RNA測(cè)序也就是所謂的RNA-seq，通常指的是轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，只測(cè)細(xì)胞中的轉(zhuǎn)錄組，所以數(shù)據(jù)相對(duì)少且簡(jiǎn)單。RNA測(cè)序不僅能檢測(cè)mRNA的轉(zhuǎn)錄，還能觀測(cè)到包括包括總RNA和小RNA（miRNA、tRNA和核糖體RNA）在內(nèi)不同尺度的RNA表達(dá)譜，相對(duì)于RNA測(cè)序，基因表達(dá)芯片測(cè)序結(jié)果的覆蓋面很窄，只能覆蓋染色體中1千多萬SNP中的常見等位基因的SNP（50萬到200萬）。

RNA測(cè)序（英語：RNA Sequencing，簡(jiǎn)稱RNA-Seq，也被稱為全轉(zhuǎn)錄物組鳥槍法測(cè)序:Whole Transcriptome Shotgun Sequencing[1]，WTSS）是基于第二代測(cè)序技術(shù)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法：首先提取生物樣品的全部轉(zhuǎn)錄的RNA，然后反轉(zhuǎn)錄為c-DNA后進(jìn)行的二代高通量測(cè)序，在此基礎(chǔ)上進(jìn)行片段的重疊組裝，從而可得到一個(gè)個(gè)的轉(zhuǎn)錄本。進(jìn)而可以形成對(duì)該生物樣品當(dāng)前發(fā)育狀態(tài)的基因表達(dá)狀況的全局了解（globle）。如同樓上所說，RNA測(cè)序有很多優(yōu)勢(shì)。此外，若和下一階段的生物樣品的RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行比較，則可以得到全部的（在轉(zhuǎn)錄層面）基因表達(dá)的上調(diào)及下調(diào)--這就形成了表達(dá)譜，針對(duì)關(guān)鍵基因則可以形成你要想要的pathway的構(gòu)建。相較于一個(gè)靜態(tài)的染色體而言，細(xì)胞內(nèi)的轉(zhuǎn)錄物組是一個(gè)處于不斷變化的動(dòng)態(tài)過程。隨著現(xiàn)在的下一代基因測(cè)序（NGS）技術(shù)的發(fā)展，使得可測(cè)得的DNA堿基覆蓋面增加且樣本輸出的吞吐量增大。有助于對(duì)細(xì)胞內(nèi)RNA轉(zhuǎn)錄物進(jìn)行測(cè)序，提供包括選擇性剪接的轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后的改變、基因融合、突變/SNPs以及基因表達(dá)量改變等細(xì)節(jié)。正因?yàn)镽NA測(cè)序可以檢測(cè)動(dòng)態(tài)過程，因而優(yōu)勢(shì)非常明顯。

RNA測(cè)序的優(yōu)勢(shì)：數(shù)字化信號(hào)：直接測(cè)定每個(gè)轉(zhuǎn)錄本片段序列，單核苷酸分辨率的精確度，同時(shí)不存在傳統(tǒng)微陣列雜交的熒光模擬信號(hào)帶來的交叉反應(yīng)和背景噪音問題。高靈敏度：能夠檢測(cè)到細(xì)胞中少至幾個(gè)拷貝的稀有轉(zhuǎn)錄本。全基因組分析：可以對(duì)任何物種進(jìn)行全基因組分析。無需預(yù)先設(shè)計(jì)特異性探針，因此無需了解物種基因信息，能夠直接對(duì)任何物種進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析。同時(shí)能夠檢測(cè)未知基因，發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本，并精確地識(shí)別可變剪切位點(diǎn)及cSNP，UTR區(qū)域。檢測(cè)范圍：高于6個(gè)數(shù)量級(jí)的動(dòng)態(tài)檢測(cè)范圍，能夠同時(shí)鑒定和定量稀有轉(zhuǎn)錄本和正常轉(zhuǎn)錄本。

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的RNA测序为什么会出现？与基因表达芯片相比，RNA测序有什么特点？的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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