基于候选基因的关联分析有什么方面的作用?
生活随笔
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基于候选基因的关联分析有什么方面的作用?
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該方法是發(fā)現(xiàn)復雜性狀疾病易感基因最常用的方法。研究者通過查閱文獻或以往的知識積累發(fā)現(xiàn)某個代謝通路中的某個基因或某些基因與疾病的表型相關,然后收集確診的患者和匹配的對照作基于病例對照或基于家系背景的關聯(lián)分析,病例和對照數(shù)最好分別在200-300例以上。研究的基因數(shù)可以是1個(基于單個基因),10-20個(基于基因家族)或50個以上(基于代謝通路)。每個基因平均選5個SNPs,所以1個研究項目所選的SNP為5-250個,SNP的基因分型可根據(jù)不同情況選擇不同的方法。基于候選基因的關聯(lián)分析廣泛應用于復雜性狀疾病易感基因和與表型有關的易感基因的研究。例如:對糖尿病、高血壓、神經(jīng)精神類疾病(如精神分裂癥、阿爾茨海默病、智力低下和雙向情感障礙等)、哮喘、肥胖、自身免疫性疾病、肺癌和骨質疏松癥等復雜性狀疾病易感基因的研究,對青年人腦缺血、典型偏頭痛和驚恐等與表型有關的易感基因的研究。我們應用該策略開展了對強直性脊柱炎易感基因的研究,并得到了一些有意義的結果。
總結
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