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编程问答

Matlab并行编程方法

發布時間:2025/3/21 编程问答 29 豆豆
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 Matlab并行编程方法 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.

本文講一下matlab中的并行方法與技巧,這里我們不涉及GPU加速,主要考慮for循環并行和數據并行。分為以下幾個板塊:

1. 怎么并行?

2. parfor vs. SPMD

3. 注意事項及經驗總結



-----------------------------------------------------------

1. 如何并行?

1. Request a number of workers;
2. Issue the normal command to run the program. The client program will call on the?workers as needed;
3. Release the workers;

具體到代碼:

[plain]?view plain?copy ?
  • matlabpool?local?2;??
  • ????%parallel?program??
  • matlabpool?close??

  • 其中2是core數目,注意2是core數。你的電腦如果是雙核四線程的,那么只能申兩個(而非4個)matlab local pool。

    具體實現parallel program呢,主要是通過parfor(parallel for)和SPMD(single program, multiple data)完成的。




    -----------------------------------------------------------

    2. parfor vs. SPMD

    2.1 什么時候用parfor

    parfor只用于matlab并行循環。當你需要簡單計算的多次循環迭代時,例如蒙特卡洛(Monte Carlo)模擬,parfor循環就很有用。parfor將循環迭代分組,那么每個worker執行迭代的一部分。當迭代耗時很長的時候parfor循環也是有用的,因為workers可以同時執行迭代。

    注意當循環中有迭代依賴其他迭代的結果時不應該使用parfor循環。每個迭代都必須不依賴其他迭代。由于parfor循環內有通信消耗,當只有小數量的簡單計算時使用parfor可能得不到什么好處。

    [plain]?view plain?copy ?
  • c?=?1:10;??
  • a?=?ones(10,1);??
  • tic??
  • parfor?i?=?1:length(c)??
  • ????a(i)=?a(i)+?c(i);??
  • end??
  • toc??
  • fprintf('%d\n',a);??


  • 2.2 什么時候用SPMD(Single Program/Multiple Data)單程序多任務進行任務并行

    Spmd中的“Single program”方面指的是同一段代碼運行在不同的多個lab上。你在一個Matlab客戶端上運行一個程序,被標志為spmd模塊的其他部分運行在其他lab上。當這些塊運行完畢后,你的程序繼續在客戶端運行。?“Multiple data”方面指的是雖然spmd語句在所有的lab上運行相同的代碼,但每一個lab可以有不同的,獨有的數據。所以多數據集可以在多個lab上同時被容納。一下是我總結的SPMD使用的兩個場景:


    The "single program" aspect of spmd means that the identical code runs on multiple labs. 就是說同一段程序應用于不同的樣本(數據),所以一般針對隨機抽樣的并行,如

    [plain]?view plain?copy ?
  • %%?SPMD??
  • %example?1??
  • spmd???
  • A?=?rand(3,2);?%generate?a?matrix?A?for?each?lab(worker)??
  • end??
  • for?i?=?1:length(A)??
  • ????figure;?imagesc(A{i});???
  • end??
  • ??
  • %example?2??
  • a?=?3;??
  • b?=?4;??
  • spmd??
  • ????c?=?labindex();??
  • ????d?=?c+a;??
  • end??
  • c{2}?=?5;??
  • spmd??
  • ????f?=?c*b;??
  • end??
  • for?i?=?1:length(f)??
  • ????fprintf('%d\t',f{i});%access?the?value?of?each?lab??
  • end??

  • 另外,SPMD也可以用于可替代parfor的塊并行,在不同lab(worker)上對相同或不同的數據執行不同的并行操作,說起來有些拗口,具體看一下例子就明白了,下面我寫的example3,4分別針對在不同lab上對相同數據和不同數據執行不同操作。它們都可以用parfor代替,對吧,這里我就不寫了,相信大家的能力。。

    [plain]?view plain?copy ?
  • %example3?-?deal?with?same?Data?by?different?parameters??
  • %add?different?values?to?same?array?Data??
  • Data?=?1:100;??
  • spmd??
  • ????switch?labindex??
  • ????????case?1??
  • ????????????Data?=?Data+1;??
  • ????????case?2??
  • ????????????Data?=?Data+2;??
  • ????end??
  • end??
  • %?print?Data{1}?&?Data{2}?for?checking??
  • ??????????????
  • %example4???
  • %add?different?values?for?different?parts?of?array?Data??
  • %?[1:50]+1??
  • %?[51:100]+2??
  • spmd??
  • ????if?labindex?==?1??
  • ????????Data(1:50)?=?Data(1:50)+1;??
  • ????else??
  • ????????Data(51:100)?=?Data(51:100)+2;??
  • ????end??
  • end??

  • 以上是我對spmd和parfor的理解,歡迎補充指正,其他關于spmd vs. parfor的可以參考這個帖子。


    2.3 Composite類型

    spmd中每個lab返回值以composite存儲,如上面[code]example 1中的f就是以composite的形式展現。f{i}為第i個lab的返回值。最開始我們也可以創建Composite對象并進行初始化賦值。

    >>??f = Composite(2);



    -----------------------------------------------------------

    4. 注意事項及經驗總結

    注意事項

    1. parfor中慎用(最好勿用)eval幅值。

    一個程序并行時要共享內存,而eval語句可能使程序進入錯誤的workspace,因此不要用eval,改用不同index賦值。

    [plain]?view plain?copy ?
  • matlabpool?local?2;??
  • c?=?1:5;??
  • parfor?i?=?1:length(c)??
  • ????a(i)?=?c(i);??
  • end??



  • 2. parfor循環不能很好利用所有處理器怎么辦?

    是這樣,

    [python]?view plain?copy ?
  • parfor?i?=?1:4??
  • ........??
  • end??

  • 就只能用4個處理器,而如果不加這個parfor可能matlab自身的負載均衡能夠更好地利用CPU。這里我是開起來3個matlab,比如服務器上有12個核。我就給每個matlab分配4個core(>>matlabpool local 4),每個程序里有一個parfor i = 1:4. 這樣就可以用起來12個核。我知道這樣好暴力……囧,有人知道正解的話指條明路吧。。


    3. parfor,spmd不可以相互或者自身嵌套。


    4. parfor使用有很多約束,比如for循環內的表達式需要顯式表達(透明性),不依賴前項。如

    parfor i = 3:10

    ? ? ? ?f(i) = f(i-1)+f(i-2);

    end

    是不行滴。。


    歡迎留言其他并行技巧和方法,謝謝!



    Reference:

    1. MATLAB官網——Parallel Computing Toolbox

    2.?詳細講解并行用法(貌似阿拉伯人寫的……o(╯□╰)o)

    3. 詳細并行代碼

    4.?多核計算平臺中MATLAB并行計算

    5. Parallel Computing Toolbox?User's Guide


    from:?http://blog.csdn.net/abcjennifer/article/details/17610705#comments

    《新程序員》:云原生和全面數字化實踐50位技術專家共同創作,文字、視頻、音頻交互閱讀

    總結

    以上是生活随笔為你收集整理的Matlab并行编程方法的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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