数据分析手段对癌症新靶点发现有帮助吗?
生活随笔
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数据分析手段对癌症新靶点发现有帮助吗?
小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.
有的。使用一些數(shù)據(jù)分析方法可以幫助科研人員從成堆的遺傳數(shù)據(jù)中篩選有用信息,有助于發(fā)現(xiàn)新的基因網(wǎng)絡,并可以依據(jù)基因網(wǎng)絡來推測某個突變基因?qū)δ[瘤所產(chǎn)生的影響。比如,今年有一項研究采用一種新的算法(Hotnet2)分析了來自癌癥基因組數(shù)據(jù)集(TCGA)中12種不同類型的癌癥遺傳數(shù)據(jù),識別出了十幾個基因子網(wǎng)絡,其中有好幾個都屬于前人沒關(guān)注或者沒發(fā)覺到的,但卻在數(shù)據(jù)集的3281個樣本中都有體現(xiàn)。甚至,研究人員并不完全是基于患者的遺傳變異,而是針對很多體細胞變異(正常人體內(nèi)也會發(fā)生的一些基因變異)進行的分析。這項研究結(jié)果將人們的注意力從患者特有的遺傳變異轉(zhuǎn)移到了更為常見的體細胞變異上,甚至給出了體細胞變異也可能成為癌癥致病推動力的可能。眾所周知,基因發(fā)揮作用往往不是“單兵作戰(zhàn)”,而是聯(lián)合其他基因組成一個基因網(wǎng)絡和信號通路來實現(xiàn)細胞的功能,也就是“聯(lián)合作戰(zhàn)式”。因此,在有些案例中,位于同一信號通路的多個基因中的單個突變就可能導致癌癥的發(fā)生。這個算法正是在網(wǎng)絡水平上分析基因,能夠幫助識別一些雖罕見但在癌癥中起著重要作用的基因,利用這種分析方法就可以發(fā)現(xiàn)癌癥的一些新靶點。舉個例子,某個基因可能在80%的樣本中都有變異,但是剩余20%樣本中卻有一些罕見突變是在其他基因上的,如果我們發(fā)現(xiàn)有罕見突變的這些基因與更常見突變的基因是在同一個信號通路上,那么我們可能就會發(fā)現(xiàn)這些罕見突變也同樣重要。
總結(jié)
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