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目前主要的DNA数据库有哪些?

發(fā)布時間:2023/11/23 万象百科 70 博士
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 目前主要的DNA数据库有哪些? 小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.
國際上比較重要的核酸(含蛋白質(zhì))一級數(shù)據(jù)庫有美國的GenBank、歐洲的EMBL和日本的DDBJ。三個數(shù)據(jù)庫信息共享,每日交換,故資料是一樣的,唯格式有所不同。中國的DNA系統(tǒng)是最近10年間才發(fā)展起來的,DNA數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),有數(shù)據(jù)量大,增長量快,比對復(fù)雜等特點。GenBank是美國國家生物技術(shù)信息中心建立的DNA序列數(shù)據(jù)庫,從公共資源中獲取序列數(shù)據(jù),主要是科研人員直接提供或來源于大規(guī)模基因組測序計劃。為保證數(shù)據(jù)盡可能的完全,GenBank與EMBL、DDBJ建立了相互交換數(shù)據(jù)的合作關(guān)系。EMBL是歐洲生物信息學(xué)研究所(European Bioinformatics Institute, EBI)創(chuàng)建的一個核酸序列數(shù)據(jù)庫。EMBL的數(shù)據(jù)來源主要有兩部分,一部分由科研人員或某些基因組測序機構(gòu)通過計算機網(wǎng)絡(luò)直接提交,另一部分則來自科技文獻或?qū)@DBJ是DNA Data Bank of Japan的簡稱,始建于1986年,由日本國立遺傳學(xué)研究院負責數(shù)據(jù)庫的建設(shè),維護及數(shù)據(jù)的傳播,并與EMBL和GenBank合作;可以從世界各地通過網(wǎng)絡(luò)把序列直接提交該數(shù)據(jù)庫。DDBJ網(wǎng)頁上也提供了包括FastA和BLAST在內(nèi)的數(shù)據(jù)庫查詢工具。此外,較大型的數(shù)據(jù)庫還有日本的dbEST以及美國的GSDB,dbEST有自己的格式和識別代碼系統(tǒng),序列信息以及dbEST的注釋摘要,也按DNA的分類分成了若干子數(shù)據(jù)庫。GSDB由位于新墨西哥州Santa Fe的國家基因組資源中心創(chuàng)建。GSDB收集、管理并且發(fā)送完整的DNA序列及其相關(guān)信息,以滿足主要基因組測序機構(gòu)的需要。除了涵蓋從完整基因組到單個基因各個方面的綜合DNA序列數(shù)據(jù)庫,還有些更有針對性的基因組資源,或稱專用數(shù)據(jù)庫。它們主要的目的是為某一特定的物種提供一個更為完整的數(shù)據(jù)庫資源,如模式生酵母、 線蟲、果蠅、擬南芥、幽門螺桿菌等。

補充樓上,歐洲的EMBL 數(shù)據(jù)庫,是歐洲生物信息學(xué)研究所(European Bioinformatics Institute, EBI)創(chuàng)建的一個核酸序列數(shù)據(jù)庫。來源主要有兩部分,一部分由科研人員或某些基因組測序機構(gòu)通過計算機網(wǎng)絡(luò)直接提交,另一部分則來自科技文獻或?qū)@?Stoesser等, 1998)。EMBL與DDBJ、GenBank建有合作關(guān)系,他們分別在全世界范圍內(nèi)收集核酸序列信息,每天都將新發(fā)現(xiàn)或更新過的數(shù)據(jù)相互交換。

你好,目前,主要的DNA數(shù)據(jù)庫有3個。它們分別是美國的GenBank、歐洲的EMBL和日本的DDBJ。三個數(shù)據(jù)庫信息共享,每日交換。

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的目前主要的DNA数据库有哪些?的全部內(nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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