RPA有可能取代PCR吗?
生活随笔
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RPA有可能取代PCR吗?
小編覺(jué)得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
個(gè)人覺(jué)得不能,自從PCR技術(shù)發(fā)明以后,各種基因的克隆都運(yùn)用了PCR技術(shù),現(xiàn)在PCR無(wú)論從技術(shù)的成熟方面到結(jié)果的準(zhǔn)確方面都是具有優(yōu)勢(shì)的,并且傳統(tǒng)的PCR利用的DNA聚合酶非常的便宜,所以現(xiàn)在幾乎每個(gè)做分子方面的研究都會(huì)用到,而RAP技術(shù)雖然有很多優(yōu)點(diǎn),但還沒(méi)有普及。
很有可能取代PCR。RPA主要依賴(lài)于三種酶:能結(jié)合單鏈核酸(寡核苷酸引物)的重組酶、單鏈DNA結(jié)合蛋白(SSB)和鏈置換DNA聚合酶。這三種酶的混合物在常溫下也有活性,最佳反應(yīng)溫度在37°C左右。重組酶與引物結(jié)合形成的蛋白-DNA復(fù)合物,能在雙鏈DNA中尋找同源序列。一旦引物定位了同源序列,就會(huì)發(fā)生鏈交換反應(yīng)形成并啟動(dòng)DNA合成,對(duì)模板上的目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行指數(shù)式擴(kuò)增。被替換的DNA鏈與SSB結(jié)合,防止進(jìn)一步替換。在這個(gè)體系中,由兩個(gè)相對(duì)的引物起始一個(gè)合成事件。整個(gè)過(guò)程進(jìn)行得非常快,一般可在十分鐘之內(nèi)獲得可檢出水平的擴(kuò)增產(chǎn)物。常規(guī)PCR必須經(jīng)過(guò)變性、退火、延伸三個(gè)步驟,而PCR儀本質(zhì)上就是一個(gè)控制溫度升降的設(shè)備。RPA反應(yīng)的最適溫度在37°C-42°C之間,無(wú)需變性,在常溫下即可進(jìn)行。這無(wú)疑能大大加快PCR的速度。此外,由于不需要溫控設(shè)備,RPA可以真正實(shí)現(xiàn)便攜式的快速核酸檢測(cè)。RPA檢測(cè)的靈敏度很高,能夠?qū)⒑哿康暮怂幔ㄓ绕涫荄NA)模板擴(kuò)增到可以檢出的水平,從單個(gè)模板分子得到大約1012擴(kuò)增產(chǎn)物。而且RPA還用不著復(fù)雜的樣品處理,適用于無(wú)法提取核酸的實(shí)地檢測(cè)。RPA既可以擴(kuò)增DNA也可以擴(kuò)增RNA,還省去了額外的cDNA合成步驟。你不僅可以對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行終點(diǎn)檢測(cè),還可以對(duì)擴(kuò)增過(guò)程進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)控,甚至可以通過(guò)試紙條(側(cè)流層析試紙條LFD)讀取結(jié)果。目前,TwistAmp?試劑盒的擴(kuò)增子長(zhǎng)度在500bp以?xún)?nèi)。不過(guò),經(jīng)過(guò)特別優(yōu)化的RPA擴(kuò)增,也可以生成更長(zhǎng)的擴(kuò)增產(chǎn)物,或者減慢擴(kuò)增速度(便于定量),甚至在更低的溫度下進(jìn)行反應(yīng)。
很有可能取代PCR。RPA主要依賴(lài)于三種酶:能結(jié)合單鏈核酸(寡核苷酸引物)的重組酶、單鏈DNA結(jié)合蛋白(SSB)和鏈置換DNA聚合酶。這三種酶的混合物在常溫下也有活性,最佳反應(yīng)溫度在37°C左右。重組酶與引物結(jié)合形成的蛋白-DNA復(fù)合物,能在雙鏈DNA中尋找同源序列。一旦引物定位了同源序列,就會(huì)發(fā)生鏈交換反應(yīng)形成并啟動(dòng)DNA合成,對(duì)模板上的目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行指數(shù)式擴(kuò)增。被替換的DNA鏈與SSB結(jié)合,防止進(jìn)一步替換。在這個(gè)體系中,由兩個(gè)相對(duì)的引物起始一個(gè)合成事件。整個(gè)過(guò)程進(jìn)行得非常快,一般可在十分鐘之內(nèi)獲得可檢出水平的擴(kuò)增產(chǎn)物。常規(guī)PCR必須經(jīng)過(guò)變性、退火、延伸三個(gè)步驟,而PCR儀本質(zhì)上就是一個(gè)控制溫度升降的設(shè)備。RPA反應(yīng)的最適溫度在37°C-42°C之間,無(wú)需變性,在常溫下即可進(jìn)行。這無(wú)疑能大大加快PCR的速度。此外,由于不需要溫控設(shè)備,RPA可以真正實(shí)現(xiàn)便攜式的快速核酸檢測(cè)。RPA檢測(cè)的靈敏度很高,能夠?qū)⒑哿康暮怂幔ㄓ绕涫荄NA)模板擴(kuò)增到可以檢出的水平,從單個(gè)模板分子得到大約1012擴(kuò)增產(chǎn)物。而且RPA還用不著復(fù)雜的樣品處理,適用于無(wú)法提取核酸的實(shí)地檢測(cè)。RPA既可以擴(kuò)增DNA也可以擴(kuò)增RNA,還省去了額外的cDNA合成步驟。你不僅可以對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行終點(diǎn)檢測(cè),還可以對(duì)擴(kuò)增過(guò)程進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)控,甚至可以通過(guò)試紙條(側(cè)流層析試紙條LFD)讀取結(jié)果。目前,TwistAmp?試劑盒的擴(kuò)增子長(zhǎng)度在500bp以?xún)?nèi)。不過(guò),經(jīng)過(guò)特別優(yōu)化的RPA擴(kuò)增,也可以生成更長(zhǎng)的擴(kuò)增產(chǎn)物,或者減慢擴(kuò)增速度(便于定量),甚至在更低的溫度下進(jìn)行反應(yīng)。
總結(jié)
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