癌症基因组测序有没有难以充分解读的区域呢?
生活随笔
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癌症基因组测序有没有难以充分解读的区域呢?
小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.
題主問的 問題很不清晰啊,所謂難以 充分解讀的區(qū)域指的是什么呢?可以解讀為,因為技術(shù)限制而對基因的堿基對排列難以測序,但是現(xiàn)在的測序技術(shù)是不存在這樣的技術(shù)瓶頸的。還有一種就是一樓所說的,是因為研究人員對基因結(jié)構(gòu)的認識限制,忽略了一些區(qū)域的測序,事實上這部分就不應該稱為難以充分解讀了。
有的,研究人員比較CCLE(Cancer Cell Line Encyclopedia)和COSMIC(Catalogue of Somatic Mutations in Cancer)兩個目前最主要的癌癥基因組測序數(shù)據(jù)庫,發(fā)現(xiàn)同一個細胞系里的錯義突變存在著顯著的差異差異的主要原因是外顯子組中GC含量高的區(qū)域沒有得到充分測序。接著,研究人員根據(jù)已知的癌癥基因,鑒定了四百多個始終沒有充分測序的區(qū)域(cold-spot),并將它們稱為癌癥基因組測序的盲點,發(fā)掘這些盲點進一步解析突變對癌癥的影響,以便能夠更早檢測和診斷癌癥,開發(fā)出更好的治療策略。
有的,研究人員比較CCLE(Cancer Cell Line Encyclopedia)和COSMIC(Catalogue of Somatic Mutations in Cancer)兩個目前最主要的癌癥基因組測序數(shù)據(jù)庫,發(fā)現(xiàn)同一個細胞系里的錯義突變存在著顯著的差異差異的主要原因是外顯子組中GC含量高的區(qū)域沒有得到充分測序。接著,研究人員根據(jù)已知的癌癥基因,鑒定了四百多個始終沒有充分測序的區(qū)域(cold-spot),并將它們稱為癌癥基因組測序的盲點,發(fā)掘這些盲點進一步解析突變對癌癥的影響,以便能夠更早檢測和診斷癌癥,開發(fā)出更好的治療策略。
總結(jié)
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