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PacBio RS有哪些应用呢?

發(fā)布時間:2023/11/24 万象百科 32 博士
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 PacBio RS有哪些应用呢? 小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.
PacBio RS有以下四點應用:1.甲基化分析 美國芝加哥大學利用第三代單分子SMRT測序技術(shù)和5-hmC的選擇性化學標記方法來高通量檢測5-hmC。通過聚合酶動力學帶來的寶貴信息,研究人員可直接檢測DNA甲基化,包括N6-甲基腺嘌呤、5-mC和5-hmC。2.病原微生物鑒定由于PacBio從樣本制備到獲得序列信息所需時間非常短(<1天),在具有時效性的病原微生物鑒定中(例如生物反恐、流行病爆發(fā)監(jiān)控等)也非常有優(yōu)勢。一個國際小組利用Pacific Biosciences的單分子測序技術(shù),深入研究了歐洲大腸桿菌菌株的致病性和進化起源,該研究成果發(fā)表在《新英格蘭醫(yī)學雜志》上。3.高GC含量區(qū)域測序美國加州大學戴維斯分校醫(yī)學院利用單分子實時測序技術(shù),對脆性X染色體綜合征的關(guān)鍵基因FMR1中的CGG三核苷酸重復區(qū)域進行了測序。4.稀有突變檢測PacBio無需擴增、對每一個單分子模板都進行評估,對于混合群體中低至 1/100的稀有突變都可以檢出。http://www.ebiotrade.com/newsf ... 1.htmhttp://www.ebiotrade.com/newsf ... 3.htmhttp://www.ebiotrade.com/newsf ... 1.htmhttp://www.ebiotrade.com/emgzf ... 5.pdf

PacBio的讀長可以達到10kb以上,因此對于較小的微生物基因組,可以直接測通了,都不用拼接;另外如果測轉(zhuǎn)錄組的話,可以獲得全長轉(zhuǎn)錄本測序,拼接上肯定要比二代測序更準確和方便。

總結(jié)

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