卫星DNA怎么分类?
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卫星DNA怎么分类?
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衛(wèi)星DNA可以分為三類:①大衛(wèi)星DNA(macro-satellite)也稱經(jīng)典衛(wèi)星DNA,是在CsCl密度梯度離心時(shí)發(fā)現(xiàn)的。將基因組DNA打斷成為約104堿基對(duì)大小的片段,加入到CsCl溶液進(jìn)行超速離心形成密度梯度,原核生物DNA可顯示一條寬帶,而真核生物DNA除形成同樣的主要寬帶外,還出現(xiàn)其他條帶,這些條帶中的DNA稱為衛(wèi)星DNA。②小衛(wèi)星DNA是由中等大小的串聯(lián)重復(fù)順序構(gòu)成,分布在所有染色體,又可以分為高度可變的小衛(wèi)星DNA和端粒DNA。前者重復(fù)單位約9-24bp,重復(fù)次數(shù)變化很大,呈高度多態(tài)性。其核心序列是GGGCAGGAXG,可能與DNA的同源重組有關(guān)。③微衛(wèi)星DNA(micro-satellite)是一類更簡(jiǎn)單的寡核苷酸串聯(lián)重復(fù)序列,其重復(fù)單位為1-5bp,重復(fù)次數(shù)10-60次左右,其總長(zhǎng)度通常小于150bp,分布在所有的染色體。常見的是以(AC)n和(TG)n的二聚核苷酸為重復(fù)單位,存在于內(nèi)含子、間隔DNA中,也可以存在于編碼區(qū),編碼區(qū)的重復(fù)順序均為3個(gè)堿基組成的重復(fù)單位,如人雄激素受體基因內(nèi)的(AGC)n。
衛(wèi)星DNA也可以按其浮力密度的大小可以分成I、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四類,其浮力密度分別是1.687、1.693、1.697和1.700g/cm3。衛(wèi)星DNA還有另一些分類的名稱,如α衛(wèi)星DNA是靈長(zhǎng)類特有的單元為171bp的高度重復(fù)序列,最初是在非洲青猴基因組中發(fā)現(xiàn),已經(jīng)確定分布在人染色體的著絲粒區(qū)。β衛(wèi)星DNA家族是單元為68bp的串聯(lián)重復(fù)序列,富含GC。γ衛(wèi)星DNA是220bp的串聯(lián)重復(fù)。
衛(wèi)星DNA也可以按其浮力密度的大小可以分成I、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四類,其浮力密度分別是1.687、1.693、1.697和1.700g/cm3。衛(wèi)星DNA還有另一些分類的名稱,如α衛(wèi)星DNA是靈長(zhǎng)類特有的單元為171bp的高度重復(fù)序列,最初是在非洲青猴基因組中發(fā)現(xiàn),已經(jīng)確定分布在人染色體的著絲粒區(qū)。β衛(wèi)星DNA家族是單元為68bp的串聯(lián)重復(fù)序列,富含GC。γ衛(wèi)星DNA是220bp的串聯(lián)重復(fù)。
總結(jié)
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