軟件不夠好，很吃內存

PacBio的單分子三代測序，該測序儀最大的特點就是測序長度比454更長，更加有利于基因組的拼接工作，有些較小的微生物可以直接將基因組測通成環狀。相對于二代測序，突破性的三代測序有如下優勢：1）單分子實時檢測，每條堿基鏈的數據都得到評估，更易發現稀有變異2）最低DNA樣品量僅500ng，無需PCR擴增，測序覆蓋深度不受序列中 GC含量差異影響。可以對 100%A+T區域測序3）除堿基序列信息外，可同時獲得動力學信息，因此可對諸如 DNA甲基化之類的堿基變化情況直接進行分析4）無與倫比的長序列讀長5）測序速度快，聚合酶反應速度（平均） 1 base/sec，從樣本制備到出結果，需時 1天6）靈活性極強，有一系列數據管理和分析軟件使二代三代測序流程實現無縫整合7）測序流程簡單

1.成本高，PacBio的試劑成本和測序成本比二代測序高了好幾倍；2. 通量低，一個cell好像只有幾百M，一個run能跑8個cell，比二代還是低了不少；3. 錯誤率高，不過現在試劑升級了，準確性提高不少，而且錯誤率這個問題多跑一些cycles也能解決。

一個SMRT就產生380m，通量偏低

總結

以上是生活随笔為你收集整理的PacBio相对于二代测序还有哪些劣势？的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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