首先，贊你的用戶(hù)名。。。早起著名的短序列比對(duì)軟件，說(shuō)來(lái)很神奇，多數(shù)都是中國(guó)人寫(xiě)的，而且?guī)缀鹾腿A大人（華大人，不一定是華大）脫不了干系最早的SOAP，大家都知道的啦，華大為了炎黃寫(xiě)的，lirq+liyr組合。此外，組裝軟件SOAPdenovo也曾在熊貓基因組發(fā)布后風(fēng)靡一時(shí)<!-- 注釋掉的內(nèi)容請(qǐng)忽略 #### 2008年，年輕的李瑞強(qiáng)和李英睿——如今的兩個(gè)霸道總裁——一起開(kāi)發(fā)了享譽(yù)世界的事物——“肥皂” -->MAQ和后來(lái)的BWA，lh3佳作，引用率突破天際，好評(píng)率突破天際，都是liheng從bgi去了sanger后完成的Subread貌似也是中國(guó)人寫(xiě)的另外香港大學(xué)（其實(shí)也和華大人脫不了干系）計(jì)算機(jī)系在短序列比對(duì)和組裝軟件開(kāi)發(fā)上也是很厲害的，比如SOAP3（聽(tīng)名字也知道）以及組裝軟件IDBA什么的

是華人的強(qiáng)項(xiàng)，不一定是中國(guó)的強(qiáng)項(xiàng)。但是相對(duì)其它技術(shù)來(lái)說(shuō)，在特定領(lǐng)域的比較優(yōu)勢(shì)要大一些。和這個(gè)行業(yè)的人才來(lái)源有關(guān)，你看一下生物信息學(xué)的會(huì)，即使在北美，基本上你以為在中國(guó)開(kāi)。生物信息學(xué)的收入不如金融經(jīng)濟(jì)學(xué)科，其它族裔的這方面潛在人才不見(jiàn)得真正工作在這領(lǐng)域。我們國(guó)家制造業(yè)基礎(chǔ)薄弱，有時(shí)候conceptually能夠想到，但是實(shí)現(xiàn)起來(lái)困難；所以相對(duì)在對(duì)實(shí)現(xiàn)平臺(tái)要求不高，理論性較強(qiáng)的領(lǐng)域就更容易出彩。優(yōu)秀的生物信息軟件是用項(xiàng)目和數(shù)據(jù)喂出來(lái)的。在數(shù)據(jù)產(chǎn)出上，中國(guó)的基因組學(xué)和國(guó)外的差距相對(duì)大部分領(lǐng)域要小，增加了影響力。

K2說(shuō)的沒(méi)錯(cuò)alignment和variant calling啥的，華大人貢獻(xiàn)很大，中國(guó)牛X的人很多。但是有個(gè)前提是，“生物信息軟件”的范圍太廣太廣了：基因組，蛋白組，生物物理，3D模擬，藥物反應(yīng) 。。。 我們其實(shí)就這個(gè)范圍來(lái)討論的話，中國(guó)不能說(shuō)是世界領(lǐng)先的。十分同意@liyr 的觀點(diǎn)，很多軟件是項(xiàng)目和數(shù)據(jù)喂出來(lái)的，華大人參與和提供了了很多測(cè)序的項(xiàng)目和工作，才有了很多著名的分析軟件和牛逼的人。所以中國(guó)在生物信息上應(yīng)該會(huì)繼續(xù)人才輩出的，因?yàn)楦杏X(jué)不論是政府還是國(guó)內(nèi)的研發(fā)環(huán)境真的是越來(lái)越好了，基本世界領(lǐng)先水平了，才會(huì)出現(xiàn)更多世界級(jí)的生物信息軟件。

同意liyr的觀點(diǎn)，多帶帶看生物信息軟件和工具開(kāi)發(fā)華人是很強(qiáng)，但確實(shí)不是中國(guó)強(qiáng)：１，從數(shù)據(jù)來(lái)源的測(cè)序儀產(chǎn)業(yè)，我們只能買(mǎi)，原初的技術(shù)還很不成熟；２，從軟件的計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)，操作系統(tǒng)、編程語(yǔ)言、開(kāi)發(fā)工具等，我們都是追國(guó)外成熟的技術(shù)，自主研發(fā)并引領(lǐng)世界技術(shù)前沿的基礎(chǔ)技術(shù)很少，大多數(shù)的成功的華人開(kāi)發(fā)的應(yīng)用軟件也是在國(guó)外的環(huán)境中才推廣開(kāi)的；３，從軟件的服務(wù)對(duì)象，藥物研發(fā)、生物基礎(chǔ)研究等與國(guó)際上有很大差距。中國(guó)的基因分子檢測(cè)能為老百姓服務(wù)，但由于醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)和基礎(chǔ)研究的薄弱，又能多大程度給他們帶來(lái)實(shí)質(zhì)性的好處呢？從數(shù)據(jù)輸入到分析結(jié)果輸出，從基礎(chǔ)到上層，我們的生物信息軟件開(kāi)發(fā)是懸在中間的一枝獨(dú)秀，這是華人的驕傲；但這樣為別人做嫁衣裳，也是中國(guó)的悲哀。

多了去了，bsmap的作者也算華大系吧

@elemenTY @liyr 等人都有很大的貢獻(xiàn)啊，ggbio和SOAP系列

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的生物信息分析的软件开发是中国的强项吗？过去有哪些牛X的软件和开发者吗？的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

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