假阴性,新冠肺炎核酸检测逃不开的问题
編者按:
據(jù)新京報今日報道,某醫(yī)院出現(xiàn)一名3次咽拭子檢測均為陰性、通過下呼吸道樣本才確診“新冠肺炎”的患者。
而據(jù)南方周末《誰是“假陰性”新冠肺炎病人》報道,在杭州一所醫(yī)院,有個病人測了6次核酸都是陰性,直到第7次才測出陽性;剛剛逝去的李文亮醫(yī)生共查了3次核酸,第一次結果未知,第二次為陰性,第三次才為陽性,而這離他起病已過去了23天。
核酸檢測的假陰性率這么高,為什么還要使用?有哪些因素與“假陰性”有關呢?一位正奮戰(zhàn)在一線的檢測人員寫下了她的看法。
什么是新冠病毒核酸檢測?
病毒有遺傳物質。這次的2019新型冠狀病毒的遺傳物質是單鏈RNA,這是它最核心最明確也最準確的標志。我們檢測到有這個新冠病毒的核酸,那么,就肯定能說明,的確是有這個新冠病毒。這也是它被作為給感染病人確診的金標準的原因。
要是不用這個作為金標準來確診,會出現(xiàn)什么問題呢?在《新型冠狀病毒感染的肺炎診療方案》第五版里,對鑒別診斷,是這樣寫的:
主要與流感病毒、副流感病毒、腺病毒、呼吸道合胞病毒、鼻病毒、人偏肺病毒、SARS冠狀病毒等其他已知病毒性肺炎鑒別,與肺炎支原體、衣原體肺炎及細菌性肺炎等鑒別。此外,還要與非感染性疾病,如血管炎、皮肌炎和機化性肺炎等鑒別。
由此可見,要是不上核酸檢測,只用患者的癥狀和CT診斷,是會出現(xiàn)很大的誤診的,會把很多本來不是新冠感染的患者納入新冠感染。
要是被納入的話,和其他新冠患者在一起,就會發(fā)生交叉感染了。這是一個很大的問題。
而根據(jù)我現(xiàn)在所在這里醫(yī)院的情況,疑似患者里不是新冠感染、而是其他感染和其他疾病的概率并不低。我不知道其他地方情況怎么樣,我這里的這個醫(yī)院,他們對所有疑似患者全都是單人單病房隔離治療,這樣來防止交叉感染;而對所有疑似患者(從癥狀和CT判斷的疑似),只要沒查出核酸陽性,也會不斷采樣,我們檢驗會一直做這個人的樣本。所以,那種擔心核酸一直檢測不出陽性耽誤治療的,也不用擔心,因為患者早就根據(jù)癥狀和CT結果納入了治療。
當然,這只是我所在這里醫(yī)院的情況,我對其他醫(yī)院的情況并不了解。有其他地方的同行老師,希望可以幫我補充你們那邊的情況。
但根據(jù)如今最新版的診療方案,上述做法是診療方案里規(guī)定的做法,也就是都要達到的。要是沒達到,也要想盡辦法達到。
新冠病毒假陰性是怎么造成的?
既然要用核酸檢測陽性來做金標準確診新冠,那么,這個核酸檢測就萬無一失嗎?會不會出現(xiàn)很多假陰性(患者是新冠感染,但是核酸沒檢測出來,報告陰性)?
答案是讓大家失望的:核酸檢測不是萬無一失的,假陰性存在,而且概率不低。(好在我這里即使是假陰性患者,按照方案,也是在納入治療的,后續(xù)也是一直在采他們的樣本做核酸檢測,會檢測到患者出院為止。這個核酸檢測的假陰性問題,不會耽誤患者的治療。)
至于為什么新冠病毒核酸檢測會假陰性,這包含好些方面,我一一說明。
1試劑盒檢測限問題
并不是只要有一個病毒,試劑盒就能檢測出來,只有當采到的患者樣本里的病毒量達到某個值的時候,才能檢測出里面的新冠核酸。
舉個例子,假如我們從幾千米外去看前面一個地方,那里站著一個人,我們肉眼看不清楚那里到底有沒有人,或者那到底是個人呢,還是一只貓貓呢?
