以往利用轉座子標簽和芯片技術的研究表明,在酵母、果蠅和人類的基因組中有許多新的轉錄區存在。但是由于交叉雜交,芯片結果的準確性是不確定的,RNA-Seq不受背景噪音問題的困擾,已證實至少75%,也許大于90%的釀酒酵母和栗酒裂殖酵母的基因組表達。此外,RNA-Seq結果表明,在每一個檢測的基因組中都存在大量的新轉錄區域,包括釀酒酵母、栗酒裂殖酵母、擬南芥、水稻、小鼠、人、和人體白色念珠菌等基因組。在釀酒酵母和栗酒裂殖酵母中分別發現了487個和453個新轉錄本,其中釀酒酵母的新轉錄本中有一半用芯片技術沒有鑒定出來。在水稻中檢測出的7232個新轉錄區,其大部分轉錄水平都低于已知的cDNA基因。

總結

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