持續(xù)數(shù)月的新冠疫情一路肆虐、席卷全球，世界各地的科研人員都在為此奮戰(zhàn)，希望通過最先進(jìn)的技術(shù)逐步揭開新冠病毒的神秘面紗。近日，微軟亞洲研究院的研究人員基于在計(jì)算生物學(xué)、數(shù)據(jù)分析等領(lǐng)域的專業(yè)知識(shí)和研究經(jīng)驗(yàn)，構(gòu)建了新冠數(shù)據(jù)分析網(wǎng)站 COVID Insights (covid.msra.cn)，該網(wǎng)站以學(xué)術(shù)研究和科普為目的，希望透過數(shù)字表面，更深入、多角度地分析 COVID-19（2019冠狀病毒病）相關(guān)數(shù)據(jù)。

COVID Insights 網(wǎng)站主要包含感染數(shù)據(jù)分析、基因組和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、研究趨勢三大板塊，以可視化和互動(dòng)的方式直觀展現(xiàn)了疫情在不同國家和地區(qū)的傳播特性、引起疫情的病毒 SARS-CoV-2的病毒學(xué)分析結(jié)果，以及全球最新的相關(guān)研究熱點(diǎn)。網(wǎng)站使用的所有數(shù)據(jù)均來自約翰霍普金斯大學(xué)、美國疾病控制與預(yù)防中心、GISAID 等機(jī)構(gòu)的官方發(fā)布。基于這些公開數(shù)據(jù)，研究員們利用先進(jìn)的技術(shù)挖掘疫情數(shù)據(jù)背后隱藏的規(guī)律和洞察，為進(jìn)一步拓展對(duì)疫情的思考提供有價(jià)值的參考。

哪兩個(gè)地區(qū)的疫情發(fā)展最相似？

感染數(shù)據(jù)分析頁面通過對(duì) COVID-19數(shù)據(jù)的深度分析，呈現(xiàn)了跨國家和地區(qū)間傳播動(dòng)態(tài)比較。例如，通過分析我們發(fā)現(xiàn)德國從2月27日到3月14日的數(shù)據(jù)趨勢曲線與韓國從2月18日到3月5日的數(shù)據(jù)趨勢曲線很相近。因此韓國在3月5日以后開展的各項(xiàng)疾控措施對(duì)3月中旬的德國來說可能具有更為精準(zhǔn)的借鑒作用。

在這里，研究員們將 COVID-19時(shí)間序列數(shù)據(jù)在低維歐式空間中進(jìn)行表示。對(duì)于一個(gè)給定的地區(qū)和時(shí)間片段，在這個(gè)空間中使用一個(gè)向量來反映其數(shù)據(jù)的趨勢。這樣就可以有效地發(fā)現(xiàn)哪些國家或地區(qū)、在哪些時(shí)間段的數(shù)據(jù)發(fā)展相似，找到合適的參考對(duì)象。

此外，該頁面基于四個(gè)不同地區(qū)的開源數(shù)據(jù)，為與感染相關(guān)的高風(fēng)險(xiǎn)活動(dòng)提供了一個(gè)統(tǒng)一的數(shù)據(jù)分析視角，方便對(duì)比地區(qū)間傳播數(shù)據(jù)的差異。例如，對(duì)法國來說，許多感染是通過“群眾聚集”發(fā)生的，而對(duì)新加坡來說，“國際旅行”是造成感染的最主要原因。

由于各地區(qū)的數(shù)據(jù)差異較大，有效信息或展現(xiàn)在不同的尺度上，或隱含在冗長的病例通報(bào)中。研究員們將非結(jié)構(gòu)化的病例描述映射到統(tǒng)一的高風(fēng)險(xiǎn)活動(dòng)分布中進(jìn)行可視化，很好地解決了這個(gè)挑戰(zhàn)。對(duì)于高風(fēng)險(xiǎn)活動(dòng)的歸因分析，尤其是不同地區(qū)的不同歸因結(jié)果，可以為預(yù)防感染提供個(gè)性化參考。

SARS-CoV-2在全球哪些地區(qū)發(fā)生了變異？

COVID Insights 網(wǎng)站的“基因組和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)”頁面展示了 SARS-CoV-2的最新病毒學(xué)分析結(jié)果。新型冠狀病毒 SARS-CoV-2演變至今，已發(fā)生很多處基因組變異，用戶可以通過交互探究病毒序列中發(fā)生變異的氨基酸及其位置，該變異發(fā)生的地理位置以及相應(yīng)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。

研究員們從全球流感序列數(shù)據(jù)庫GISAID上下載新型冠狀病毒 SARS-CoV-2基因組數(shù)據(jù)。然后，以病毒株 Wuhan-Hu-1（GenBank MN908947.3）作為參考序列，確定出各病毒序列中發(fā)生變異的氨基酸及其位置。對(duì)每一個(gè)存在變異的位置，研究員們通過計(jì)算熵顯示該位置氨基酸的多樣性及其在各地區(qū)的分布和時(shí)間線。

研究員們還將 SARS-CoV-2病毒核酸序列轉(zhuǎn)化成蛋白質(zhì)序列，并將整個(gè)序列按照不同區(qū)域進(jìn)行分割，最終呈現(xiàn)出蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)。此外，用戶還可以看到 SARS-CoV-2與包括 SARS、MERS 在內(nèi)的四種冠狀病毒的基因組比較分析，了解它們之間的異同。

關(guān)于疫情和病毒的最新研究熱點(diǎn)有哪些？

在研究趨勢頁面，用戶可以通過可視化信息了解當(dāng)前新冠相關(guān)主題的熱門論文和主題變化趨勢。研究員們通過自動(dòng)聚類技術(shù)，對(duì)于熱詞進(jìn)行聚合形成詞云，并且通過每周更新展示時(shí)間粒度上的變化趨勢，希望可以給研究者們帶來更多啟示。

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的微软亚洲研究院推出新冠数据分析网站COVID Insights的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

如果覺得生活随笔網(wǎng)站內(nèi)容還不錯(cuò)，歡迎將生活随笔推薦給好友。