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为什么我们不把NGS称为第二代测序技术,而是称为下一代测序技术呢?

發(fā)布時(shí)間:2023/11/23 万象百科 48 博士
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 为什么我们不把NGS称为第二代测序技术,而是称为下一代测序技术呢? 小編覺得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
這是技術(shù)開發(fā)人員的叫法了,說白了就看個(gè)人喜好和心情了,說不定技術(shù)開發(fā)者之前用著二代測(cè)序儀,后面發(fā)現(xiàn)了三代測(cè)序儀非常欣喜的告訴朋友:“我成功開發(fā)了下一代測(cè)序技術(shù)”,這個(gè)下一代是針對(duì)第二代而言的,這種情況也不是沒有可能,關(guān)鍵在于技術(shù),命名是開發(fā)者的專利啊。

習(xí)慣叫法罷了,樓主何須糾結(jié)!下一代測(cè)序技術(shù)名稱應(yīng)該是針對(duì)第1代測(cè)序技術(shù)——熒光標(biāo)記的Sanger 法之后出現(xiàn)。第一代Sanger技術(shù)利用放射性同位素標(biāo)記引物,進(jìn)行DNA梯狀成像。使用雙脫氧核苷酸分別作4個(gè)末端終止反應(yīng),用平板凝膠電泳的4條電泳道分離4個(gè)反應(yīng)所得產(chǎn)物。在第一臺(tái)全自動(dòng)測(cè)序儀出現(xiàn)之前, 使用最為廣泛的測(cè)序方法就是Sanger 在20 世紀(jì)70 年代中期發(fā)明的末端終止法測(cè)序技術(shù). Sanger 也因此獲得1980年的諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng). 這種方法主要依靠手工操作, 難以自動(dòng)化. 例如, 它利用放射性同位素標(biāo)記引物來進(jìn)行DNA 梯狀成像, 操作十分不方便. 要使用雙脫氧核苷酸分別做4 個(gè)末端終止反應(yīng), 然后采用平板凝膠電泳技術(shù), 用4 條電泳道來分離4 個(gè)反應(yīng)所得產(chǎn)物, 費(fèi)時(shí)費(fèi)力, 試劑消耗也大, 這些都嚴(yán)重限制了測(cè)序的通量。樓主提到的下一代測(cè)序技術(shù),也就是第2 代測(cè)序技術(shù)(Next Generation Sequencing,NGS),即循環(huán)陣列合成測(cè)序法。就是用大規(guī)模矩陣結(jié)構(gòu)的微陣列 ,利用 DNA聚合酶或連接酶及引物對(duì)模板進(jìn)行一系列延伸 ,通過顯微技術(shù),觀察記錄連續(xù)測(cè)序循環(huán)中的光學(xué)信號(hào),實(shí)現(xiàn)測(cè)序 ,可同時(shí)并行分析陣列上 DNA樣本。與一代Sanger測(cè)序相比,NGS在技術(shù)上是質(zhì)的飛躍。但在臨床上,各有所長(zhǎng)。Sanger測(cè)序基于單個(gè)基因檢測(cè),NGS主要是高通量樣品和基因同時(shí)檢測(cè)。而且目前也出現(xiàn)了第3代TGS(Third Generation Sequencing)基因檢測(cè)技術(shù),命名上也沒問題。第3代技術(shù)無需模板預(yù)先擴(kuò)增,通過在單一 DNA 分子組成的陣列上進(jìn)行合成測(cè)序 ,通過物理等各種技術(shù)手段,觀察和記錄 DNA聚合酶合成 DNA的過程。

我個(gè)人YY一下,這種叫法其實(shí)站在開發(fā)者的角度,已經(jīng)覺得自己的技術(shù)應(yīng)該達(dá)到巔峰了,永遠(yuǎn)不會(huì)過時(shí)!所以取名Next,無論你開發(fā)到第幾代,我永遠(yuǎn)是下一個(gè)的感覺,唯我獨(dú)尊,實(shí)際上我覺得第二代測(cè)序技術(shù),僅僅是個(gè)人看法,應(yīng)該差不多到了極限了,至少第三代或者第四代應(yīng)該很難在這個(gè)上面實(shí)現(xiàn)較大的突破了。

總結(jié)

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