世界上最強(qiáng)大的計(jì)算機(jī)、IBM 超級(jí)計(jì)算機(jī) Summit，已經(jīng)加入到了對(duì)抗新冠病毒疫情的戰(zhàn)斗中來(lái)。

　　IBM 超級(jí)計(jì)算機(jī) Summit 位于美國(guó)能源部橡樹(shù)嶺國(guó)家實(shí)驗(yàn)室(ORNL)，其主要任務(wù)是解決能源、先進(jìn)材料、人類(lèi)健康和人工智能等領(lǐng)域的以前看似不切實(shí)際或不可能完成的任務(wù)。

　　研究人員在 Summit 上獲得了緊急計(jì)算時(shí)間，用它來(lái)以藍(lán)色巨人所說(shuō)的“前所未有的速度”進(jìn)行模擬任務(wù)。

　　超級(jí)計(jì)算機(jī) Summit 使用 IBM POWER9 支持的系統(tǒng)，只需1-2 天就能看到結(jié)果，而標(biāo)準(zhǔn)計(jì)算系統(tǒng)需要幾個(gè)月的時(shí)間。

　　通過(guò)這項(xiàng)工作，研究人員篩選出了 77 種小分子藥物化合物。ORNL 表示，這些化合物可能值得進(jìn)一步研究，以對(duì)抗導(dǎo)致新冠疫情爆發(fā)的 SARS-CoV-2 冠狀病毒。

　　這臺(tái)超級(jí)計(jì)算機(jī)模擬了 8000 多種化合物，以篩選哪些化合物最有可能與冠狀病毒的主要“刺突”蛋白結(jié)合，使其無(wú)法感染宿主細(xì)胞。

　　田納西大學(xué) UT / ORNL CMB 博士后研究員米古拉斯-史密斯(Micholas Smith)在早期結(jié)構(gòu)研究的基礎(chǔ)上，建立了冠狀病毒刺突蛋白(也稱(chēng)為S蛋白)的模型。

　　他使用化學(xué)模擬代碼進(jìn)行了分子動(dòng)力學(xué)模擬，分析了蛋白質(zhì)中原子和粒子的運(yùn)動(dòng)。

　　史密斯模擬了與冠狀病毒刺突蛋白對(duì)接的不同化合物，以確定它們中是否有任何一種化合物可以阻止刺突蛋白粘在人類(lèi)細(xì)胞上。

　　史密斯說(shuō)：“利用超級(jí)計(jì)算機(jī) Summit，我們根據(jù)一組標(biāo)準(zhǔn)對(duì)這些化合物進(jìn)行了排名，這些標(biāo)準(zhǔn)與它們與S蛋白刺突結(jié)合的可能性有關(guān)。”

　　田納西大學(xué)田納西大學(xué)州長(zhǎng)分子生物物理學(xué)主席、UT/ORNL 分子生物物理中心主任杰里米-史密斯(Jeremy Smith)補(bǔ)充說(shuō)：“我們的結(jié)果并不意味著我們已經(jīng)找到了治療新冠病毒的方法。”

　　“不過(guò)，我們非常希望，我們的計(jì)算結(jié)果將為未來(lái)的研究提供信息，并提供一個(gè)框架，供實(shí)驗(yàn)者用來(lái)進(jìn)一步研究這些化合物。只有到那時(shí)，我們才能知道其中是否有任何化合物表現(xiàn)出緩解這種病毒所需的特征。”

　　超級(jí)計(jì)算機(jī) Summit 通過(guò)其 4608 個(gè) IBM Power Systems AC922 服務(wù)器節(jié)點(diǎn)(每個(gè)節(jié)點(diǎn)配備兩個(gè) IBM POWER9 CPU 和 6 個(gè)英偉達(dá) Tensorcore V100 圖形處理器)為研究人員提供了海量數(shù)據(jù)處理能力，使其峰值性能達(dá)到 200 petaflops。

　　超級(jí)計(jì)算機(jī) Summit 還被用來(lái)幫助理解宇宙的起源，理解阿片類(lèi)藥物危機(jī)，并展示人類(lèi)如何能夠登陸火星。

　　IBM 首席執(zhí)行官羅睿蘭(Ginni Rometty)說(shuō)：“我們已經(jīng)要求 IBM 的技術(shù)和行業(yè)負(fù)責(zé)人考慮所有選項(xiàng)，以幫助政府和衛(wèi)生機(jī)構(gòu)監(jiān)測(cè)和管理疫情。”

　　羅睿蘭表示，除了在抗疫中使用超級(jí)計(jì)算機(jī) Summit 的計(jì)算能力外，IBM 的 Watson Health 健康部門(mén)正在與世界各地的衛(wèi)生組織直接合作，以更好地了解新冠病毒的性質(zhì)。

　　她說(shuō)：“IBM 臨床開(kāi)發(fā)系統(tǒng)已經(jīng)免費(fèi)提供給國(guó)家衛(wèi)生機(jī)構(gòu)，通過(guò)提供來(lái)自網(wǎng)絡(luò)設(shè)備的數(shù)據(jù)和分析來(lái)減少臨床試驗(yàn)的時(shí)間和成本。我們的操作風(fēng)險(xiǎn)洞察工具已經(jīng)提供給非營(yíng)利性組織。”（騰訊科技審校/樂(lè)學(xué)）

總結(jié)

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