穿山甲非新冠病毒中间宿主 或是可能的潜在自然宿主
趙漢斌/科技日報
記者24日從云南大學(xué)獲悉,該校省部共建云南生物資源保護(hù)與利用國家重點實驗室張志剛團(tuán)隊一項關(guān)于馬來穿山甲不是新冠病毒中間宿主,而可能是與新冠病毒類似的病毒潛在自然宿主的研究結(jié)果,近日在Cell子刊《當(dāng)代生物學(xué)》上正式發(fā)表。
圖片來源:云南大學(xué)省部共建云南生物資源保護(hù)與利用國家重點實驗室
今年2月2日,張志剛研究員帶領(lǐng)的團(tuán)隊對來自2019年3月24日無法救護(hù)成功的一只穿山甲肺樣本病毒組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行重新組裝和全面分析,發(fā)現(xiàn)其攜帶有與新冠病毒相近的冠狀病毒,被命名為穿山甲冠狀病毒(Pangolin-CoV),這種病毒與新冠病毒以及武漢病毒所石正麗團(tuán)隊報道的蝙蝠冠狀病毒的基因組相似性分別為91.02%和90.55%。
研究發(fā)現(xiàn),穿山甲冠狀病毒與新冠病毒的親緣關(guān)系僅次于蝙蝠冠狀病毒,但是穿山甲冠狀病毒與新冠病毒的S1功能基序高度一致,涉及與人類ACE2受體互作的五個關(guān)鍵氨基酸殘基完全一致,而蝙蝠冠狀病毒發(fā)生了四個突變,提示了穿山甲冠狀病毒與新冠病毒具有相似的宿主細(xì)胞識別能力。研究還發(fā)現(xiàn)在S1/S2酶切位點,新冠病毒含有中東呼吸綜合征冠狀病毒類似的Furin蛋白識別序列,而穿山甲冠狀病毒、蝙蝠冠狀病毒以及SARS冠狀病毒都缺失了該功能基序,表明新冠病毒與中東呼吸綜合征冠狀病毒具有相似的宿主細(xì)胞侵入機(jī)制。
相關(guān)研究進(jìn)展于2月15日第一時間上報到科技部“新型冠狀病毒感染的肺炎疫情應(yīng)急攻關(guān)項目”,預(yù)印本于2月20日在bioRXiv上公布。2月26日,《自然-新聞》作了引用報道。3月19日Cell子刊《當(dāng)代生物系》以“馬來穿山甲可能是類新冠病毒的潛在自然宿主”為題正式發(fā)表,研究數(shù)據(jù)可在相關(guān)平臺上自由獲取。
此前,武漢病毒所石正麗研究員報道的蝙蝠冠狀病毒RaTG13與新冠病毒的基因組相似性約96%,證明了中菊頭蝠是新冠病毒的潛在自然源頭。張志剛研究員告訴科技日報記者,由于穿山甲冠狀病毒與新冠病毒的基因組相似性沒有達(dá)到中間宿主所要求的99%或以上相似性,證明了穿山甲冠狀病毒與新冠病毒不是同一個病毒,只是類新冠病毒;同時也證明,穿山甲不是新冠病毒的中間宿主,而是新冠病毒的可能潛在自然宿主。
馬來穿山甲(Manis javanica)地理分布。圖源:https://www.wikiwand.com/en/Sunda_pangolin
今年2月7日,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)曾召開新聞發(fā)布會宣布,他們通過對病毒基因組分析,發(fā)現(xiàn)穿山甲體內(nèi)分離的病毒株與目前感染人的新冠病毒毒株序列相似度高達(dá)99%,穿山甲是新冠病毒的“潛在中間宿主”。隨后的研究證實,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)上述報道是誤報,并釋放出相似度為90.3%的修正數(shù)據(jù);同時,香港大學(xué)管軼團(tuán)隊發(fā)現(xiàn)的證據(jù)為92.4%。“幾個團(tuán)隊的研究樣本均來自2019年3月廣東海關(guān)曾截獲的同一批走私穿山甲。修正后的數(shù)據(jù)與我們的數(shù)據(jù)比較接近。”張志剛說。
綜合各方的研究表明,中菊頭蝠、馬來穿山甲只是可能的潛在自然源頭宿主,考慮與新冠病毒與中東呼吸綜合征冠狀病毒類似的一個涉及病毒感染的基因位點,甚至也可能是其他未發(fā)現(xiàn)的自然源頭宿主,無論是蝙蝠冠狀病毒、穿山甲冠狀病毒或其他可能尚未發(fā)現(xiàn)的自然源頭宿主攜帶的冠狀病毒,通過哪類中間宿主進(jìn)化,再傳到人類尚且不知,目前無法確定新冠病毒的中間宿主和自然源頭宿主。
張志剛研究團(tuán)隊認(rèn)為,從目前發(fā)現(xiàn)的中菊頭蝠、馬來穿山甲兩個可能的潛在源頭宿主分布區(qū)來看,中國華南也只是目前發(fā)現(xiàn)的可能潛在自然宿主之一的中菊頭蝠的部分分布區(qū),現(xiàn)有研究不能確定新冠病毒的發(fā)生地,更不能表明新冠病毒起源于中國。
中菊頭蝠(Rhinolophus affinis)的地理分布 圖源:https://www.thainationalparks.com/species/rhinolophus-affinis
“假如中菊頭蝠、馬來穿山甲這兩個可能的潛在自然源頭宿主,能被證明的確是新冠病毒的自然源頭宿主,那么它們現(xiàn)在的自然分布區(qū),都可能是新冠病毒的發(fā)生地。而至關(guān)重要的,是中間宿主是什么?在哪兒發(fā)生?為何在武漢爆發(fā)?更是未來科學(xué)研究的核心。”張志剛說。
這項研究還首次全面澄清了新冠病毒與穿山甲冠狀病毒、蝙蝠冠狀病毒、SARS冠狀病毒以及中東呼吸綜合征冠狀病毒的關(guān)系,認(rèn)為在蝙蝠和穿山甲之外,新冠病毒存在其它未知中間宿主,這為進(jìn)一步攻克病毒源頭和傳播路徑提供了重要參考。
對未來新冠病毒的溯源,張志剛研究團(tuán)隊建議,可集中到與走私馬來穿山甲交叉分布的蝙蝠、食肉動物以及偶蹄類動物、嚙齒類類動物及其自然分布區(qū)展開全面調(diào)查采樣,以及集中到與中菊頭蝠交叉分布的食肉動物、偶蹄類動物、嚙齒類動物及其自然分布區(qū)展開全面調(diào)查采樣。
總結(jié)
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