基因组学和生物信息学的联系和区别?
生活随笔
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基因组学和生物信息学的联系和区别?
小編覺得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
剛接觸生物學(xué)的時(shí)候,我對生物信息學(xué)的定義感覺也很模糊,只到做畢設(shè)的時(shí)候才清晰起來。其實(shí)“基因組學(xué)”和“生物信息學(xué)”兩個(gè)領(lǐng)域,是從不同角度對生物學(xué)范疇內(nèi)一部分知識的各自劃定,而劃定的規(guī)則完全不同。”基因組學(xué)“這個(gè)領(lǐng)域的劃分,是研究對象”基因組“決定的。因此只要是和基因組相關(guān)的知識和研究問題就屬于這一范疇,例如我們常常聽到的基因組測序、單核苷酸多態(tài)性、DNA甲基化和去甲基化等等。而”生物信息學(xué)“這個(gè)領(lǐng)域的劃分,則是由研究方法”信息學(xué)“決定的。因此凡是運(yùn)用到信息學(xué)方法研究的生物學(xué)問題都可以算是生物信息學(xué),例如基因組序列分析、RNA和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測、蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建和分析等。所以綜上所述,我不是很同意另一個(gè)回答”基因組學(xué)是生物信息學(xué)的一個(gè)分支“的說法。我認(rèn)為更確切的是,有一些用生物信息學(xué)的方法來解決的基因組學(xué)問題,那么這一些問題就屬于兩個(gè)學(xué)科的交集。而兩個(gè)學(xué)科各自有不相交的內(nèi)容。基因組學(xué)中,早期的遺傳分析、分子雜交以及現(xiàn)在的DNA化學(xué)修飾機(jī)制等問題的很多相關(guān)研究并不需要借助生物信息學(xué)方法。而生物信息學(xué)中則有更多的問題不屬于基因組學(xué)范疇,正如其他答案中舉例。至于兩個(gè)領(lǐng)域的發(fā)展前景,我是這么認(rèn)為的。當(dāng)代越來越發(fā)達(dá)的計(jì)算機(jī)科學(xué)和信息學(xué)正在快速滲透入基礎(chǔ)科學(xué)研究的其他領(lǐng)域。作為從遺傳學(xué)發(fā)展而來的基因組學(xué),原本是傳統(tǒng)生物學(xué)的學(xué)科。但是當(dāng)基因組學(xué)發(fā)展到想要回答一些宏觀的問題,例如涉及全基因組而不是幾個(gè)DNA分子的問題時(shí),就需要借助信息學(xué)方法。其他的基礎(chǔ)學(xué)科也面臨著這樣的技術(shù)革命。我想題主提出這個(gè)問題,可能也是信息學(xué)全面滲透入基因組學(xué)的一個(gè)體現(xiàn)。
我們可以形象的這樣比喻生物信息學(xué)相當(dāng)于工具,而基因組學(xué)相當(dāng)于材料,兩者有效結(jié)合,生物信息學(xué)不僅包括基因組學(xué)的內(nèi)容,還包括蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué),代謝組學(xué)等。我們在平時(shí)的研究中借用生物信息學(xué)中所涉及的分析方法對基因組進(jìn)行分析,研究基因的功能、結(jié)構(gòu)、進(jìn)化等
個(gè)人認(rèn)為是包含與被包含的關(guān)系,基因組學(xué)包含著生物信息學(xué),生物信息學(xué)是基因組學(xué)的一種研究方法。基因組學(xué)(英語:Genomics),或基因體學(xué),是研究生物基因組和如何利用基因的一門學(xué)問。該學(xué)科提供基因組信息以及相關(guān)數(shù)據(jù)系統(tǒng)利用,試圖解決生物,醫(yī)學(xué),和工業(yè)領(lǐng)域的重大問題。基因組學(xué)能為一些疾病提供新的診斷,治療方法。例如,對剛診斷為乳腺癌的女性,一個(gè)名為“Oncotype DX”的基因組測試,能用來評估病人乳腺癌復(fù)發(fā)的個(gè)體危險(xiǎn)率以及化療效果,這有助于醫(yī)生獲得更多的治療信息并進(jìn)行個(gè)性化醫(yī)療。基因組學(xué)還被用于食品與農(nóng)業(yè)部門。基因組學(xué)的主要工具和方法包括: 生物信息學(xué),遺傳分析,基因表達(dá)測量和基因功能鑒定。準(zhǔn)備回答生物信息學(xué)(英語:bioinformatics)利用應(yīng)用數(shù)學(xué)、信息學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)的方法研究生物學(xué)的問題。目前的生物信息學(xué)基本上只是分子生物學(xué)與信息技術(shù)(尤其是互聯(lián)網(wǎng)技術(shù))的結(jié)合體。