會(huì)遇到問(wèn)題，需要重新編譯。

在windows命令行cmd中，用cd命令更改路徑到工具箱路徑下，運(yùn)行命令：

[plain]?view plaincopy

mex?-O?dijkstra.cpp??

編譯出現(xiàn)錯(cuò)誤：

1) ? Cannot open include file 'iostream.h' : No such file or directory

? ? ? 修改dijkstra.cpp中 include<iosteam.h>為<iosteam>

2） ‘cout’ : undeclared identifier ? ? ? ‘cin’ : undeclared identifier?

? ? ? 在dijsktra.cpp中加入一行 using namespace std;

編譯成功之后，在techniques文件夾下出現(xiàn)dijkstra.mexw32?的文件，即為新編譯的dll。我們可以修改之前的為dijkstra.dll.old，重命名dijkstra.mexw32為dijkstra.dll。

在matlab環(huán)境中運(yùn)行isomap的程序：

成功！

（轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明作者和出處：http://blog.csdn.net/xiaowei_cqu?未經(jīng)允許請(qǐng)勿用于商業(yè)用途）

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的数据降维工具箱drtoolbox的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

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