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唾液取样能够上NGS么,样品量够不够?

發(fā)布時間:2023/11/22 万象百科 60 博士
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 唾液取样能够上NGS么,样品量够不够? 小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.
DNA Genotek的那個Og-500就是為全基因組設(shè)計的吧

曾有實(shí)驗(yàn)顯示是搜集700ul唾液能夠提取獲得約18ug gDNA,這一個方面可能是唾液中g(shù)DNA含量不等等原因有關(guān),就算我們按照1ml 唾液大約最多能夠提取獲得~200ng gDNA來計算:NGS平臺,如果是最常用的HiSeq 2000,需要1.2ug最低起始量來構(gòu)建常規(guī)shotgun文庫;若構(gòu)建designated insert size shotgun library則最低起始量需要3.0ug。HiSeq X Ten測序平臺文庫構(gòu)建起始量也需要2-3.0ug。可見一次搜集提取量是不太夠的,可以通過多次采集唾液來進(jìn)行搜集,不過建議直接采集外周血更為方便,希望對您問題的解決有幫助。

總結(jié)

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