“我們一旦使用計算機(jī)來盡可能地去拼接2.5萬個嗜血桿菌基因組的全部片段時，最后得到叫做重疊群的較大碎塊，該碎塊由一套重疊的DNA片段組成。為了把重疊群裝配成基因組，我想我們可以從幾百個任意λ克隆體的兩端比較序列。如果一個λ克隆體的一端與一個重疊群相匹配，另一端與另一個重疊群匹配，那我們自然就知道這兩個重疊群的次序和定位了。”---全基因霰彈槍測序法

[美]克雷格.文特爾_《第一推動叢書》解碼生命

蛋白質(zhì)有一個特征的形態(tài)，與環(huán)境無關(guān)。這意味著蛋白質(zhì)作為一種形態(tài)他的分類環(huán)境就是蛋白質(zhì)本身。所以蛋白質(zhì)的最終形態(tài)僅取決于組成蛋白質(zhì)的氨基酸和氨基酸片段之間的相互作用。

氨基酸與氨基酸之間的相互作用是化學(xué)作用，但作用的結(jié)果一定有一個外部形態(tài)的表象。最終的外部形態(tài)對應(yīng)著化學(xué)作用的平衡態(tài)，因此氨基酸與氨基酸或者氨基酸段落和氨基酸段落之間的化學(xué)作用的結(jié)果可以用兩個形態(tài)之間的差異來等價的描述。而兩個形態(tài)之間的差異的大小顯然就是收斂誤差一定時的迭代次數(shù)，

所以如果用類似霰彈槍的方法把蛋白質(zhì)分割成一定數(shù)量的片段，并在已知的蛋白質(zhì)中收集片段與片段之間形態(tài)差異的平衡迭代次數(shù)，并且通過旋轉(zhuǎn)拉伸等方法把未知的片段與片段之間的迭代次數(shù)調(diào)整為平衡迭代次數(shù)，得到的是這個未知蛋白質(zhì)的最優(yōu)結(jié)構(gòu)嗎？

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的蛋白质折叠的霰弹枪方法的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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