但是要是那里不是站著一個人,而是站著一千個人,那我們就看得到了。
檢測也是,一個病毒檢測不出來,那要是有一千個病毒,那就檢測出來了,這就是檢測限。
這是檢測原理所決定的,不受人的主觀意愿改變。
(我本來不會解釋這個的,會解釋是有個朋友問我這方面的問題后,說,你們這個核酸檢測做得太差了吧,居然會有假陰性,我:……)
雖然所有試劑盒都會存在這個最低檢測限的問題,但根據(jù)試劑盒的好壞,這個檢測限有高有低,在其他指標相同的情況下,檢測限越低的試劑盒,就越好。
2患者樣本問題
根據(jù)上面試劑盒檢測有檢測限問題,那么,采到的患者的檢測樣本,里面病毒越多,就越容易檢測出來,但是,要達到這個標準,其實并不容易。
A。 受病毒自身特性及其導致的患者病程影響
參考王辰院士的解釋,我們現(xiàn)在還不清楚這個病毒的病程,這些需要臨床醫(yī)生大規(guī)模的數(shù)據(jù)總結,才能找到規(guī)律;而且,有了規(guī)律,也可能不同患者情況也有所不同。
患者感染病毒后,病毒根據(jù)病程在身體里的情況如何(上呼吸道、下呼吸道、糞便、血液,我還看到有人提是否檢測精液里有無病毒),量是多少,和癥狀有什么關聯(lián),到現(xiàn)在為止,我沒看到這方面的報道和論文。如果已經有了,有人看到麻煩發(fā)給我,我要趕緊學習。
由此,要是患者所在的病程攜帶的病毒本身量就很少,那么,想要采到足夠檢測的量,就不行。當然,要是患者攜帶的病毒檢測不出的話,也說明了一個問題,這個患者的感染性也會相對較低。
這里也解釋了之前很多朋友問我的一個問題:為什么有些患者前期沒檢測出,檢了三四次才檢測出了。那是因為之前患者的樣本里病毒含量太低,或者就是沒有,所以沒檢出。
B。 受采到的患者標本的影響
根據(jù)《新型冠狀病毒實驗室檢測技術指南》,對檢測標本采集,標本的種類里有上呼吸道標本(咽拭子、鼻拭子、鼻咽抽取物),下呼吸道標本(深咳痰液、呼吸道抽取物、支氣管灌洗液、肺泡灌洗液、肺組織活檢標本),血液標本,血清標本,后來又增加了糞便、肛拭子。
在出這個指南的時候,做檢測的老師就發(fā)現(xiàn)一個問題:我們做檢測,但是樣本是由門診/臨床部門采集,檢測部門肯定希望標本很好;但采樣部門面對患者,不一定可以采到好的標本。
那些標本里,下呼吸道標本是最好的,病毒多,最易檢測出來,但現(xiàn)實情況是,基本上都是上呼吸道標本(比如新京報報道里出現(xiàn)的咽拭子)。因為上呼吸道標本更好采,對采樣的護士和患者都更方便;但因為上呼吸道標本里病毒少,檢測就不容易檢出陽性。
要是上呼吸道標本結果為陰,這種患者的感染性相比較檢測陽性患者的也會低一些。
C。 受到標本保藏、運送等的影響。
這個新冠病毒是單鏈RNA病毒,它容易死亡和降解。在采到標本后運送到實驗室檢測的過程中,要是沒有低溫保存,在路上的時間又很長,那么,病毒若是死亡并核酸降解,自然就不容易檢出陽性。
3受到檢測過程的影響
出于生物安全的考慮,保護從事檢測的工作人員,基本上會先將病毒進行高溫滅活后再做后續(xù)實驗。但是這個滅活后再檢測的過程,也會讓陽性率降低。
我們這邊實驗室現(xiàn)在也很矛盾,一面是檢測人員的安全,一面是檢測陽性率,要怎么抉擇?我們現(xiàn)在是不高溫滅活,直接做。我們自己也和滅活后再檢測做了對比,不滅活,直接提取RNA,陽性率要高一些。
但這對檢測人員的生物安全的影響,自然也是不言而喻的。
檢測中除了第一步滅活的影響外,后續(xù)提取RNA和PCR過程,也會因不同操作人員或者使用的試劑以及設備的不同,而產生一定的影響。當然,這些都是在可控制范圍內的。
4結果判讀的影響
做完檢測后,還需要對結果進行判讀。
對如今新冠的核酸檢測,主要有兩個方法,一種是RT-PCR試劑盒檢測,一種是測序。因為RT-PCR更快,所以現(xiàn)在大部分都是使用這個方法。
總結
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