生物信息學(xué)的研究材料和結(jié)果就是各種各樣的生物學(xué)數(shù)據(jù),其研究工具是計(jì)算機(jī),研究方法包括對生物學(xué)數(shù)據(jù)的搜索(收集和篩選)、處理(編輯、整理、管理和顯示)及利用(計(jì)算、模擬)。目前主要的研究方向有:序列比對、基因識別、基因重組、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測、基因表達(dá)、蛋白質(zhì)反應(yīng)的預(yù)測,以及建立進(jìn)化模型。生物學(xué)技術(shù)往往生成大量的嘈雜數(shù)據(jù)。與數(shù)據(jù)挖掘類似,生物信息學(xué)利用數(shù)學(xué)工具從大量數(shù)據(jù)中提取有用的生物學(xué)信息。生物信息學(xué)所要處理的典型問題包括:重新組裝在霰彈槍定序法測序過程中被打散的DNA序列,從蛋白質(zhì)的氨基酸序列預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),利用mRNA微陣列或質(zhì)譜儀的數(shù)據(jù)檢驗(yàn)基因調(diào)控的假說。
我們可以形象的這樣比喻生物信息學(xué)相當(dāng)于工具,而基因組學(xué)相當(dāng)于材料,兩者有效結(jié)合,生物信息學(xué)不僅包括基因組學(xué)的內(nèi)容,還包括蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué),代謝組學(xué)等。我們在平時(shí)的研究中借用生物信息學(xué)中所涉及的分析方法對基因組進(jìn)行分析,研究基因的功能、結(jié)構(gòu)、進(jìn)化等
個(gè)人認(rèn)為是包含與被包含的關(guān)系,基因組學(xué)包含著生物信息學(xué),生物信息學(xué)是基因組學(xué)的一種研究方法。基因組學(xué)(英語:Genomics),或基因體學(xué),是研究生物基因組和如何利用基因的一門學(xué)問。該學(xué)科提供基因組信息以及相關(guān)數(shù)據(jù)系統(tǒng)利用,試圖解決生物,醫(yī)學(xué),和工業(yè)領(lǐng)域的重大問題。基因組學(xué)能為一些疾病提供新的診斷,治療方法。例如,對剛診斷為乳腺癌的女性,一個(gè)名為“Oncotype DX”的基因組測試,能用來評估病人乳腺癌復(fù)發(fā)的個(gè)體危險(xiǎn)率以及化療效果,這有助于醫(yī)生獲得更多的治療信息并進(jìn)行個(gè)性化醫(yī)療。基因組學(xué)還被用于食品與農(nóng)業(yè)部門。基因組學(xué)的主要工具和方法包括: 生物信息學(xué),遺傳分析,基因表達(dá)測量和基因功能鑒定。準(zhǔn)備回答生物信息學(xué)(英語:bioinformatics)利用應(yīng)用數(shù)學(xué)、信息學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)的方法研究生物學(xué)的問題。目前的生物信息學(xué)基本上只是分子生物學(xué)與信息技術(shù)(尤其是互聯(lián)網(wǎng)技術(shù))的結(jié)合體。生物信息學(xué)的研究材料和結(jié)果就是各種各樣的生物學(xué)數(shù)據(jù),其研究工具是計(jì)算機(jī),研究方法包括對生物學(xué)數(shù)據(jù)的搜索(收集和篩選)、處理(編輯、整理、管理和顯示)及利用(計(jì)算、模擬)。目前主要的研究方向有:序列比對、基因識別、基因重組、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測、基因表達(dá)、蛋白質(zhì)反應(yīng)的預(yù)測,以及建立進(jìn)化模型。生物學(xué)技術(shù)往往生成大量的嘈雜數(shù)據(jù)。與數(shù)據(jù)挖掘類似,生物信息學(xué)利用數(shù)學(xué)工具從大量數(shù)據(jù)中提取有用的生物學(xué)信息。生物信息學(xué)所要處理的典型問題包括:重新組裝在霰彈槍定序法測序過程中被打散的DNA序列,從蛋白質(zhì)的氨基酸序列預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),利用mRNA微陣列或質(zhì)譜儀的數(shù)據(jù)檢驗(yàn)基因調(diào)控的假說。
總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的基因组学和生物信息学的联系和区别?的全部內(nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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