Linux下搭建mpi集群（ubuntu下用虚拟机测试）
一 建立SSH連接（無密碼登陸）
1 SSH連接的簡單介紹
SSH 為 Secure Shell 的縮寫,中文翻譯為安全外殼協議，建立在應用層，是一種遠程連接安全協議。傳統的telnet，pop，ftp都能夠實現類似的功能，但是安全性上來說不足，因為他們都是明文傳輸，而SSH是密文傳輸，能夠有效防止DNS欺騙，網絡信息的攔截等等。
2 為什么要建立SSH連接
????? 因為我建立集群的目的就是為了高性能的計算，這里我用了MPI，采用的是計算機之間的相互通信，所以必然涉及到計算機的訪問登陸問題，所以我們建立集群計算機之間的SSH連接讓他們能夠無密碼登陸，保證通信的快速性。
3具體的建立SSH連接步驟（都在虛擬機中操作）
1配置網卡
在ubuntu上可以通過圖形界面進行設置，也可以通過指令來修改，大致模式如下：
sudo vi /etc/network/interfaces
auto eth0
iface eth0 inet static
address 192.168.1.100
netmask 255.255.255.0
gateway 192.168.1.1
sudo /etc/init.d/networking restart//重啟服務
就是簡單的修改配置文件來修改參數，最后一定要重啟網絡服務。按照此方式多配置幾臺虛擬機，然后測試通信。你可以通過自動獲取的方式獲取物理機在虛擬區域的IP，然后用作其他虛擬機的默認網關。接下來就是修改主機名
sudo vi /etc/hostname //修改本機的主機名
sudo?vi?/etc/hosts //地址解析，其實就是集群中所有主機的主機名與IP地址的對應
例如? node0 192.168.1.100
????? ? node1 192.168.1.101
host中的內容模式(主機名：端口 IP)SSH的默認端口是22
?
?
2創建互信的SSH連接
1)安裝SSH，指令如下
sudo apt-get install ssh
2)首先理解下SSH的無密碼連接機制，其實就是利用公鑰和密鑰來實現互相的無密碼訪問，所以接下來就是對公鑰密鑰的配置。
第一步 ssh-keygen -t rsa -P ' '//首先生成公鑰和密鑰對，這里的' '表示密碼為空，這樣就在你的個人用戶目錄下生成了.SSH文件夾，里面有id_rsa和id_rsa.pub，分別是公鑰和密鑰。
第二步 接下來就是關鍵的一步，就是公鑰的傳送。公鑰需要給另一個能讓你訪問的機器下，因為公鑰能夠識別用戶是誰。復制方法采用的是scp復制，這是一種遠程復制方法需要密碼的輔助。
??? scp .ssh/id_rsa.pub? 目標主機名:/home/chenlb/id_rsa.pub解釋下為什么是機器名，因為你在hosts文件中已經定義了目標主機名與ip的對應關系，所以可以運用主機名，這是遠程傳輸，自然開始需要密碼。
??????? 第三步 目標主機把從本機復制的id_rsa.pub（公鑰）添加到.ssh/authorzied_keys文件里(所有的目標機器都必須裝SSH協議)，指令如下所示：cat id_rsa.pub >> .ssh/authorized_keys（這是目標機上的）。然后需要設置authorized_keys的權限，因為這個驗證文件也需要給訪問的機器權限才能完成之后的驗證：chmod 600 .ssh/authorized_keys。
??? 這樣就完成對目標主機的無密碼訪問，但是互相訪問就需要在調換一下位置再設置一下，步驟重復。
?
再次我說下對稱加密解密的使用原理以及機制(RSA)，我們就簡單的用A主機和B主機來描述。A主機將公鑰給了B主機，這就意味著A主機用自己的密鑰訪問B主機時，B主機可以用A主機的公鑰來解密，從而知道是A訪問自己，所以允許A訪問。
二 創建NFS（網絡文件系統）
由于mpi需要在每個機器中都安裝，如果每個機器都裝一次那樣就太麻煩了，所以我們創建一個共享的網絡文件系統，這樣就可以修改一次全局修改，非常方便的使用。
1 安裝NFS sudo apt-get install nfs-kernel-server nfs-common
2 在用戶主目錄下創建共享文件夾 mkdir sharedarea
3 修改sharedarea的所屬權限，剛開始屬于root，所以需要改為用戶的
? sudo chown 用戶名:用戶名 / home/用戶名/sharedarea
4 設置下能訪問的網段，即編輯/etc/exports文件。
? sudo vi /etc/exports
? 添加/home/abc/cluster *(rw,sync,no_root_squash)
5 重啟服務
? sudo /etc/init.d/rpcbind restart
? sudo /etc/init.d/nfs-kernel-server restart
6 其他機器掛載
? 首先其他機器得先安裝NFS，和第一步一樣，然后創建相同的文件夾，掛載命令如下：sudo?mount?-t?nfs?第一個的主機名:/home/用戶名/sharedarea sharedarea
?
切記，如果系統重啟后則需要重新掛載否則產生變化就無法同步了，切記切記
三 安裝MPI
1 首先來一個 sudo apt-get install mpich,不管啥都有了。然后去http://www.mpich.org/download下載一個穩定的linux版本的mpich，解壓到共享文件夾。（tar?xfz?mpich-3.2.tar.gz 生成mpich-3.2文件夾）
2 由于默認安裝在/usr/local/bin，所以需要改變一下安裝目錄
1）./configure ?--prefix=/home/love/cluster/mpich3.1 --disable-f77 --disable-fc
2）make
3）make install
3修改環境變量
這里肯定修改的是用戶的環境變量
sudo vi .bashrc
?在.bashrc
文件的末尾添加：
PATH=/home/用戶名/sharedarea/mpich3.2/bin:$PATH
export PATH?
然后source?.bashrc?重新刷新環境變量
這樣MPI就在集群上完美安裝。
四 編譯運行
到了最后一步了，其實也是檢驗你是否成功的一步了，這里我們用到兩個命令，mpicc和mpiexec，其實很簡單
mpicc -g xx.c -o xx
mpiexec -np x(這是線程數) -f y(這是和hosts類似的文件，里面放著集群的文件名，注意所有的文件地址)? ./目標文件名
接下來就大功告成了，享受一下集群的樂趣吧！
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轉載于:https://www.cnblogs.com/sunliwang/p/6544495.html
總結
以上是生活随笔為你收集整理的Linux下搭建mpi集群（ubuntu下用虚拟机测试）的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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