先說一下Genomics API。這是Global Alliance of Genomics and Health組織下的Data Working Group的作品。當然，Google是其中的主力主力之一，其他的大神包括Durbin、Haussler等人。這個API的目的是為了建立起全球范圍內基因組數據存儲系統對外提供API的標準。很多機構，例如BGI、國家基因庫、NCBI、EBI、Google等都在建立自己的基因組數據存儲系統。但數據光存著顯然沒什么意義，要利用起來。于是，我們相信會有更多的大大小小的公司基于這些數據去開發應用。這時候，這些數據存儲機構提供的接口肯定是五花八門的。比較low的可能就直接ftp了，當然更大的可能是建立web service做一些控制，底層也可以做一些優化。Genomics API的目的就是為了統一這些接口。如果大家都能遵守這些接口，上層的應用就可以應用到各個機構存儲的數據上。Google為了演示這些接口的時候，已經開發了一些東西。比如，你可以把BAM文件放在Google的Cloud Storage上，然后導入Google Genomics。Google Genomics API是GA4GH制定的Genomics API標準的一個實現，所以只要是兼容Genomics API的應用都可以訪問Google Genomics里面的數據。為了保證這些基因組數據的訪問效率，Google Cloud Storage和Google Genomics肯定在底層做了不少事情。為了演示這些API的使用，Google也開發了一些應用，詳見：https://github.com/googlegenomics所以，無論是想提供存基因組數據的服務，還是想開發基因組的應用，最好是能兼容GA4GH的這套Genomics API。BTW，阿里云，七牛，你們什么時候跟上？好吧，也問問國家基因庫：）至于跟DNANexus的API的關系，沒多大關系。不過以后你存儲在DNANexus或者Seven Bridges Genomics上的基因組數據應該是很有可能會支持Genomics API的

Google Genomics API 目前支持數據存儲和查看，但不支持序列比對，估計未來2到3年內也不會支持序列比對，目前還沒有這個計劃

谷歌在其官方博客中稱，由于看重基因測序和健康領域，谷歌加入一個致力于為人類健康提供更好的標準、政策以及技術的全球聯盟（Global Alliance）組織。在這一領域谷歌將充分發揮自己在技術以及健康研究方面的獨特優勢。谷歌提供一個開源項目 API 的端口，幫助用戶大規模導入、處理、存儲和搜索基因組數據，從而實現用戶僅僅利用 API 端口，將能方便地將數據儲存在谷歌的云端服務器上。谷歌的這個基因組 API 一開始就將專注于如下內容：1、專注于科學，而不是服務器和文件格式2、安全地存儲基因組數據3、盡可能多地存儲數據盡管目前潛在的用戶如需訪問數據庫，仍需要向谷歌申請基因組 API 訪問請求，但終有一天，谷歌會把這個決定權交予全球聯盟來決定。谷歌表示此舉將是全球衛生和醫療環境的一次重大變革，同時也會引起全球聯盟其他成員的興趣即：如何將數據科學同生命科學結合在一起。

總結

以上是生活随笔為你收集整理的如何评价Google Genomics API？的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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