染色质免疫沉淀测序技术有没有新的进展呢?
生活随笔
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染色质免疫沉淀测序技术有没有新的进展呢?
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有啊,北京大學生物動態光學成像中心黃巖誼課題組與湯富酬課題組合作,發展了一種基于微流控芯片的微量細胞樣品處理與核酸俘獲方法,成功實現了針對1000個細胞的染色質免疫沉淀測序(ChIP-Seq),所謂的ChIP-Seq方法,就是現代測序技術通過有針對性地俘獲和富集特定蛋白,獲取與這些蛋白結合的DNA片段,將其進行純化后用于高通量測序,獲取特定DNA-蛋白相互作用和結合位點的完整信息。這一技術的開發,大大減少了樣品起始量的消耗,在反應效率得到提升的同時極大地降低損失的發生,節約反應時間,還減少了操作誤差,實現了更高的可靠性和更好的平行性。 利用微流控技術,將實驗操作中關鍵的染色質與抗體-磁珠復合物的共價結合步驟與非特異性吸附的洗滌等步驟集成在一個微型器件上,可以同時進行多個樣品的操作。并且這項技術也得到了很好的利用,研究人員利用這一方法,研究了H3K4me3在小鼠胚胎干細胞、小鼠表皮干細胞以及小鼠胚胎發育至6.5天的外胚層細胞中的修飾模式,與已有的技術相比,這一工作展示了目前細胞總起始需求量最少的無需測序建庫前進行核酸擴增的微量細胞ChIP-Seq實驗結果。相關結果發表在Cell Research上。
總結
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