超深度测序技术在 HBV 准种研究中有什么进展吗?
生活随笔
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超深度测序技术在 HBV 准种研究中有什么进展吗?
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有啊,1993 年,Blum 首先提出乙型肝炎病毒 (HBV) 存在準種的假說。HBV 復制過程中的高復制率和高出錯率,導致大量變異株的產生,這些變異株組成了 HBV 準種,超深度測序突破了 Sanger 測序的局限,對于混合樣本中的每對堿基可以達到 10 000 次以上的覆蓋,高通量和高敏感性的特點使之前很多難以開展的研究得以實現,為 HBV 準種提供了一個強有力的研究工具。Margeridon-Thermet 等分別用超深度測序和 PCR 直接測序的方法對 20 份接受過 NAs (LAM、阿德福韋酯和恩替卡韋) 治療和 17 份未接受過 NAs 治療的乙型肝炎患者血清進行分析,檢測其相關突變位點,對于接受過 NAs 治療的患者,每個血清樣本中,應用 UDS 可以比直接測序法平均多檢測到 4.6 個突變位點,顯現了 UDS 檢測 HBV 耐藥突變的優勢。
總結
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