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生物信息分析的软件开发是中国的强项吗?过去有哪些牛X的软件和开发者吗?

發布時間:2023/11/24 万象百科 31 博士
生活随笔 收集整理的這篇文章主要介紹了 生物信息分析的软件开发是中国的强项吗?过去有哪些牛X的软件和开发者吗? 小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
首先,贊你的用戶名。。。早起著名的短序列比對軟件,說來很神奇,多數都是中國人寫的,而且幾乎和華大人(華大人,不一定是華大)脫不了干系最早的SOAP,大家都知道的啦,華大為了炎黃寫的,lirq+liyr組合。此外,組裝軟件SOAPdenovo也曾在熊貓基因組發布后風靡一時<!-- 注釋掉的內容請忽略 #### 2008年,年輕的李瑞強和李英睿——如今的兩個霸道總裁——一起開發了享譽世界的事物——“肥皂” -->MAQ和后來的BWA,lh3佳作,引用率突破天際,好評率突破天際,都是liheng從bgi去了sanger后完成的Subread貌似也是中國人寫的另外香港大學(其實也和華大人脫不了干系)計算機系在短序列比對和組裝軟件開發上也是很厲害的,比如SOAP3(聽名字也知道)以及組裝軟件IDBA什么的

是華人的強項,不一定是中國的強項。但是相對其它技術來說,在特定領域的比較優勢要大一些。和這個行業的人才來源有關,你看一下生物信息學的會,即使在北美,基本上你以為在中國開。生物信息學的收入不如金融經濟學科,其它族裔的這方面潛在人才不見得真正工作在這領域。我們國家制造業基礎薄弱,有時候conceptually能夠想到,但是實現起來困難;所以相對在對實現平臺要求不高,理論性較強的領域就更容易出彩。優秀的生物信息軟件是用項目和數據喂出來的。在數據產出上,中國的基因組學和國外的差距相對大部分領域要小,增加了影響力。

K2說的沒錯alignment和variant calling啥的,華大人貢獻很大,中國牛X的人很多。但是有個前提是,“生物信息軟件”的范圍太廣太廣了:基因組,蛋白組,生物物理,3D模擬,藥物反應 。。。 我們其實就這個范圍來討論的話,中國不能說是世界領先的。十分同意@liyr 的觀點,很多軟件是項目和數據喂出來的,華大人參與和提供了了很多測序的項目和工作,才有了很多著名的分析軟件和牛逼的人。所以中國在生物信息上應該會繼續人才輩出的,因為感覺不論是政府還是國內的研發環境真的是越來越好了,基本世界領先水平了,才會出現更多世界級的生物信息軟件。

同意liyr的觀點,多帶帶看生物信息軟件和工具開發華人是很強,但確實不是中國強:1,從數據來源的測序儀產業,我們只能買,原初的技術還很不成熟;2,從軟件的計算機基礎,操作系統、編程語言、開發工具等,我們都是追國外成熟的技術,自主研發并引領世界技術前沿的基礎技術很少,大多數的成功的華人開發的應用軟件也是在國外的環境中才推廣開的;3,從軟件的服務對象,藥物研發、生物基礎研究等與國際上有很大差距。中國的基因分子檢測能為老百姓服務,但由于醫藥產業和基礎研究的薄弱,又能多大程度給他們帶來實質性的好處呢?從數據輸入到分析結果輸出,從基礎到上層,我們的生物信息軟件開發是懸在中間的一枝獨秀,這是華人的驕傲;但這樣為別人做嫁衣裳,也是中國的悲哀。

多了去了,bsmap的作者也算華大系吧

@elemenTY @liyr 等人都有很大的貢獻啊,ggbio和SOAP系列

總結

以上是生活随笔為你收集整理的生物信息分析的软件开发是中国的强项吗?过去有哪些牛X的软件和开发者吗?的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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