ChIP技術(shù)很難反映轉(zhuǎn)錄因子在基因組中的所有DNA結(jié)合信息,相應(yīng)地難以顯示出所有靶基因信息。此外ChIP技術(shù)繪制的體內(nèi)DNA結(jié)合譜基本上沒(méi)有反映出轉(zhuǎn)錄因子對(duì)各DNA靶點(diǎn)結(jié)合的親和性信息,而轉(zhuǎn)錄因子與不同DNA結(jié)合靶點(diǎn)相互作用的特異性和親和性差異,可能形成轉(zhuǎn)錄因子對(duì)不同靶基因表達(dá)的精密微調(diào)。截止目前,借助ChIP技術(shù)鑒定的轉(zhuǎn)錄因子靶基因數(shù)量還比較有限,難以繪制出轉(zhuǎn)錄因子完整的靶基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。盡管基于ChIP的體內(nèi)結(jié)合譜研究技術(shù)還存在上述缺點(diǎn),但ChIP技術(shù)仍然是目前研究轉(zhuǎn)錄因子體內(nèi)結(jié)合靶點(diǎn)的難以替代的核心技術(shù),因此該技術(shù)在轉(zhuǎn)錄因子體內(nèi)結(jié)合譜的研究中仍將發(fā)揮重要作用。

總結(jié)

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