GWAS方法篩選出足夠的基因靶點后可制成檢測用的芯片，用特定的多態性位點組合來確定RA亞型，從而可以在分子水平上對RA患者分型。此外，GWAS在對于RA的個性化醫療和生物靶向藥物研究中的作用也日益突出。

關于RA遺傳機制的研究越來越需要搜尋全基因組,以發現更多的易感基因及其多態性位點。為此可以借助非基于假設(hypothesis-free)的GWAS方法——在全基因組中篩查全部位點,用連鎖不平衡原理研究SNP與發病的關聯性;而不必預先了解這些SNP的編碼情況和功能。因此GWAS方法逐漸成為繪制RA易感基因圖譜的最有力、高效的手段。

總結

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