RNA-Seq如何应用于转录组学的研究?
生活随笔
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RNA-Seq如何应用于转录组学的研究?
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轉(zhuǎn)錄組是特定組織或細(xì)胞在某一發(fā)育階段或功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的集合。轉(zhuǎn)錄組研究能夠從整體水平研究基因功能以及基因結(jié)構(gòu),揭示特定生物學(xué)過程以及疾病發(fā)生過程中的分子機(jī)理。RNA-Seq作為一種新的高效、快捷的轉(zhuǎn)錄組研究手段正在改變著人們對轉(zhuǎn)錄組的認(rèn)識。RNA-Seq利用高通量測序技術(shù)對組織或細(xì)胞中所有RNA反轉(zhuǎn)錄而成的cDNA文庫進(jìn)行測序,通過統(tǒng)計相關(guān)讀段(reads)數(shù)計算出不同RNA的表達(dá)量,發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本;如果有基因組參考序列,可以把轉(zhuǎn)錄本映射回基因組,確定轉(zhuǎn)錄本位置、剪切情況等更為全面的遺傳信息,已廣泛應(yīng)用于生物學(xué)研究、醫(yī)學(xué)研究、臨床研究和藥物研發(fā)等。
總結(jié)
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